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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 26 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G088690
Chr01:22567607-22567921 (-)
GWHBCHF00000002
LXL04_039287
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
58.500
查询 50.962 / 对象 0.660
TkA01G088690
TkA01G143730
Chr01:36444487-36444801 (-)
GWHBCHF00000002
LXL04_039287
Chr09:64603647-64632339 (-)
CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
56.600
查询 50.962 / 对象 0.660
TkA01G143730
TkA01G500800
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LXL04_039287
Chr09:64603647-64632339 (-)
CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
45.300
查询 28.763 / 对象 1.071
TkA01G500800
TkA02G079530
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LXL04_039287
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
60.800
查询 49.038 / 对象 0.635
TkA02G079530
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
62.500
查询 41.481 / 对象 0.697
TkA02G110830
TkA02G324510
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
72.500
查询 61.179 / 对象 6.575
TkA02G324510
TkA02G534990
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
57.300
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TkA02G534990
TkA02G600180
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
57.400
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TkA02G600180
TkA02G616850
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
56.900
查询 85.335 / 对象 6.612
TkA02G616850
TkA03G384630
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
45.300
查询 24.571 / 对象 1.071
TkA03G384630
TkA03G486250
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
62.900
查询 97.239 / 对象 4.383
TkA03G486250
TkA04G085120
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
61.800
查询 58.333 / 对象 2.079
TkA04G085120
TkA04G369150
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
60.400
查询 50.962 / 对象 0.660
TkA04G369150
TkA04G517930
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LXL04_039287
Chr09:64603647-64632339 (-)
CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
65.100
查询 67.291 / 对象 4.582
JCVI_TKOH_00210 TkA04G517930
TkA04G517950
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Chr09:64603647-64632339 (-)
CM104807.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
49.000
查询 99.918 / 对象 25.115
JCVI_TKOH_00210 TkA04G517950
TkA04G518040
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
83.900
查询 95.541 / 对象 11.593
JCVI_TKOH_00210 TkA04G518040
TkA04G518060
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
61.600
查询 94.718 / 对象 14.407
JCVI_TKOH_00210 TkA04G518060
TkA05G320300
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
57.400
查询 51.429 / 对象 0.672
TkA05G320300
TkA05G422940
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
45.900
查询 96.673 / 对象 17.868
TkA05G422940
TkA05G425130
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GWHBCHF00000006
LXL04_039287
Chr09:64603647-64632339 (-)
CM104807.1
一对多 multi candidate from TK1151
复杂
68.300
查询 96.804 / 对象 5.753
TkA05G425130
TkA06G030660
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LXL04_039287
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
61.400
查询 79.423 / 对象 11.244
TkA06G030660
TkA07G115690
Chr07:30039247-30039930 (+)
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
51.900
查询 98.068 / 对象 2.353
TkA07G115690
TkA07G269560
Chr07:67364971-67366855 (-)
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
54.800
查询 80.964 / 对象 4.358
TkA07G269560
TkA07G337340
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GWHBCHF00000008
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
42.000
查询 99.796 / 对象 26.684
TkA07G337340
TkA08G158950
Chr08:41367232-41367858 (-)
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
57.300
查询 42.788 / 对象 1.021
TkA08G158950
TkAUNG089190
ChrUn:25308219-25311617 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_039287
Chr09:64603647-64632339 (-)
CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
44.700
查询 98.720 / 对象 13.921
TkAUNG089190
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