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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 38 / 92 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA03G517990
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
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CM104800.1
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需复核
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CM104799.1
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需复核
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需复核
98.600
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需复核
99.600
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CM104801.1
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需复核
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TkA03G519360
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CM104800.1
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需复核
98.600
查询 89.103 / 对象 28.601
TkA03G519370
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CM104806.1
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需复核
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TkA03G519400
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需复核
98.800
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
95.900
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JCVI_TKOH_00147 TkA03G519520
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CM104804.1
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需复核
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TkA03G519590
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CM104805.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 85.906 / 对象 95.522
TkA03G519860
TkA03G519920
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
85.800
查询 100.000 / 对象 80.488
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
85.800
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
100.000
查询 85.714 / 对象 80.000
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
90.400
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TkA03G522890
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CM104800.1
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需复核
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
79.400
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.100
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CM104800.1
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需复核
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需复核
100.000
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.500
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Chr02:145826506-145834858 (-)
CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.200
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
78.800
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
100.000
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CM104800.1
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需复核
87.300
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
98.500
查询 100.000 / 对象 100.000
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
95.700
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
71.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G526850
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
77.300
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G526930
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
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TkA03G527260
TkA03G527310
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G527310
TkA03G527920
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LXL04_010452
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 90.667 / 对象 7.875
JCVI_TKOH_00147 TkA03G527920
TkA03G527930
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LXL04_010452
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.000
查询 100.000 / 对象 57.730
JCVI_TKOH_00147 TkA03G527930
TkA03G528250
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LXL04_010455
Chr02:146885711-146887629 (+)
CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
78.600
查询 96.602 / 对象 99.590
JCVI_TKOH_00147 TkA03G528250
TkA03G528540
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GWHBCHF00000004
LXL04_037520
Chr09:12971891-12973719 (-)
CM104807.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
92.300
查询 49.367 / 对象 41.053
TkA03G528540
TkA03G528830
Chr03:132910119-132910736 (+)
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LXL04_010461
Chr02:147072156-147074677 (+)
CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 97.073 / 对象 57.020
JCVI_TKOH_00147 TkA03G528830
TkA03G528910
Chr03:132924917-132930579 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_000878
Chr01:16147089-16155589 (-)
CM104799.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
74.100
查询 57.823 / 对象 16.189
TkA03G528910
TkA03G529100
Chr03:132984744-132985136 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_039934
ChrUn:47027-48354 (+)
JAJTUU010000097.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
75.900
查询 89.231 / 对象 28.022
TkA03G529100
TkA03G529220
Chr03:133033393-133036963 (-)
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LXL04_010467
Chr02:147190794-147193408 (-)
CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
79.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G529220
TkA03G529230
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GWHBCHF00000004
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Chr02:147190316-147190699 (+)
CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
86.600
查询 76.970 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G529230
TkA03G529300
Chr03:133061653-133065534 (+)
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LXL04_010470
Chr02:147224581-147226710 (+)
CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.500
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G529300
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
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