ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID，列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料，不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换；复杂映射需按类别和证据复核。

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版本	组装/注释 accession	来源数据库	论文	DOI / PMID	下载日期
TK1151 Taraxacum kok-saghyz	GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein	NGDC Genome Warehouse (GWH)	Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022	10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160	2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz	GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF	NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly	NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文（截至 2026-08-17）未发现	未发现	2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集：TK1151；45224 个基因；当前筛选 24 条。当前显示第 1 / 1 页。

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示例 TkA01G624900 LXL04_000258

全部严格 1:1: 6347 较可信 1:1: 1703 一对多: 826 多对一: 24458 未映射: 2782 注释冲突: 9108

严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性；较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算；查询侧为 TK1151，对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。

TK1151 基因 ID	OH-1004 基因 ID	类别	关系 / 置信度	相似度 / 覆盖度	说明
TkA01G042050 Chr01:10797311-10798493 (+) GWHBCHF00000002	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	74.500 查询 83.824 / 对象 26.702	TkA01G042050
TkA01G327840 Chr01:81534324-81534827 (+) GWHBCHF00000002	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	86.000 查询 96.154 / 对象 20.027	TkA01G327840
TkA02G261580 Chr02:66791946-66792760 (+) GWHBCHF00000003	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	70.000 查询 100.000 / 对象 40.988	TkA02G261580
TkA02G282630 Chr02:72111764-72112843 (-) GWHBCHF00000003	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	41.000 查询 73.765 / 对象 31.375	TkA02G282630
TkA02G428650 Chr02:108887809-108888648 (-) GWHBCHF00000003	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	82.800 查询 48.029 / 对象 17.891	TkA02G428650
TkA02G587890 Chr02:151718312-151719004 (-) GWHBCHF00000003	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	91.300 查询 100.000 / 对象 30.708	TkA02G587890
TkA03G105790 Chr03:27092180-27092869 (+) GWHBCHF00000004	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	37.000 查询 97.380 / 对象 29.773	TkA03G105790
TkA03G281510 Chr03:69467759-69472558 (+) GWHBCHF00000004	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	85.200 查询 100.000 / 对象 30.708	TkA03G281510
TkA03G520920 Chr03:130701569-130703547 (+) GWHBCHF00000004	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	58.000 查询 71.223 / 对象 39.386	TkA03G520920
TkA04G444830 Chr04:112130773-112133149 (+) GWHBCHF00000005	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	33.500 查询 42.963 / 对象 24.299	TkA04G444830
TkA05G377470 Chr05:93740561-93742432 (+) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	81.700 查询 39.735 / 对象 8.011	TkA05G377470
TkA05G382900 Chr05:95137613-95138317 (+) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	74.600 查询 97.758 / 对象 30.441	TkA05G382900
TkA05G394950 Chr05:98158841-98159524 (-) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	48.100 查询 62.927 / 对象 20.694	TkA05G394950
TkA05G453370 Chr05:113477932-113478354 (+) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	33.000 查询 64.286 / 对象 12.951	TkA05G453370
TkA05G460370 Chr05:115285863-115287248 (-) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	62.500 查询 67.830 / 对象 44.059	TkA05G460370
TkA05G468560 Chr05:117368396-117370229 (+) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	80.000 查询 42.857 / 对象 8.011	TkA05G468560
TkA05G475010 Chr05:119225651-119226619 (-) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	65.900 查询 76.950 / 对象 34.446	TkA05G475010
TkA05G475150 Chr05:119263041-119264080 (-) GWHBCHF00000006	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	79.100 查询 70.270 / 对象 31.375	TkA05G475150
TkA06G466040 Chr06:115312239-115312610 (-) GWHBCHF00000007	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	注释冲突	序列支持，但注释或基因模型存在冲突需复核	95.100 查询 100.000 / 对象 16.422	TkA06G466040
TkA07G082690 Chr07:21613987-21615355 (-) GWHBCHF00000008	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	68.200 查询 70.124 / 对象 22.697	TkA07G082690
TkA08G008140 Chr08:2014551-2015309 (-) GWHBCHF00000009	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	84.100 查询 100.000 / 对象 21.896	TkA08G008140
TkA08G243710 Chr08:63676484-63677716 (-) GWHBCHF00000009	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	71.000 查询 48.358 / 对象 21.495	TkA08G243710
TkA08G287020 Chr08:74508567-74509705 (+) GWHBCHF00000009	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	注释冲突	双向最佳命中，但覆盖度或共线性未达高可信阈值需复核	70.000 查询 100.000 / 对象 43.258	TkA08G287020
TkAUNG055350 ChrUn:15771504-15772049 (+) GWHBCHF00000001	LXL04_026614 Chr05:129661428-129667365 (-) CM104803.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	100.000 查询 19.337 / 对象 4.673	TkAUNG055350

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