TkAUNG053060 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG053060

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 15155210-15159915 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2811 bp · TkAUNG053060|TK1151|cDNA

AGCCTAATTTGATGCATTATCTCGAAGCTTCAACACCCAATACCATTTTAAAGTTTTAAACCCACAAAACACCATGGAATCCTAAAACCCTCCGATAATCTTGTCTGAAGTCTGAACCTCACTGTGCGTCCATCAAGATGATGTCCATAACAACTCCTCATTTCAAATTCGGTATTTCCATTTCTCAAATTCAATCCCATGTTGAAACATCTTCGATGATTTTAAAAACCTCAAGAACCAGAAGAAAATTTCAAAATTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2457 bp · TkAUNG053060|TK1151|CDS

ATGATGTCCATAACAACTCCTCATTTCAAATTCGGTATTTCCATTTCTCAAATTCAATCCCATGTTGAAACATCTTCGATGATTTTAAAAACCTCAAGAACCAGAAGAAAATTTCAAAATTCACATCCATCGTCTTCATTCAATTCGTTAAACGTGAAACTACGCTCTGTACGTCAAGTCATCACAAGAATCAGCTGCAGCAGTGACAGCGGCGACACATTCCATGACGGTACTCCACAAAAAGTTTCCGATGATATCTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

818 aa · TkAUNG053060|TK1151|PROTEIN

MMSITTPHFKFGISISQIQSHVETSSMILKTSRTRRKFQNSHPSSSFNSLNVKLRSVRQVITRISCSSDSGDTFHDGTPQKVSDDISDYKANSSPNSGDAYVGMFIRMLGLDNDILDREQAVDALWKYSLGGKQCVDAIMKSRGSVFLTVNLLNSESTIACEAAAGLLRTISSVNIYRDFVAESGAIQEITSLLRRPSLTSEIKEQSLCLLANLSVDEKLRLQIANTDLLPLLIKFLDDEEDMKVIEASGGVLANLALSV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG053060`
TK1151 ID	TkAUNG053060
OH-1004 ID	LXL04_021213
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	95.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.267 / OH-1004 96.568 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkAUNG053060`
位置	ChrUn:15155210-15159915 (+)
描述	Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_021213` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0000209 protein polyubiquitination 生物过程 GO:0000578 embryonic axis specification 生物过程 GO:0000902 cell morphogenesis 生物过程 GO:0001708 cell fate specification 生物过程 GO:0001709 cell fate determination 生物过程 GO:0001894 tissue homeostasis 生物过程 GO:0002053 positive regulation of mesenchymal cell proliferation 生物过程 GO:0003094 glomerular filtration 生物过程 GO:0003401 axis elongation 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
KEGG 基因交叉引用	bta:539003 cfa:477032 mmu:12387 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.334

排名 1 · TkAUNG053060 · TK1151

细胞质0.290

排名 2 · TkAUNG053060 · TK1151

质体0.197

排名 3 · TkAUNG053060 · TK1151

细胞膜0.180

排名 4 · TkAUNG053060 · TK1151

内质网0.065

排名 5 · TkAUNG053060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13646HEAT_2112-140 aa

PF00514Arm118-126 aa

PF24768ARM_ARMC5138-196 aa

PF00514Arm150-173 aa

PF13513HEAT_EZ150-170 aa

PF02985HEAT151-173 aa

PF11698V-ATPase_H_C152-211 aa

PF25598ARM_PUB154-284 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG053060	`PF13646`	HEAT_2	112	140	2.9e-08	34.6
TkAUNG053060	`PF00514`	Arm	118	126	3.8e-19	68.7
TkAUNG053060	`PF24768`	ARM_ARMC5	138	196	8.6e-22	78.6
TkAUNG053060	`PF00514`	Arm	150	173	3.8e-19	68.7
TkAUNG053060	`PF13513`	HEAT_EZ	150	170	0.00016	22.8
TkAUNG053060	`PF02985`	HEAT	151	173	2.0	9.6
TkAUNG053060	`PF11698`	V-ATPase_H_C	152	211	0.44	11.4
TkAUNG053060	`PF25598`	ARM_PUB	154	284	1.6e-11	44.9
TkAUNG053060	`PF00514`	Arm	178	215	3.8e-19	68.7
TkAUNG053060	`PF22964`	ZER1-like_2nd	179	265	0.00017	21.0
TkAUNG053060	`PF29853`	SYS1_M	184	257	0.032	14.6
TkAUNG053060	`PF13513`	HEAT_EZ	203	254	0.00016	22.8
TkAUNG053060	`PF24768`	ARM_ARMC5	207	285	8.6e-22	78.6
TkAUNG053060	`PF05804`	KAP	207	285	2.4e-05	23.5
TkAUNG053060	`PF00514`	Arm	220	257	3.8e-19	68.7
TkAUNG053060	`PF13646`	HEAT_2	223	293	2.9e-08	34.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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