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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G170180
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 44514125-44517263 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1868 bp · TkA08G170180|TK1151|cDNA

TTAAAGCCAAACTCTTAAATCAATCTTCTCTCCATTTAACAAGCTTTTATTCCCCAGATTAGCAACTCCCTTATCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAACTTTCTCTTCGAAAATTATGCAGTTGATTCATCTTCTTCTTCAAGAGAGAGAGAACTGAATATTCATTCTTAAGATTAGATTCACCGGTCGCCGCCGTCTCCTCCAACCTACTGTTGCATTTCCATAGTTTGCAGTATGACAAGAGTTTTTTCACCCTATTTTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1446 bp · TkA08G170180|TK1151|CDS

ATGACAAGAGTTTTTTCACCCTATTTTGATCCCGAATTTGATTCTCTTTCAGAAAGGATCAACGGCCCACCTTGCAGAGTGACCTTTGACAACGATAGCTTAGCGGATTGTACCATCGTGAAGATAGATTGTGTAAATAAGCAAGCTCAACTCCTTGATGTGGTCCAGGTTCTAACGGAAGTCAACCTAACTATCTCAAAAGGCTATATATCTTCTGATGCCGGATGGTTCATGGATGTATTTCATGTTAAAGATGGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

481 aa · TkA08G170180|TK1151|PROTEIN

MTRVFSPYFDPEFDSLSERINGPPCRVTFDNDSLADCTIVKIDCVNKQAQLLDVVQVLTEVNLTISKGYISSDAGWFMDVFHVKDGNGKKVTDQSVINYIQQTIGSNRGAASKLTTQKSKLLNTEPTAIEMTATDRPGLFSEISAALTDLHCNIVEAHAWSHNARLACVAYINDQSSDTRIDGHRLATIEHHLNTILHASTTPENTYLQSSTQHKDVMSTGFIPGGSEGTMTTVERRLHQLLLSVHDFDVPPTRAAVSPT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G170180
TK1151 IDTkA08G170180
OH-1004 IDLXL04_032376
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G170180
位置Chr08:44514125-44517263 (+)
描述Similar to ACR2: ACT domain-containing protein ACR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g25320 可能结合氨基酸。 暂无已核实直接文献
At1g76990 可能结合氨基酸。
Molecular characterization of a novel gene family encoding ACT domain repeat proteins in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.007484
At1g69040 可能结合氨基酸。 暂无已核实直接文献
At3g01990 可能结合氨基酸。 暂无已核实直接文献
At2g03730 可能结合氨基酸。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032376 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006521 regulation of amino acid metabolic process 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016597 amino acid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69040
ath:AT1G76990
ath:AT2G03730
ath:AT3G01990
ath:AT5G25320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.451
排名 1 · TkA08G170180 · TK1151
细胞核0.410
排名 2 · TkA08G170180 · TK1151
细胞膜0.134
排名 3 · TkA08G170180 · TK1151
溶酶体／液泡0.062
排名 4 · TkA08G170180 · TK1151
内质网0.049
排名 5 · TkA08G170180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24931ACT_ACR9_3rd27-101 aa
PF26956ACT_ACR_D134-108 aa
PF24914ACR10_N35-90 aa
PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant39-104 aa
PF13291ACT_440-73 aa
PF01842ACT51-87 aa
PF24914ACR10_N122-176 aa
PF26956ACT_ACR_D1125-195 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G170180PF24931ACT_ACR9_3rd271019.6e-1968.0
TkA08G170180PF26956ACT_ACR_D1341089.1e-47157.5
TkA08G170180PF24914ACR10_N35901.4e-1350.8
TkA08G170180PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant391047.4e-1349.1
TkA08G170180PF13291ACT_440735.2e-1350.2
TkA08G170180PF01842ACT51871e-2280.2
TkA08G170180PF24914ACR10_N1221761.4e-1350.8
TkA08G170180PF26956ACT_ACR_D11251959.1e-47157.5
TkA08G170180PF24931ACT_ACR9_3rd1251679.6e-1968.0
TkA08G170180PF13291ACT_41261615.2e-1350.2
TkA08G170180PF01842ACT1281621e-2280.2
TkA08G170180PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant1281667.4e-1349.1
TkA08G170180PF24926ACT_ACR9_C1281630.0009519.8
TkA08G170180PF13740ACT_61291671.4e-0525.5
TkA08G170180PF22629ACT_AHAS_ss1291560.02315.6
TkA08G170180PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant2282477.4e-1349.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JWR0拟南芥sp|F4JWR0|ACR2_ARATH ACT domain-containing protein ACR254.900%Swiss-Prot高置信
O49285拟南芥sp|O49285|ACR3_ARATH ACT domain-containing protein ACR344.700%Swiss-Prot中等置信
Q8LJW3拟南芥sp|Q8LJW3|ACR4_ARATH ACT domain-containing protein ACR442.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SGA0拟南芥sp|Q9SGA0|ACR6_ARATH ACT domain-containing protein ACR642.500%Swiss-Prot中等置信
Q9ZPQ8拟南芥sp|Q9ZPQ8|ACR5_ARATH ACT domain-containing protein ACR540.000%Swiss-Prot中等置信

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