ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 30 条。当前显示第 1 / 1 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G536390
Chr01:134562694-134566203 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
90.800 查询 55.393 / 对象 23.717 |
TkA01G536390 | |
|
TkA02G029450
Chr02:7124182-7126373 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
85.400 查询 76.540 / 对象 21.773 |
TkA02G029450 | |
|
TkA02G055510
Chr02:14478774-14480850 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
89.300 查询 74.138 / 对象 16.719 |
TkA02G055510 | |
|
TkA02G066250
Chr02:17171991-17176163 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
79.200 查询 100.000 / 对象 97.278 |
TkA02G066250 | |
|
TkA02G289040
Chr02:73855076-73858260 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
67.300 查询 97.077 / 对象 55.910 |
TkA02G289040 | |
|
TkA02G343140
Chr02:87158557-87163455 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
65.600 查询 48.460 / 对象 44.246 |
TkA02G343140 | |
|
TkA02G373840
Chr02:95175409-95178927 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
79.000 查询 58.333 / 对象 18.118 |
TkA02G373840 | |
|
TkA02G450680
Chr02:114642416-114646948 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
65.900 查询 73.785 / 对象 54.432 |
TkA02G450680 | |
|
TkA02G614000
Chr02:158303181-158307816 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
87.100 查询 60.745 / 对象 35.148 |
TkA02G614000 | |
|
TkA03G091040
Chr03:23176161-23181241 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
61.800 查询 89.423 / 对象 53.577 |
TkA03G091040 | |
|
TkA03G442160
Chr03:110187570-110191705 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
91.100 查询 64.824 / 对象 20.062 |
TkA03G442160 | |
|
TkA04G026200
Chr04:6865227-6866815 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
86.800 查询 73.077 / 对象 5.910 |
TkA04G026200 | |
|
TkA04G170100
Chr04:43949082-43954526 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
72.400 查询 87.531 / 对象 55.832 |
TkA04G170100 | |
|
TkA04G271800
Chr04:68665339-68674067 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
55.500 查询 71.823 / 对象 93.857 |
TkA04G271800 | |
|
TkA04G365560
Chr04:91882581-91883735 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
53.500 查询 64.141 / 对象 9.798 |
TkA04G365560 | |
|
TkA04G385010
Chr04:96847687-96852651 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
84.600 查询 68.774 / 对象 38.258 |
TkA04G385010 | |
|
TkA04G434130
Chr04:109468974-109473677 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
58.800 查询 66.822 / 对象 29.627 |
TkA04G434130 | |
|
TkA04G440310
Chr04:111055710-111058784 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
93.100 查询 53.719 / 对象 10.109 |
TkA04G440310 | |
|
TkA05G136790
Chr05:35676693-35680678 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
81.700 查询 35.546 / 对象 13.919 |
TkA05G136790 | |
|
TkA05G294840
Chr05:72774246-72780093 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
57.800 查询 85.189 / 对象 69.440 |
TkA05G294840 | |
|
TkA06G168860
Chr06:44410689-44415447 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
93.000 查询 45.714 / 对象 9.953 |
TkA06G168860 | |
|
TkA06G202450
Chr06:52587775-52592571 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
90.000 查询 65.396 / 对象 31.337 |
TkA06G202450 | |
|
TkA06G406830
Chr06:100784337-100786371 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
61.900 查询 58.596 / 对象 19.596 |
TkA06G406830 | |
|
TkA07G035450
Chr07:9431836-9436633 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
65.000 查询 69.109 / 对象 40.047 |
TkA07G035450 | |
|
TkA07G185620
Chr07:47273813-47277107 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
85.200 查询 55.316 / 对象 33.437 |
TkA07G185620 | |
|
TkA07G269610
Chr07:67385745-67388942 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
49.700 查询 77.174 / 对象 53.810 |
TkA07G269610 | |
|
TkA07G293960
Chr07:73690816-73693528 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
65.900 查询 100.000 / 对象 31.104 |
TkA07G293960 | |
|
TkA07G397410
Chr07:99841561-99846289 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
78.000 查询 99.918 / 对象 90.280 |
TkA07G397410 | |
|
TkA08G261120
Chr08:68067008-68070460 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
76.100 查询 94.764 / 对象 36.625 |
TkA08G261120 | |
|
TkAUNG018060
ChrUn:4787281-4790969 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_022811
Chr05:9994858-9999163 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
38.200 查询 97.124 / 对象 83.593 |
TkAUNG018060 |
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