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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 11 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G109360
Chr01:27760496-27764472 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
62.300
查询 100.000 / 对象 16.770
TkA01G109360
TkA01G197660
Chr01:50383717-50393645 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
65.300
查询 100.000 / 对象 32.431
TkA01G197660
TkA01G206730
Chr01:52631837-52638974 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
47.300
查询 100.000 / 对象 16.238
TkA01G206730
TkA01G380590
Chr01:95063358-95064303 (-)
GWHBCHF00000002
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
44.800
查询 90.698 / 对象 11.979
TkA01G380590
TkA01G482750
Chr01:120859777-120862030 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
53.200
查询 36.719 / 对象 6.256
TkA01G482750
TkA02G247570
Chr02:63565541-63567937 (-)
GWHBCHF00000003
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
43.800
查询 99.158 / 对象 30.257
TkA02G247570
TkA03G568580
Chr03:144220760-144231901 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.700
查询 98.589 / 对象 27.906
JCVI_TKOH_00147 TkA03G568580
TkA04G352740
Chr04:88975774-88985907 (-)
GWHBCHF00000005
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
69.300
查询 100.000 / 对象 23.558
TkA04G352740
TkA07G134040
Chr07:34795699-34796496 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
52.800
查询 74.820 / 对象 4.703
TkA07G134040
TkA08G109790
Chr08:28549918-28552659 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
55.100
查询 97.059 / 对象 27.728
TkA08G109790
TkAUNG093850
ChrUn:26557922-26567413 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_011141
Chr02:158886968-158899320 (+)
CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.800
查询 98.738 / 对象 27.950
TkAUNG093850
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