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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G066520
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 17117953-17121524 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2076 bp · TkA08G066520|TK1151|cDNA

AGATTATAATGAAATTGACACTCGTACTTTATTGCCTTTATCACATTATCCGCATATCCAACAAAACCCCTCTTGACTCATGAAAAAGTGGGGCAAAAGATCGAAAATAGGAAAGGTGAAAGAAGAAGGGTGCATTTGTTCGTTTTGAAGAATCAAGATTCAAGATCAGATTTTTGGGCGTGCGATTTCTGTTTTTCCGACTTTAAATTAAACAAATAGCTTCCGAAGTCAGCAGATATATGTATCCAGTTGGAATTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

981 bp · TkA08G066520|TK1151|CDS

ATGGGATCAAATGGCCGTGGCGGTGGCGACGGCGACGCCGGTGACGATTCCCAATCCCAACTACCAAAATCACACGAATTGGCAAGACAAGGTTCGTTGTATAACCTAACTTTAGACGAGGTTCAACACCAATTAGGGGATCTCGGAAAACCCTTAACCAGTATGAACCTCGACGAGCTTCTTAAAAGCGTCTGGACAGCTGAAGCCAATCAAGTCACGACAGGTGGAGATGAGGCCGATTACACCCACCATGGTCAACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

326 aa · TkA08G066520|TK1151|PROTEIN

MGSNGRGGGDGDAGDDSQSQLPKSHELARQGSLYNLTLDEVQHQLGDLGKPLTSMNLDELLKSVWTAEANQVTTGGDEADYTHHGQPSLARQSSLNFSHDLRKRTVDEVWQDINKSNNNNKSKSNNNVDKKGTLGEMTLEDFLVKAGIVAGSSPLKKHQQNVNHHHHQQQQQQQWMQYQVAQIPPPPPQQQHVYMTGHHPVQQSLSGVGPMMDLGFHENTQMAISPSHLMHNLSHTQTPGRKRVNSGDVIEKTVERRQKR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G066520
TK1151 IDTkA08G066520
OH-1004 IDLXL04_018528
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.746
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G066520
位置Chr08:17117953-17121524 (+)
描述Similar to DPBF3: ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g56850 结合到胚胎特异性元件和 Dc3 基因启动子的 ABA 响应元件 (ABRE)。 暂无已核实直接文献
At2g41070 结合胚胎特异元件和Dc3基因启动子的ABA响应元件（ABRE），以及Em1基因启动子的ABRE。 暂无已核实直接文献
At1g49720 结合ABA响应元素（ABRE）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0859300 可能作为转录因子，在酵母中表现出转录激活活性。
A bZIP transcription factor, OsABI5, is involved in rice fertility and stress tolerance.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9298-4
Phosphorylation-mediated regulation of a rice ABA responsive element binding factor.2011 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2010.10.005
A rice orthologue of the ABA receptor, OsPYL/RCAR5, is a positive regulator of the ABA signal transduction pathway in seed germination and early seedling growth.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err338
Os02g0766700 介导脱落酸 信号传导的转录激活剂。
Characterization of OsbZIP23 as a key player of the basic leucine zipper transcription factor family for conferring abscisic acid sensitivity and salinity and drought tolerance in rice.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.128199
Feedback Regulation of ABA Signaling and Biosynthesis by a bZIP Transcription Factor Targets Drought-Resistance-Related Genes.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.00469
OsREM4.1 Interacts with OsSERK1 to Coordinate the Interlinking between Abscisic Acid and Brassinosteroid Signaling in Rice.2016 · DOI: 10.1016/j.devcel.2016.06.011
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018528 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0090332 stomatal closure 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G49720
ath:AT2G41070
ath:AT3G56850
dosa:Os01g0859300
dosa:Os02g0766700
osa:4325061
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.969
排名 1 · TkA08G066520 · TK1151
细胞质0.112
排名 2 · TkA08G066520 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA08G066520 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA08G066520 · TK1151
线粒体0.007
排名 5 · TkA08G066520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03131bZIP_Maf33-50 aa
PF17213Hydin_ADK90-189 aa
PF28121VPA1267112-174 aa
PF03131bZIP_Maf158-174 aa
PF28121VPA1267250-299 aa
PF07716bZIP_2253-301 aa
PF00170bZIP_1256-299 aa
PF03131bZIP_Maf256-301 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G066520PF03131bZIP_Maf33500.02116.1
TkA08G066520PF17213Hydin_ADK901890.7410.6
TkA08G066520PF28121VPA12671121741.110.2
TkA08G066520PF03131bZIP_Maf1581740.02116.1
TkA08G066520PF28121VPA12672502991.110.2
TkA08G066520PF07716bZIP_22533014.1e-1040.3
TkA08G066520PF00170bZIP_12562994.3e-1246.7
TkA08G066520PF03131bZIP_Maf2563010.02116.1
TkA08G066520PF17213Hydin_ADK2632860.7410.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LES3拟南芥sp|Q9LES3|AI5L2_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 250.900%Swiss-Prot高置信
Q9C5Q2拟南芥sp|Q9C5Q2|AI5L3_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 346.100%Swiss-Prot中等置信
Q9M7Q5拟南芥sp|Q9M7Q5|AI5L4_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 435.100%Swiss-Prot中等置信
Q8RZ35水稻sp|Q8RZ35|ABI5_ORYSJ bZIP transcription factor ABI5 homolog35.400%Swiss-Prot中等置信
Q6Z312水稻sp|Q6Z312|BZP23_ORYSJ bZIP transcription factor 2337.900%Swiss-Prot中等置信

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