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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG087920
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 24967542-24970664 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2122 bp · TkAUNG087920|TK1151|cDNA

GTGTAATATACTCTTACGCCTAGTGTTAAAATAAAGAAGCGCGGGAAGGTTTCAGTGGAGAAAGGAATGGCGACTGAGGAGATTCTAGAGATGGAAAAAGCCAGGCTGATAAGCTTGGCTCTCGAATTTGGATTCGATGAAGAATCCGCTCGCATTTGCTTAGATCGTCTCGTTGATCTCTACGGCAATGATGGGCGGGACTTCATCTCTGTGGAGCACTGTGGCGATGACTATCTCGCATCACTTGCAGAAACTATGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1869 bp · TkAUNG087920|TK1151|CDS

ATGGCGACTGAGGAGATTCTAGAGATGGAAAAAGCCAGGCTGATAAGCTTGGCTCTCGAATTTGGATTCGATGAAGAATCCGCTCGCATTTGCTTAGATCGTCTCGTTGATCTCTACGGCAATGATGGGCGGGACTTCATCTCTGTGGAGCACTGTGGCGATGACTATCTCGCATCACTTGCAGAAACTATGGAAGATACTGAGGAATGGGATGATTTGCAAGCTTTGGAGACTGAGGCTTGTGGAACCCTAGCAGACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

622 aa · TkAUNG087920|TK1151|PROTEIN

MATEEILEMEKARLISLALEFGFDEESARICLDRLVDLYGNDGRDFISVEHCGDDYLASLAETMEDTEEWDDLQALETEACGTLADMFDKDSIKHNETVDNDIREPFVNVSKKSSKPQQHDNLFHLDSTSEDEDPDFNISSKKKTKSTSSSSHSKSSQIPPKSTSNKKDEKMKNTQTSVLSFFGKKSPPSVSNNGGGSLSYEELKSLDDIELTNVVIFGNKAFRPLQHQACEAFVQKRDCFVLMPTGGGKSLCYQLPATM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG087920
TK1151 IDTkAUNG087920
OH-1004 IDLXL04_001352
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)46.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 66.077 / OH-1004 37.702
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG087920
位置ChrUn:24967542-24970664 (-)
描述Similar to RECQL4A: ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g05740 3'-5' DNA 解旋酶，可能在 DNA 修复中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g10930 参与 DNA 修复的 DNA 解旋酶。
Arabidopsis RecQI4A suppresses homologous recombination and modulates DNA damage responses.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02501.x
Two closely related RecQ helicases have antagonistic roles in homologous recombination and DNA repair in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0705998104
Topoisomerase 3alpha and RMI1 suppress somatic crossovers and are essential for resolution of meiotic recombination intermediates in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1000285
The RecQ helicase AtRECQ4A is required to remove inter-chromosomal telomeric connections that arise during meiotic recombination in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04438.x
At1g60930 可能参与DNA修复的3'-5' DNA解旋酶（通过相似性预测）。
Two closely related RecQ helicases have antagonistic roles in homologous recombination and DNA repair in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0705998104

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001352 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000070 mitotic sister chromatid segregation 生物过程
GO:0000706 meiotic DNA double-strand break processing 生物过程
GO:0000722 telomere maintenance via recombination 生物过程
GO:0000723 telomere maintenance 生物过程
GO:0000724 double-strand break repair via homologous recombination 生物过程
GO:0000725 recombinational repair 生物过程
GO:0000729 DNA double-strand break processing 生物过程
GO:0000731 DNA synthesis involved in DNA repair 生物过程
GO:0000732 DNA strand displacement 生物过程
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0006265 DNA topological change 生物过程
GO:0006281 DNA repair 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10930
ath:AT1G60930
dme:Dmel_CG6920
sce:YMR190C
spo:2541620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.872
排名 1 · TkAUNG087920 · TK1151
细胞质0.184
排名 2 · TkAUNG087920 · TK1151
线粒体0.065
排名 3 · TkAUNG087920 · TK1151
细胞膜0.020
排名 4 · TkAUNG087920 · TK1151
内质网0.012
排名 5 · TkAUNG087920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28551UBA_RECQL11-61 aa
PF10440WIYLD20-47 aa
PF15457HopW1-155-108 aa
PF09507CDC27127-186 aa
PF04851ResIII140-149 aa
PF04851ResIII222-389 aa
PF00270DEAD224-393 aa
PF11745DUF3304246-268 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG087920PF28551UBA_RECQL11616.8e-30103.7
TkAUNG087920PF10440WIYLD20470.1912.3
TkAUNG087920PF15457HopW1-1551080.1312.0
TkAUNG087920PF09507CDC271271860.0813.1
TkAUNG087920PF04851ResIII1401493.3e-0524.6
TkAUNG087920PF04851ResIII2223893.3e-0524.6
TkAUNG087920PF00270DEAD2243935.6e-2692.0
TkAUNG087920PF11745DUF33042462680.1113.7
TkAUNG087920PF00271Helicase_C2563201.4e-2074.3
TkAUNG087920PF00271Helicase_C3734021.4e-2074.3
TkAUNG087920PF00271Helicase_C4315371.4e-2074.3
TkAUNG087920PF11745DUF33044454750.1113.7
TkAUNG087920PF15457HopW1-14474660.1312.0
TkAUNG087920PF16124RecQ_Zn_bind4484582.7e-1454.3
TkAUNG087920PF00270DEAD4564715.6e-2692.0
TkAUNG087920PF10440WIYLD5065210.1912.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FT74拟南芥sp|Q9FT74|RQL1_ARATH ATP-dependent DNA helicase Q-like 164.900%Swiss-Prot高置信
Q8L840拟南芥sp|Q8L840|RQL4A_ARATH ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A46.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FT70拟南芥sp|Q9FT70|RQL4B_ARATH ATP-dependent DNA helicase Q-like 4B44.800%Swiss-Prot中等置信

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