TkAUNG040660 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG040660

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 11351070-11355113 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2190 bp · TkAUNG040660|TK1151|cDNA

AATTCGGCAGTTGCCGTTGCTCTCAAAGTCTATATAAACCACAACCAATGGTCCATTCTCAACTACATTCCATCCACAACACCCATCCTCGTTACCAACCTTAAATTCATCAATGCCCAAATTCACACCCAACATGAGCAAGCCTCTTTCCTCCTTTCTTGCATTATGTTTTCTTGTCATCATCCAACAGACTAGCCACACTGAAGCGGCCAGTCGAAATATTAAAGATACTATACAGCTTCCCAATCAAAAGATTGAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

900 bp · TkAUNG040660|TK1151|CDS

ATGTTATACAAAGGAGTGTACCATTTCTTTTATCAATACAATCCGTATGCGGCAACTTTTGGGGACCCCATCGTCTGGGCCCATGCCGTATCTTACGACTTGGTCAACTGGATCCATCTTGACCCGGCAATTTACCCGACCCAGGAGGCTGACATCAAGAGTTGCTGGTCTGGATCCGCTACCATCCTACCGGGAAATATTCCGGCGATGTTGTACACCGGCAGCGATTCCAAGTCTCGTCAAGTCCAAGACCTCGCCTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

299 aa · TkAUNG040660|TK1151|PROTEIN

MLYKGVYHFFYQYNPYAATFGDPIVWAHAVSYDLVNWIHLDPAIYPTQEADIKSCWSGSATILPGNIPAMLYTGSDSKSRQVQDLAWPKNLSDPFLREWVKHPKNPLITPPEGVKDDCFRDPSTAWRGPDGVWRLVVGGGRDNNGMTLLYQSTDFVNWKRYDQPLSSAVATGTWECPDFYPVPLNSTNGIDTSVYSGSVIHVMKAGFEGHDWYTIGTYSSDRENFLPQNGLSLTGSSLDLRYDYGRFYASKSFFDDAKNR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG040660`
TK1151 ID	TkAUNG040660
OH-1004 ID	LXL04_028841
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	98.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 93.311 / OH-1004 45.588 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG040660

位置 ChrUn:11351070-11355113 (+)

描述 Similar to CWINV3: Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme CWINV3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g11920`	6和1-果聚糖外水解酶，可降解菊粉型和鼠李糖型果聚糖，如phlein、levan、neokestose、levanbiose、6-kestose、1-kestose、inulin和1,1-nystose。	暂无已核实直接文献
`At3g13790`	β-呋喃果糖苷酶，可以使用蔗糖和 1-酮糖，以及较低程度的新酮糖和果聚糖作为底物，但不能使用菊糖。	Unraveling the difference between invertases and fructan exohydrolases: a single amino acid (Asp-239) substitution transforms Arabidopsis cell wall invertase1 into a fructan 1-exohydrolase.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.105049

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028841 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0010494 cytoplasmic stress granule 细胞组分

GO:0048046 apoplast 细胞组分

GO:0004564 beta-fructofuranosidase activity 分子功能

GO:0033949 fructan beta-(2,6)-fructosidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:CAD48404

ath:AT1G55120

ath:AT3G13790

ath:AT5G11920

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.366

排名 1 · TkAUNG040660 · TK1151

内质网0.199

排名 2 · TkAUNG040660 · TK1151

细胞质0.173

排名 3 · TkAUNG040660 · TK1151

细胞膜0.128

排名 4 · TkAUNG040660 · TK1151

细胞外0.112

排名 5 · TkAUNG040660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00251Glyco_hydro_32N1-280 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG040660	`PF00251`	Glyco_hydro_32N	1	280	3.5e-74	250.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W4S6`	拟南芥	sp\|Q8W4S6\|INV6_ARATH Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme CWINV6	53.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q43866`	拟南芥	sp\|Q43866\|INV1_ARATH Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme CWINV1	49.300%	Swiss-Prot	中等置信

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