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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G112150
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 29167377-29170254 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1585 bp · TkA08G112150|TK1151|cDNA

GGAACCCTTCTACACATTTTTGAAACAAGCAAATATTCAAAAAGAGTCGAGAAAAAACCCCTTCCCAAATTCCTCTCTTTCGCTTTTGCACCTGGTTTTCTTCAAGCGTATGCACTAATGGATGCAATACGTAAACAAGCTTCGAAGCTCAGAGAACAGGTGGCTAGACAGCAACAGGCTGTTCTCAAACAATTTGCTGGTGGACTTGGAGGTTCTGAAGATATTGTAGCCAATGAAGTAGAACTACAACAGCAACAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1227 bp · TkA08G112150|TK1151|CDS

GGAACCCTTCTACACATTTTTGAAACAAGCAAATATTCAAAAAGAGTCGAGAAAAAACCCCTTCCCAAATTCCTCTCTTTCGCTTTTGCACCTGGTTTTCTTCAAGCGTATGCACTAATGGATGCAATACGTAAACAAGCTTCGAAGCTCAGAGAACAGGTGGCTAGACAGCAACAGGCTGTTCTCAAACAATTTGCTGGTGGACTTGGAGGTTCTGAAGATATTGTAGCCAATGAAGTAGAACTACAACAGCAACAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

408 aa · TkA08G112150|TK1151|PROTEIN

GTLLHIFETSKYSKRVEKKPLPKFLSFAFAPGFLQAYALMDAIRKQASKLREQVARQQQAVLKQFAGGLGGSEDIVANEVELQQQQKLEKLYISTRSAKHFQRDIVRGVEGFIVTGSKQVEIGTKLSDDSRKYGAENTCTSGNALSKAAMSYSNARMDIERERENLLKTLGTQVAEPLRAMVVGAPLEDARRHAQRYDRVRQEAEAQVIEVARRQAKVRENSGNVDNLSKFEAAQARLQELKSNMNVLGKEAVATMSAVE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G112150
TK1151 IDTkA08G112150
OH-1004 IDLXL04_031536
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.441 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G112150
位置Chr08:29167377-29170254 (+)
描述Similar to SH3P2: SH3 domain-containing protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34660 可能调节自噬体的形成或成熟。
A BAR-domain protein SH3P2, which binds to phosphatidylinositol 3-phosphate and ATG8, regulates autophagosome formation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.118307
SH3 Domain-Containing Protein 2 Plays a Crucial Role at the Step of Membrane Tubulation during Cell Plate Formation.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00108
At4g18060 可能参与将 DRP2A 招募到辅助蛋白复合体中，并负向调节其 GTP 酶活性。 暂无已核实直接文献
At1g31440 脂质结合蛋白与磷脂酸、磷脂酰肌醇-4-磷酸和磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸强烈结合。
Role of SH3 domain-containing proteins in clathrin-mediated vesicle trafficking in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010279

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031536 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009920 cell plate formation involved in plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0061024 membrane organization 生物过程
GO:0072319 vesicle uncoating 生物过程
GO:0072583 clathrin-dependent endocytosis 生物过程
GO:1903527 positive regulation of membrane tubulation 生物过程
GO:0000421 autophagosome membrane 细胞组分
GO:0002102 podosome 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31440
ath:AT4G18060
ath:AT4G34660
gga:395202
hsa:6455
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.636
排名 1 · TkA08G112150 · TK1151
细胞膜0.233
排名 2 · TkA08G112150 · TK1151
细胞核0.170
排名 3 · TkA08G112150 · TK1151
高尔基体0.160
排名 4 · TkA08G112150 · TK1151
溶酶体／液泡0.092
排名 5 · TkA08G112150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26790DUF8262153-234 aa
PF18386ROQ_II196-212 aa
PF18386ROQ_II265-293 aa
PF11302DUF3104332-356 aa
PF14604SH3_9347-394 aa
PF07653SH3_2347-394 aa
PF00018SH3_1348-390 aa
PF11302DUF3104359-373 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G112150PF26790DUF82621532340.01116.7
TkA08G112150PF18386ROQ_II1962120.9910.0
TkA08G112150PF18386ROQ_II2652930.9910.0
TkA08G112150PF11302DUF31043323560.02815.0
TkA08G112150PF14604SH3_93473941.6e-1041.4
TkA08G112150PF07653SH3_23473942.7e-0937.3
TkA08G112150PF00018SH3_13483908.9e-0935.5
TkA08G112150PF11302DUF31043593730.02815.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VWF1拟南芥sp|Q8VWF1|SH3P2_ARATH SH3 domain-containing protein 266.300%Swiss-Prot高置信
Q8L7W0拟南芥sp|Q8L7W0|SH3P3_ARATH SH3 domain-containing protein 349.900%Swiss-Prot中等置信
Q9C865拟南芥sp|Q9C865|SH3P1_ARATH SH3 domain-containing protein 150.000%Swiss-Prot中等置信

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