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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA08G131250
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 34067182-34076288 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1710 bp · TkA08G131250|TK1151|cDNA

GAATGGTGGTGGCAAACAGTCAGGCATGAAACATCATGTCGATTTCTGCAACAATTCAAGACTTTTATACTAATACATAAACAAAACTGTACTCCACGATAATTAACGCACTAAAACACACACATATGGATTCAGCGGCCATAGTCGATCAGAAACAACCTCATGTGGTATTCATACCATGTCCAGCACAAAGCCACATCAAATGTATGCTCAAACTCGCCAGACTTCTCCACCACAACGGCCTCCATGTAACCTTCATC...

1530 bp · TkA08G131250|TK1151|CDS

ATGACTTACCACAATACGATTGGTGTTGCTGATAGGCTTAAGATCCCCATCATCGTTTTCTGGACCATGGCTGCCTGTGGCTTCATGGGGTTTTACCAGGCCAAAGTTCTATTGGAAAAAGGGATTGTCCCACTAAAAGCACAAAGCCACATCAAGTGCATGCTCAAATTAGCCAGGATTCTTCACAAGAACGGCCTCCATGTGACCTTCATCAACACCCAATCGAATCACAATCGCCTTATAAACTCCAATGGGACCCG...

509 aa · TkA08G131250|TK1151|PROTEIN

MTYHNTIGVADRLKIPIIVFWTMAACGFMGFYQAKVLLEKGIVPLKAQSHIKCMLKLARILHKNGLHVTFINTQSNHNRLINSNGTRWLNQAPGFQFKTVPDGLPDGVEYTQTIAGLWTYLKTNFFDSFLDLLSNLEIPVTCVICDGFMTYTDMISAAEKLKIPIMLFWTMAACGFMGFYQVKVLMEKGVLPLKDESYLTNGYLEMEIDWIPGMEGLRLKEIPEIKLFTEPDNPGFKYLLETAQAADKVSHVIVHTFEEL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G131250
TK1151 IDTkA08G131250
OH-1004 IDLXL04_031818
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.749 / OH-1004 96.687
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G131250
位置Chr08:34067182-34076288 (-)
描述Similar to UGT85C1: UDP-glycosyltransferase 85C1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g22380 UDP-糖基转移酶 85A3。 暂无已核实直接文献
At1g22400 参与反式玉米素和二氢玉米素的 O-葡萄糖基化。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_031818 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:1900994 (-)-secologanin biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0015020 glucuronosyltransferase activity 分子功能
GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能
GO:0080043 quercetin 3-O-glucosyltransferase activity 分子功能
GO:0080044 quercetin 7-O-glucosyltransferase activity 分子功能
GO:0102377 steviol 13-O glucosyltransferase activity 分子功能
GO:0102378 steviolmonoside glucosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:BAK55737
ag:BAK55749
ath:AT1G22380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.611
排名 1 · TkA08G131250 · TK1151
内质网0.132
排名 2 · TkA08G131250 · TK1151
细胞核0.121
排名 3 · TkA08G131250 · TK1151
过氧化物酶体0.105
排名 4 · TkA08G131250 · TK1151
溶酶体/液泡0.057
排名 5 · TkA08G131250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22340TubZ_C_38-37 aa
PF00201UDPGT9-60 aa
PF23317YVC1_C16-55 aa
PF23776DUF717030-43 aa
PF26168Glyco_transf_N42-84 aa
PF23317YVC1_C129-186 aa
PF22340TubZ_C_3156-185 aa
PF23776DUF7170178-190 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G131250PF22340TubZ_C_38370.2612.3
TkA08G131250PF00201UDPGT9601.1e-2384.6
TkA08G131250PF23317YVC1_C16550.3310.9
TkA08G131250PF23776DUF717030430.1512.8
TkA08G131250PF26168Glyco_transf_N42840.01216.3
TkA08G131250PF23317YVC1_C1291860.3310.9
TkA08G131250PF22340TubZ_C_31561850.2612.3
TkA08G131250PF23776DUF71701781900.1512.8
TkA08G131250PF06722EryCIII-like_C2472860.0001822.3
TkA08G131250PF26168Glyco_transf_N2502810.01216.3
TkA08G131250PF00201UDPGT3094671.1e-2384.6
TkA08G131250PF06722EryCIII-like_C3984600.0001822.3
TkA08G131250PF04101Glyco_tran_28_C4024800.0003921.2
TkA08G131250PF26325YhjD4284650.1512.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMF1拟南芥sp|Q9LMF1|U85A3_ARATH UDP-glycosyltransferase 85A346.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SK82拟南芥sp|Q9SK82|U85A1_ARATH UDP-glycosyltransferase 85A148.700%Swiss-Prot中等置信

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