RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG068980
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 20041410-20044927 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3434 bp · TkAUNG068980|TK1151|cDNA

TTTATCCACACCTCAACCCCCCTTTACTGACTACTTTACCTACTCTCTTCTTCCAGAGAAACACACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATTGAGAACCCAAAATGAGGGTCTTTCTTCTCTCACTCCTGTTACAAATATTAGCAATTTCCTCCGCCGTTAAACCAGGCCGCTTGCCGGAGCTCGCCGTTAAACCAGGCCGCTTGCCGGAGTATCGAGCTTTGCTTTCCCTAAAAACCTCCATTACAGACGATCCACAATCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3057 bp · TkAUNG068980|TK1151|CDS

ATGAGGGTCTTTCTTCTCTCACTCCTGTTACAAATATTAGCAATTTCCTCCGCCGTTAAACCAGGCCGCTTGCCGGAGCTCGCCGTTAAACCAGGCCGCTTGCCGGAGTATCGAGCTTTGCTTTCCCTAAAAACCTCCATTACAGACGATCCACAATCTTCTCTTTCTTCATGGAACATCTCCACCAGTCACTGTACTTGGTCTGGCGTTACCTGCGACTCTCGACGTCGCGTCACCGCCTTAGATATCTCCGGTGTTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1018 aa · TkAUNG068980|TK1151|PROTEIN

MRVFLLSLLLQILAISSAVKPGRLPELAVKPGRLPEYRALLSLKTSITDDPQSSLSSWNISTSHCTWSGVTCDSRRRVTALDISGVNITGVLSSDIGNLRHLVNLNVAANNFIGVIPPEISLISGLRVLNLSNNVFNETFPPELASLKLLEVLDLYNNNLTGDLPVGVSEMAALRHLHLGGNYFSGVIPPEYGRFSSLEYLAVSGNELTGAIPPEIGNLSTLKHLYLGYYNTYSGGIPPEIGNLSNLIRFDAANCGLSGQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG068980
TK1151 IDTkAUNG068980
OH-1004 IDLXL04_006581
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG068980
位置ChrUn:20041410-20044927 (+)
描述Similar to BAM1: Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65700 富含亮氨酸重复序列的受体样激酶，与CLV1和BAM3共同感知CLAVATA类肽CLE25、CLE26和CLE45，经CIK及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化传递信号，调控原生韧皮部分化和分生组织维持。 暂无已核实直接文献
At3g49670 富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），涉及CLAVATA家族肽（CLEs）的检测，以及通过CIK蛋白的磷酸化调节触发信号以促进原韧皮部分化和分生组织维持，可能还包括PBL34、PBL35和PBL36。 暂无已核实直接文献
At4g20270 富含LRR的受体样激酶（LRR-RLK），类似于BAM1和CLV1，参与CLAVATA家族肽（如CLE25、CLE26和CLE45）的检测，并通过磷酸化CIK蛋白（CIKs）以及可能的PBL34、PBL35和PBL36，调节原韧皮部分化和分生组织维持所需的触发信号传导。 暂无已核实直接文献
At1g75820 富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），类似于BAM1和BAM3，参与CLAVATA家族肽（例如CLV3、CLE25、CLE26和CLE45）的检测，并通过CIK蛋白（CIKs）以及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化调节原韧皮部分化和分生组织维持所需的触发信号。
Stem cell signaling in Arabidopsis requires CRN to localize CLV2 to the plasma membrane.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.149930
Receptor-like cytoplasmic kinase MAZZA mediates developmental processes with CLAVATA1 family receptors in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1093/jxb/erab183
A CLE-BAM-CIK signalling module controls root protophloem differentiation in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1111/nph.17791
Receptor-like cytoplasmic kinases PBL34/35/36 are required for CLE peptide-mediated signaling to maintain shoot apical meristem and root apical meristem homeostasis in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1093/plcell/koab315

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006581 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007172 signal complex assembly 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010078 maintenance of root meristem identity 生物过程
GO:0010088 phloem development 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0036289 peptidyl-serine autophosphorylation 生物过程
GO:0045595 regulation of cell differentiation 生物过程
GO:0048229 gametophyte development 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G75820
ath:AT3G49670
ath:AT4G20270
ath:AT5G65700
mtr:11439632
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.884
排名 1 · TkAUNG068980 · TK1151
内质网0.080
排名 2 · TkAUNG068980 · TK1151
细胞质0.062
排名 3 · TkAUNG068980 · TK1151
细胞核0.035
排名 4 · TkAUNG068980 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkAUNG068980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_236-73 aa
PF23211LRR_LRWD176-136 aa
PF29594LRR_SKP276-109 aa
PF13855LRR_877-134 aa
PF00560LRR_179-99 aa
PF12799LRR_479-113 aa
PF23952LRR_EndoS79-110 aa
PF23598LRR_1481-110 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG068980PF08263LRRNT_236733.4e-1247.1
TkAUNG068980PF23211LRR_LRWD1761360.0004320.8
TkAUNG068980PF29594LRR_SKP2761091.48.8
TkAUNG068980PF13855LRR_8771341.1e-37128.3
TkAUNG068980PF00560LRR_179997.3e-51159.8
TkAUNG068980PF12799LRR_4791132.4e-2691.9
TkAUNG068980PF23952LRR_EndoS791100.03215.2
TkAUNG068980PF23598LRR_14811101.4e-32113.5
TkAUNG068980PF29252LRR_NLRC4951074.67.1
TkAUNG068980PF24048LRR_NXF1-5991580.959.8
TkAUNG068980PF13855LRR_81001421.1e-37128.3
TkAUNG068980PF00560LRR_11011217.3e-51159.8
TkAUNG068980PF12799LRR_41011342.4e-2691.9
TkAUNG068980PF24758LRR_At5g563701151614e-0627.4
TkAUNG068980PF23952LRR_EndoS1191580.03215.2
TkAUNG068980PF23598LRR_141242251.4e-32113.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O49545拟南芥sp|O49545|BAME1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM189.700%Swiss-Prot低置信
Q9M2Z1拟南芥sp|Q9M2Z1|BAME2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM284.300%Swiss-Prot低置信
O65440拟南芥sp|O65440|BAME3_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM363.200%Swiss-Prot低置信
Q9SYQ8拟南芥sp|Q9SYQ8|CLV1_ARATH Receptor protein kinase CLAVATA164.600%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看