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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G173650
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 45387570-45391419 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2265 bp · TkA08G173650|TK1151|cDNA

TAACAAATCGACCCCCCTCGTCTCTCTCTATCTCTCTCTTCTCCGTTTCGTCCCTCTCTCCAACTCTCCAAGGTTTGCGGTATTAATCAGTCATCAATCATGTCTTTGAGGCCAAGCGCAAGGACCGAGGTTCGTCGGAACCGTTACAAGGTGGCCGTCGATGCGGATGAAGGAAGGCGGCGGAGGGAGGACAACATGGTTGAGATCCGTAAGAACAAGAGAGAGGAGAACTTGCTTAAGAAGCGTCAAGTGCTGTCGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1599 bp · TkA08G173650|TK1151|CDS

ATGTCTTTGAGGCCAAGCGCAAGGACCGAGGTTCGTCGGAACCGTTACAAGGTGGCCGTCGATGCGGATGAAGGAAGGCGGCGGAGGGAGGACAACATGGTTGAGATCCGTAAGAACAAGAGAGAGGAGAACTTGCTTAAGAAGCGTCAAGTGCTGTCGTCATCACAACCGCTGGCTGGTGGTGTTCCAGTTCCAACATCAACCGTCGAGAAAAAGTTAGAAAGTCTTCCTTCAATGGTTGCTGGAGTATACTCCAATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

532 aa · TkA08G173650|TK1151|PROTEIN

MSLRPSARTEVRRNRYKVAVDADEGRRRREDNMVEIRKNKREENLLKKRQVLSSSQPLAGGVPVPTSTVEKKLESLPSMVAGVYSNDNNMQLEATTQFRKLLSIERSPPIEEVIQSGVVPRFVEFLMREDFPQLQFEAAWALTNIASGTSENTKVVIDYGAVPIFVKLLASPSDDVREQAVWALGNVAGDSPRCRDLVLGQGALIPLLSQLNENAKLSMLRNATWTLSNFCRGKPQPPFEQTRPALPALERLVHSNDEEV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G173650
TK1151 IDTkA08G173650
OH-1004 IDLXL04_015427
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 83.699
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G173650
位置Chr08:45387570-45391419 (-)
描述Similar to IMPA2: Importin subunit alpha-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g06720 在不存在导入蛋白 β 亚基的情况下以高亲和力与常规 NLS 基序结合。
SWO1 modulates cell wall integrity under salt stress by interacting with importin ɑ in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1007/s44154-021-00010-5
At4g16143 与传统的 NLS 基序结合并介导核蛋白跨核膜的输入。
SWO1 modulates cell wall integrity under salt stress by interacting with importin ɑ in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1007/s44154-021-00010-5

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0253300 功能于核蛋白输入。 暂无已核实直接文献
Os05g0155601 功能于核蛋白输入。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015427 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006606 protein import into nucleus 生物过程
GO:0006607 NLS-bearing protein import into nucleus 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G06720
ath:AT4G16143
sly:543535
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.579
排名 1 · TkA08G173650 · TK1151
细胞质0.527
排名 2 · TkA08G173650 · TK1151
细胞膜0.058
排名 3 · TkA08G173650 · TK1151
线粒体0.055
排名 4 · TkA08G173650 · TK1151
内质网0.034
排名 5 · TkA08G173650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25579TPR_TRIP12_N10-54 aa
PF01749IBB12-96 aa
PF23227HEAT_MROH2B_C70-115 aa
PF25579TPR_TRIP12_N85-192 aa
PF00514Arm107-147 aa
PF24768ARM_ARMC5110-232 aa
PF25598ARM_PUB110-209 aa
PF30701ARMC6112-192 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G173650PF25579TPR_TRIP12_N10541.1e-0526.3
TkA08G173650PF01749IBB12968.6e-2691.0
TkA08G173650PF23227HEAT_MROH2B_C701150.0001821.7
TkA08G173650PF25579TPR_TRIP12_N851921.1e-0526.3
TkA08G173650PF00514Arm1071476.3e-93302.9
TkA08G173650PF24768ARM_ARMC51102325.8e-2072.6
TkA08G173650PF25598ARM_PUB1102092.1e-0731.4
TkA08G173650PF30701ARMC61121926.1e-0935.7
TkA08G173650PF16201NopRA11141526.8e-0626.5
TkA08G173650PF14668RICTOR_V1151470.04414.7
TkA08G173650PF02985HEAT1191472.5e-1555.8
TkA08G173650PF13646HEAT_21201906.7e-2071.9
TkA08G173650PF22964ZER1-like_2nd1221735e-0832.6
TkA08G173650PF23271HEAT_GCN11271881.3e-0526.1
TkA08G173650PF30746TMCO61284422.7e-1350.2
TkA08G173650PF13513HEAT_EZ1321871e-2693.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q96321拟南芥sp|Q96321|IMPA1_ARATH Importin subunit alpha-181.300%Swiss-Prot高置信
F4JL11拟南芥sp|F4JL11|IMPA2_ARATH Importin subunit alpha-274.300%Swiss-Prot高置信
Q71VM4水稻sp|Q71VM4|IMA1A_ORYSJ Importin subunit alpha-1a76.300%Swiss-Prot高置信
Q9SLX0水稻sp|Q9SLX0|IMA1B_ORYSJ Importin subunit alpha-1b71.000%Swiss-Prot高置信

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