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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG044570
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 12396069-12400359 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2197 bp · TkAUNG044570|TK1151|cDNA

TGGTGATTCAAAATTTGAAAAAGCCCTGCAAATAAAGGTTTCTTTTTGGCCCGCCCGACTCTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGGGCGGAAAACACCAAACCCTCACTCGCTCTTTATAGACCAGTGTCGCTGTACAATCGATCGATACTGAATTACAGAAGGATCTGTAGGTCCTCAATCCATTCACAGGGTTTTCTCTTTCTCGCTAGGAACTTTAACGATGTCGCTGAGACCTAGCGCCAGAACGGAGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1602 bp · TkAUNG044570|TK1151|CDS

ATGTCGCTGAGACCTAGCGCCAGAACGGAGGTTCGCCGGAACCGATACAAGGTGGCGGTCGATGCAGATGAAGGGCGGCGGAGGCGAGAAGACAATATGGTCGAGATCCGTAAGAATCGGAGAGAAGAAAGTTTGCAGAAGAAGAGACGCGAAGTCACTGCTGGCCAGTTCACCATGCCCGCTCAGTCTGCTTCCACCGCCGAAAAGAAGTTGGAAAACCTTCCTGCAATGGTTGCTGGAGTTTTCTCTGATGATAACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

533 aa · TkAUNG044570|TK1151|PROTEIN

MSLRPSARTEVRRNRYKVAVDADEGRRRREDNMVEIRKNRREESLQKKRREVTAGQFTMPAQSASTAEKKLENLPAMVAGVFSDDNNMQLEATTQFRKLLSIERSPPIEEVIQSGVVPRFVEFLVREDFPQLQFEAAWALTNIASGTSEHTKVVIDHGAVPIFVKLLASPSDDVREQAVWALGNVAGDSPKCRDFVLAQGALIPLLSQLNERAKLSMLRNATWTLSNFCRGKPQPSFNQTKPALPALMQLIHSNDEEVLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG044570
TK1151 IDTkAUNG044570
OH-1004 IDLXL04_015427
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)76.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 83.542
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG044570
位置ChrUn:12396069-12400359 (+)
描述Similar to IMPA2: Importin subunit alpha-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g06720 在不存在导入蛋白 β 亚基的情况下以高亲和力与常规 NLS 基序结合。
SWO1 modulates cell wall integrity under salt stress by interacting with importin ɑ in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1007/s44154-021-00010-5
At4g16143 与传统的 NLS 基序结合并介导核蛋白跨核膜的输入。
SWO1 modulates cell wall integrity under salt stress by interacting with importin ɑ in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1007/s44154-021-00010-5
At4g02150 结合常规核定位信号（NLS）基序，并介导蛋白穿过核膜的核内导入（通过相似性）。
An importin alpha homolog, MOS6, plays an important role in plant innate immunity.2005 · DOI: 10.1016/j.cub.2005.05.022

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0155601 功能于核蛋白输入。 暂无已核实直接文献
Os01g0253300 功能于核蛋白输入。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015427 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006606 protein import into nucleus 生物过程
GO:0006607 NLS-bearing protein import into nucleus 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G06720
ath:AT4G16143
sly:543535
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.566
排名 1 · TkAUNG044570 · TK1151
细胞质0.525
排名 2 · TkAUNG044570 · TK1151
线粒体0.059
排名 3 · TkAUNG044570 · TK1151
细胞膜0.059
排名 4 · TkAUNG044570 · TK1151
内质网0.034
排名 5 · TkAUNG044570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01749IBB12-94 aa
PF25579TPR_TRIP12_N57-190 aa
PF23227HEAT_MROH2B_C68-113 aa
PF00514Arm105-145 aa
PF25598ARM_PUB106-205 aa
PF24768ARM_ARMC5108-230 aa
PF30701ARMC6110-195 aa
PF16201NopRA1112-149 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG044570PF01749IBB12944.1e-2588.8
TkAUNG044570PF25579TPR_TRIP12_N571905.5e-1040.3
TkAUNG044570PF23227HEAT_MROH2B_C681133.5e-0833.8
TkAUNG044570PF00514Arm1051453.6e-92300.5
TkAUNG044570PF25598ARM_PUB1062051.2e-0835.5
TkAUNG044570PF24768ARM_ARMC51082301.1e-1971.6
TkAUNG044570PF30701ARMC61101952.1e-0627.3
TkAUNG044570PF16201NopRA11121492.2e-0731.3
TkAUNG044570PF25571TPR_CCP1_N1141730.03613.8
TkAUNG044570PF02985HEAT1171451.8e-1968.7
TkAUNG044570PF13646HEAT_21181882.4e-2176.5
TkAUNG044570PF22964ZER1-like_2nd1201739e-1038.4
TkAUNG044570PF01602Adaptin_N1253161.8e-0524.2
TkAUNG044570PF23271HEAT_GCN11261884.8e-0730.8
TkAUNG044570PF30746TMCO61274743.7e-1246.4
TkAUNG044570PF23227HEAT_MROH2B_C1282133.5e-0833.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q96321拟南芥sp|Q96321|IMPA1_ARATH Importin subunit alpha-175.800%Swiss-Prot高置信
F4JL11拟南芥sp|F4JL11|IMPA2_ARATH Importin subunit alpha-273.000%Swiss-Prot高置信
O04294拟南芥sp|O04294|IMPA3_ARATH Importin subunit alpha-371.800%Swiss-Prot高置信
Q9SLX0水稻sp|Q9SLX0|IMA1B_ORYSJ Importin subunit alpha-1b77.900%Swiss-Prot高置信
Q71VM4水稻sp|Q71VM4|IMA1A_ORYSJ Importin subunit alpha-1a76.000%Swiss-Prot高置信

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