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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G103460
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 26829934-26832625 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1707 bp · TkA08G103460|TK1151|cDNA

ATACATTATAAGATCCGCAGGGTGGGGGACTATGTCTCTGTTTATATATAAAACGACATCACTGCCCATCCACACTCTCTCATCCAACCAAAAGGAATCCCACCTCTCAACTCTTCTTCCTCCATATTTTCAACTCCTTCCATTTCTGCCACAATCTCCATCTTTGTACCTTCAAATCCTGCTTCCTTTTTCACCAATTCCTGTTAATCTCCCTTTGATCCGTTTCTGGCTTCACGGCGGCGTGTTTTGGCTGTGATGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

927 bp · TkA08G103460|TK1151|CDS

ATGGCAGCTCGAAGCTTTCTCTACGGTGGTGCTTCCGGTGGCGATGTCGGCGGTGGCGGCTCTGTTTTGCTGACAAACAAAAGGGTTCATTGTTCTTCTTCTCTTAACCCTGTTGATTCCTTCTTCGTCTCTCAATCGGCTTCTTTCCAGGGTTCTCGTTCAATACTTAGCTTTGAAGATAGAGGGAAGGGATCCGTGGGCCAAATTTTCCAGCCATTTGATCATGACGACAACGGAGATGATGAATACGATGAATACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

308 aa · TkA08G103460|TK1151|PROTEIN

MAARSFLYGGASGGDVGGGGSVLLTNKRVHCSSSLNPVDSFFVSQSASFQGSRSILSFEDRGKGSVGQIFQPFDHDDNGDDEYDEYFHQPEKKRRLTADQVRFLEKSFESDNKLEPERKIQLAKELGLQPRQVAIWFQNRRARWKTKQLEKDYDDLQESYNKLKANFENLVKEKEKLKSEVDELSDKLMIQEKGTSDSSSTKSPSEPQLCQPIPDCGYEEDLSKNMDPAYKPEGNLDVVFEGGDSSYIFEQEQSDVSLDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G103460
TK1151 IDTkA08G103460
OH-1004 IDLXL04_031371
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G103460
位置Chr08:26829934-26832625 (+)
描述Similar to HAT5: Homeobox-leucine zipper protein HAT5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01470 可能参与叶发育的转录激活子。
Ectopic expression of the Arabidopsis transcriptional activator Athb-1 alters leaf cell fate in tobacco.1995 · DOI: 10.1105/tpc.7.11.1773
At1g69780 可能作为蔗糖信号通路作用的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g15150 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0729700 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X980 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031371 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G01470
dosa:Os02g0729700
dosa:Os08g0416000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.979
排名 1 · TkA08G103460 · TK1151
细胞质0.086
排名 2 · TkA08G103460 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA08G103460 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA08G103460 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA08G103460 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24133DUF740084-105 aa
PF24850CC_BshC91-121 aa
PF00046Homeodomain92-145 aa
PF24655DUF764594-148 aa
PF01496V_ATPase_I97-196 aa
PF12709Fungal_TACC100-111 aa
PF20492ERM_helical104-119 aa
PF21074GDH_C107-180 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G103460PF24133DUF7400841050.1511.8
TkA08G103460PF24850CC_BshC911211.99.1
TkA08G103460PF00046Homeodomain921455e-1865.4
TkA08G103460PF24655DUF7645941480.1512.7
TkA08G103460PF01496V_ATPase_I971960.1410.8
TkA08G103460PF12709Fungal_TACC1001111.79.9
TkA08G103460PF20492ERM_helical1041190.01615.9
TkA08G103460PF21074GDH_C1071800.008816.0
TkA08G103460PF23177bHLH_IRO31111800.8110.8
TkA08G103460PF05920Homeobox_KN1161433.6e-0524.2
TkA08G103460PF25078DUF78011171900.2912.0
TkA08G103460PF30816CEP152_CC11331920.03413.2
TkA08G103460PF03961FapA1341870.999.7
TkA08G103460PF20492ERM_helical1381880.01615.9
TkA08G103460PF28280SsaO1381780.05614.5
TkA08G103460PF28231STB2_C1381850.05814.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q02283拟南芥sp|Q02283|HAT5_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT575.800%Swiss-Prot低置信
Q8LC03拟南芥sp|Q8LC03|ATB13_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-1370.400%Swiss-Prot低置信
Q00466拟南芥sp|Q00466|HAT7_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT777.100%Swiss-Prot低置信
Q6YWR4水稻sp|Q6YWR4|HOX16_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX1648.000%Swiss-Prot低置信
A2X980水稻sp|A2X980|HOX16_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX1658.300%Swiss-Prot低置信

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