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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 11 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G035810
Chr01:9288429-9289232 (-)
GWHBCHF00000002
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
79.400
查询 59.925 / 对象 11.017
TkA01G035810
TkA01G426200
Chr01:106411056-106412708 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
45.400
查询 93.091 / 对象 35.946
TkA01G426200
TkA03G455750
Chr03:113790966-113793411 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
38.900
查询 94.730 / 对象 50.706
TkA03G455750
TkA04G519050
Chr04:131301521-131302513 (+)
GWHBCHF00000005
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
59.800
查询 65.328 / 对象 14.760
TkA04G519050
TkA05G113860
Chr05:30398049-30407032 (+)
GWHBCHF00000006
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
59.000
查询 62.893 / 对象 13.771
TkA05G113860
TkA05G114990
Chr05:30693177-30695564 (-)
GWHBCHF00000006
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
42.400
查询 94.668 / 对象 50.777
TkA05G114990
TkA06G479610
Chr06:118842953-118845843 (-)
GWHBCHF00000007
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
93.600
查询 79.915 / 对象 26.342
JCVI_TKOH_00288 TkA06G479610
TkA06G479620
Chr06:118845947-118847131 (-)
GWHBCHF00000007
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
86.000
查询 75.354 / 对象 21.681
JCVI_TKOH_00288 TkA06G479620
TkA06G480290
Chr06:119031513-119033593 (-)
GWHBCHF00000007
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
48.100
查询 85.324 / 对象 23.446
JCVI_TKOH_00288 TkA06G480290
TkA08G077030
Chr08:19773336-19774877 (-)
GWHBCHF00000009
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
46.700
查询 35.897 / 对象 14.760
TkA08G077030
TkA08G139500
Chr08:36268485-36268826 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_022527
Chr05:250169-257633 (+)
CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
82.400
查询 75.221 / 对象 5.720
TkA08G139500
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