基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_000481
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 8685328-8692506
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA5103 bp · LXL04_000481|LXL04_000481|OH1004|cDNA
ATGGCGAACAAGCTAATAAGCGAAATGGGACTGCCGAAATCGATTGGGCACATATTCGCTGCTCGCAATATCATTACCGCCAAGGATGCTTTATCATTGACTGAATTTGAGTTGATGGAACTGTTAGATGTGAGTCTTCCCCAAGTCACATTAGCAGTAGCTCTCATTAGTGAGATTGCTTCTCCTCCATATCAAACAGTGAGATCCATGTTGGAACATCGCATGCAAAATGAGTACCTGACAGGTCATCTTCCAACACA...
CDS
下载 CDS FASTA5103 bp · LXL04_000481|LXL04_000481|OH1004|CDS
ATGGCGAACAAGCTAATAAGCGAAATGGGACTGCCGAAATCGATTGGGCACATATTCGCTGCTCGCAATATCATTACCGCCAAGGATGCTTTATCATTGACTGAATTTGAGTTGATGGAACTGTTAGATGTGAGTCTTCCCCAAGTCACATTAGCAGTAGCTCTCATTAGTGAGATTGCTTCTCCTCCATATCAAACAGTGAGATCCATGTTGGAACATCGCATGCAAAATGAGTACCTGACAGGTCATCTTCCAACACA...
1700 aa · LXL04_000481|LXL04_000481|OH1004|PROTEIN
MANKLISEMGLPKSIGHIFAARNIITAKDALSLTEFELMELLDVSLPQVTLAVALISEIASPPYQTVRSMLEHRMQNEYLTGHLPTHLKGLDAALCGGIPFGGLTELVGPAGIGKTQFCLKIALLATLPSCYGGLDGHVIYIDVESKFSSRRLIEIGINSFPDIFRLDGMAKEMAGRITVLRPGSLSEFTESLQKIKVSLIQHQVKLLVVDSMAALVSGSLAEFSRIPVVMTNQVRSRSATEISQYSFQDNRADATTDDS...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_000481 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_000481 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:8685328-8692506 (-) |
| 描述 | Similar to RPPL1: Putative disease resistance RPP13-like protein 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000724 double-strand break repair via homologous recombination 生物过程 GO:0006281 DNA repair 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0051607 defense response to virus 生物过程 GO:0098542 defense response to other organism 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005657 replication fork 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0033063 Rad51B-Rad51C-Rad51D-XRCC2 complex 细胞组分 GO:0000150 DNA strand exchange activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G28560 ath:AT3G14460 ath:AT3G14470 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.377
细胞核0.324
细胞膜0.281
内质网0.074
质体0.073
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF26169.1HHH_XRCC3_RpoA6-59 aaPF08423.18Rad5186-316 aaPF13481.13AAA_2597-219 aaPF18052.7Rx_N393-481 aaPF00931.29NB-ARC567-736 aaPF23559.2WHD_DRP822-890 aaPF23598.2LRR_14964-1317 aaPF13855.13LRR_8973-1029 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_000481 | PF26169.1 | HHH_XRCC3_RpoA | 6 | 59 | 8.3e-19 | 67.9 |
| LXL04_000481 | PF08423.18 | Rad51 | 86 | 316 | 2.4e-20 | 73.6 |
| LXL04_000481 | PF13481.13 | AAA_25 | 97 | 219 | 2.1e-06 | 28.2 |
| LXL04_000481 | PF18052.7 | Rx_N | 393 | 481 | 5.8e-17 | 62.3 |
| LXL04_000481 | PF00931.29 | NB-ARC | 567 | 736 | 3.4e-37 | 128.4 |
| LXL04_000481 | PF23559.2 | WHD_DRP | 822 | 890 | 2.9e-25 | 88.8 |
| LXL04_000481 | PF23598.2 | LRR_14 | 964 | 1317 | 3.9e-36 | 125.2 |
| LXL04_000481 | PF13855.13 | LRR_8 | 973 | 1029 | 5.7e-09 | 36.3 |
| LXL04_000481 | PF25019.1 | LRR_R13L1-DRL21 | 1083 | 1210 | 4.1e-48 | 163.2 |
| LXL04_000481 | PF23598.2 | LRR_14 | 1425 | 1540 | 3.9e-36 | 125.2 |
| LXL04_000481 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 1506 | 1547 | 4.6e-15 | 56.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。