本页使用教程

ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 21 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G218930
Chr01:55772539-55774949 (-)
GWHBCHF00000002
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
43.200
查询 99.415 / 对象 61.980
TkA01G218930
TkA01G333690
Chr01:82912427-82914533 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
89.200
查询 92.751 / 对象 47.723
TkA01G333690
TkA02G122710
Chr02:31827496-31829742 (-)
GWHBCHF00000003
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
70.400
查询 100.000 / 对象 52.178
TkA02G122710
TkA02G157150
Chr02:40290431-40292041 (-)
GWHBCHF00000003
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
48.200
查询 99.469 / 对象 41.089
TkA02G157150
TkA02G524980
Chr02:135362034-135366697 (-)
GWHBCHF00000003
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
76.100
查询 100.000 / 对象 100.000
TkA02G524980
TkA03G116070
Chr03:29701189-29703201 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
55.300
查询 95.910 / 对象 46.733
TkA03G116070
TkA03G204500
Chr03:51362858-51365208 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
52.000
查询 99.656 / 对象 56.832
TkA03G204500
TkA03G414280
Chr03:103016982-103027066 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
76.200
查询 100.000 / 对象 100.000
TkA03G414280
TkA03G429680
Chr03:106888219-106889638 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
58.800
查询 69.721 / 对象 17.525
TkA03G429680
TkA03G500130
Chr03:125587090-125587942 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
98.000
查询 91.071 / 对象 15.149
TkA03G500130
TkA05G302770
Chr05:74688199-74690227 (-)
GWHBCHF00000006
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
46.800
查询 92.791 / 对象 46.931
TkA05G302770
TkA05G311690
Chr05:76907335-76909703 (+)
GWHBCHF00000006
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
68.000
查询 97.475 / 对象 56.040
TkA05G311690
TkA06G255190
Chr06:65118095-65120539 (-)
GWHBCHF00000007
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
94.600
查询 99.408 / 对象 16.634
TkA06G255190
TkA06G451160
Chr06:111447875-111449234 (+)
GWHBCHF00000007
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
48.800
查询 99.615 / 对象 33.069
TkA06G451160
TkA07G070660
Chr07:18494629-18503716 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
75.300
查询 100.000 / 对象 100.000
TkA07G070660
TkA07G214140
Chr07:53810138-53812486 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
66.000
查询 94.634 / 对象 56.238
TkA07G214140
TkA07G220600
Chr07:55334647-55338606 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
40.400
查询 86.825 / 对象 50.297
TkA07G220600
TkA07G422450
Chr07:106758214-106761685 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
41.700
查询 98.168 / 对象 50.396
TkA07G422450
TkA08G292840
Chr08:75898502-75901347 (-)
GWHBCHF00000009
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
74.900
查询 91.636 / 对象 56.337
TkA08G292840
TkA08G388670
Chr08:99145344-99150368 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
37.800
查询 100.000 / 对象 47.327
TkA08G388670
TkAUNG014720
ChrUn:3811424-3812342 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_027255
Chr06:11941668-11953873 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
91.400
查询 91.146 / 对象 17.327
TkAUNG014720
1 / 1