LXL04_000644 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_000644

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 11750360-11754589 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2115 bp · LXL04_000644|LXL04_000644|OH1004|cDNA

ATGGGAACTGGTTCATCAATTAACCTTGATACCAGCGACGATCACGCCGGTGGTCAACTCTATGTGTCTCTCAAGCTGGAGAGTTACACTCCCAAAGGAGACCTTGTTCCTCACCTCTACGGTTCTGTCCCTCTCGTCGGCTCTTGGGACCCTTCCAAAGCTCTTCCGATGGAGCGAGAGTCATCTTCAACGTGGCAGTTAAGCTTTGTTTCATCTCCTAATCATGACACATTAGACTTCAAGTTCTTACTAAAGTCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2115 bp · LXL04_000644|LXL04_000644|OH1004|CDS

ATGGGAACTGGTTCATCAATTAACCTTGATACCAGCGACGATCACGCCGGTGGTCAACTCTATGTGTCTCTCAAGCTGGAGAGTTACACTCCCAAAGGAGACCTTGTTCCTCACCTCTACGGTTCTGTCCCTCTCGTCGGCTCTTGGGACCCTTCCAAAGCTCTTCCGATGGAGCGAGAGTCATCTTCAACGTGGCAGTTAAGCTTTGTTTCATCTCCTAATCATGACACATTAGACTTCAAGTTCTTACTAAAGTCAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

704 aa · LXL04_000644|LXL04_000644|OH1004|PROTEIN

MGTGSSINLDTSDDHAGGQLYVSLKLESYTPKGDLVPHLYGSVPLVGSWDPSKALPMERESSSTWQLSFVSSPNHDTLDFKFLLKSKDTNEQCIVEEGPTRQFTGGTLQGVTRLALFRLTTDEVLEYKVSIKADRVSPFDLAASWRAYQQNLEPSTVRGIPDVSINALPQDSENGMSSSLDLDLEQYVVPTPSTPVVYAANLTENPRSLNNIYNHPPPTIKEKEIGSKVYGMVESKSVGTFSPIEKEGGFVDRGVGSSRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_000644`
TK1151 ID	TkA01G597950
OH-1004 ID	LXL04_000644
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_000644

位置 Chr01:11750360-11754589 (+)

描述 Similar to FKFBP: 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g07110`	果糖2,6-二磷酸的合成与降解。	Structure and heterologous expression of a gene encoding fructose-6-phosphate,2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase from Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1016/s0167-4781(00)00134-2 Phosphorylation and 14-3-3 binding of Arabidopsis 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2003.01992.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000644 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006000 fructose metabolic process 生物过程

GO:0006002 fructose 6-phosphate metabolic process 生物过程

GO:0006003 fructose 2,6-bisphosphate metabolic process 生物过程

GO:0006007 glucose catabolic process 生物过程

GO:0006094 gluconeogenesis 生物过程

GO:0006096 glycolytic process 生物过程

GO:0009749 response to glucose 生物过程

GO:0019249 lactate biosynthetic process 生物过程

GO:0032868 response to insulin 生物过程

GO:0033762 response to glucagon 生物过程

GO:0042594 response to starvation 生物过程

GO:0042866 pyruvate biosynthetic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G07110

hsa:5207

mmu:18639

rno:24638

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.363

排名 1 · LXL04_000644 · OH-1004

细胞核0.295

排名 2 · LXL04_000644 · OH-1004

细胞膜0.212

排名 3 · LXL04_000644 · OH-1004

质体0.125

排名 4 · LXL04_000644 · OH-1004

高尔基体0.098

排名 5 · LXL04_000644 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00686.26CBM_2024-105 aa

PF01591.256PF2K294-510 aa

PF13671.13AAA_33305-436 aa

PF00300.28His_Phos_1513-695 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_000644	`PF00686.26`	CBM_20	24	105	4e-07	30.4
LXL04_000644	`PF01591.25`	6PF2K	294	510	6.9e-82	274.8
LXL04_000644	`PF13671.13`	AAA_33	305	436	2e-06	28.9
LXL04_000644	`PF00300.28`	His_Phos_1	513	695	7.3e-38	130.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9MB58`	拟南芥	6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase	72.752%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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