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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG059330
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 17289391-17293807 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2428 bp · TkAUNG059330|TK1151|cDNA

AGGCTTTCCTCAGACGCCACCTCCATGAATCACGAACAGCATCATCATCCTCGGTCAAAGAATCACGGCCCTGAGGTCTTCTGGCCGAAAATCGTTATCCGAAAATGGCTAAATCGTGCCTCTAAAAGTTCCGATTACACCGCCGATCCGGAAGACGAAGATAGCACATACGATTCCGAAGGCGAAGAAGACTCCTACGACTCCCCAAAAGAACTGCGACTGAAAGTTAAACAAGGAGATGATTTCCAAACAGATCCCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1941 bp · TkAUNG059330|TK1151|CDS

ATGAATCACGAACAGCATCATCATCCTCGGTCAAAGAATCACGGCCCTGAGGTCTTCTGGCCGAAAATCGTTATCCGAAAATGGCTAAATCGTGCCTCTAAAAGTTCCGATTACACCGCCGATCCGGAAGACGAAGATAGCACATACGATTCCGAAGGCGAAGAAGACTCCTACGACTCCCCAAAAGAACTGCGACTGAAAGTTAAACAAGGAGATGATTTCCAAACAGATCCCAGTGGAGGTTTTCCTAGGTCAAGAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

646 aa · TkAUNG059330|TK1151|PROTEIN

MNHEQHHHPRSKNHGPEVFWPKIVIRKWLNRASKSSDYTADPEDEDSTYDSEGEEDSYDSPKELRLKVKQGDDFQTDPSGGFPRSRRRKSETFRAQYIDAKELKVSVSTWNVGGKLPPEDLDISNLLDVDNPSDIYVIGFQEIIPLNAGNIFGAEDNRPVPIWENAIRKTLTKILPENTKFKCYSNPSSPSRFKPSADAPDIEDEVALETDSEEGEEEEIHPFDDLIDVQAGNFNLTRQTSDYFDDALPPTTLPKRIERL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG059330
TK1151 IDTkAUNG059330
OH-1004 IDLXL04_035880
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.381 / OH-1004 92.775
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG059330
位置ChrUn:17289391-17293807 (+)
描述Similar to IP5P3: Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g71710 对 PtdIns(4,5)P2 和 PtdIns(3,4,5)P3 具有磷酸酶活性。 暂无已核实直接文献
At1g34120 对 Ins(1,4,5)P3 和 Ins(1,3,4,5)P4 具有磷酸酶活性，但对 Ins(1,4)P2、Ins(1)P 无活性。 暂无已核实直接文献
At4g18010 对 Ins(1,4,5)P3 和 Ins(1,3,4,5)P4 具有磷酸酶活性。 暂无已核实直接文献
At3g63240 I 型肌醇多磷酸 5-磷酸酶 4。 暂无已核实直接文献
At1g05470 可能对 PtdIns(4,5)P₂ 和 PtdIns(3,4,5)P₃ 具有磷酸酶活性。
Genetic regulation of vascular tissue patterning in Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.11.2123
Cotyledon vascular pattern2-mediated inositol (1,4,5) triphosphate signal transduction is essential for closed venation patterns of Arabidopsis foliar organs.2004 · DOI: 10.1105/tpc.021030
CVP2- and CVL1-mediated phosphoinositide signaling as a regulator of the ARF GAP SFC/VAN3 in establishment of foliar vein patterns.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03920.x
Primary root protophloem differentiation requires balanced phosphatidylinositol-4,5-biphosphate levels and systemically affects root branching.2015 · DOI: 10.1242/dev.118364

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035880 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0032957 inositol trisphosphate metabolic process 生物过程
GO:0043647 inositol phosphate metabolic process 生物过程
GO:0046856 phosphatidylinositol dephosphorylation 生物过程
GO:0090351 seedling development 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0004439 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity 分子功能
GO:0004445 inositol-polyphosphate 5-phosphatase activity 分子功能
GO:0034485 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34120
ath:AT1G71710
ath:AT3G63240
ath:AT4G18010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.388
排名 1 · TkAUNG059330 · TK1151
细胞膜0.266
排名 2 · TkAUNG059330 · TK1151
细胞核0.264
排名 3 · TkAUNG059330 · TK1151
高尔基体0.079
排名 4 · TkAUNG059330 · TK1151
质体0.072
排名 5 · TkAUNG059330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02724CDC4535-93 aa
PF22669Exo_endo_phos2109-182 aa
PF03372Exo_endo_phos109-155 aa
PF02724CDC45111-215 aa
PF22669Exo_endo_phos2335-595 aa
PF03372Exo_endo_phos472-590 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG059330PF02724CDC4535930.1211.4
TkAUNG059330PF22669Exo_endo_phos21091821.5e-73248.6
TkAUNG059330PF03372Exo_endo_phos1091556.6e-0626.8
TkAUNG059330PF02724CDC451112150.1211.4
TkAUNG059330PF22669Exo_endo_phos23355951.5e-73248.6
TkAUNG059330PF03372Exo_endo_phos4725906.6e-0626.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H0Z6拟南芥sp|Q8H0Z6|IP5P3_ARATH Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 352.700%Swiss-Prot高置信
Q84MA2拟南芥sp|Q84MA2|IP5P1_ARATH Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 145.900%Swiss-Prot中等置信
Q9FUR2拟南芥sp|Q9FUR2|IP5P2_ARATH Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 242.500%Swiss-Prot中等置信
Q8GTS0拟南芥sp|Q8GTS0|IP5P4_ARATH Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 437.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LR47拟南芥sp|Q9LR47|IP5P6_ARATH Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 636.100%Swiss-Prot中等置信

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