文献定位 · F1 家系

天然橡胶含量 QTL

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6 QTL2 连锁群127 F1Yang et al., 2023
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物理位置概览 · 3 QTL

qHRC-C6-1ChrA6qHRC-C6-1 · 24318536–24322915 bp24.32 MbqHRC-C6-2ChrA6qHRC-C6-2 · 26486808–26487892 bp26.49 MbqHRC-C6-3ChrA6qHRC-C6-3 · 46000628–46002048 bp46.00 Mb 020406080100物理位置(Mb) qHRC-C6-1ChrA624.32 MbqHRC-C6-2ChrA626.49 MbqHRC-C6-3ChrA646.00 Mb 0255075100物理位置(Mb)

圆点为关联 bin 标记位置,可点击查看单个位点。0–100 Mb 是统一显示窗口,不表示染色体全长。

QTL染色体标记区间(bp)遗传位置(cM)LODPVE (%)
qHRC-C6-1ChrA624,318,536–24,322,9152.3776.2724.45
qHRC-C6-2ChrA626,486,808–26,487,8922.3756.1723.82
qHRC-C6-3ChrA646,000,628–46,002,0482340.095.1117.35
LOD 支持度图
所选 QTL 的 LOD 支持度

虚线为原研究的 LOD 4.0 阈值。

数据来源与使用说明

Yang Y, et al. (2023). BMC Genomics 24:13. DOI: 10.1186/s12864-022-09105-3

定位:原论文表 3;区域基因:补表 S4;表型:补表 S7。来源单元格随 TSV 下载提供。原始参考基因组:GWHBCHF00000000。

  • 标记区间不是 QTL 置信区间,尚未转换至网站其他参考版本。原始区域基因 ID 不自动等同于当前模型,PVE/LOD 沿用原文,未重算 GWAS。
  • 两个主要 ChrA6 QTL 的表格 PVE 为 24.45% 和 23.82%(相加 48.27%),摘要写为 65.62%;加和值不是独立估计的联合 PVE。
  • 表型中 R01 为 2.92%,正文亲本 166 为 2.09%,原值均保留;论文与公共库材料编号的对应仍待确认。

CRA009020 · GVM000440 · 原论文定位表