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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G033820
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 8629803-8635767 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1652 bp · TkA08G033820|TK1151|cDNA

CTAGCATGACCATGCTGCAGCCAGCTGCATGCATCATGCATGCTTCTACCGAGTATATTCTCAGTGTCAAAGAATATAAATAAATAAATTAAAACCCTTATGTGAAACCTCCATAAAAACAAAACTCTTTGGATAAATCCTTTCGTTTCTAACCTTCAAACACTATTATGTCAAGCGATGGTGCTTCCGCTCCGATTGGTATTGGCGTTGCTGTTTTTGTCGTTGTTGTTGTGGTAAAGATAGGCATAATTATGTACGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

900 bp · TkA08G033820|TK1151|CDS

ATGGCGGAAGTGAGCACAATGGGAAGAACCCATCACTTTAATCTCGTTAGGCTTTATGGGTTTTGCTTTGAATCAAATTTACAAGCTCTTGTATACGAGTACATGGTCAACGGATCTTTGGACAATCACTTATTTAAAGCGAGCGAAGGACCAGTTATCGGGTTTGAGAAGCTACACGAGATTGCTCAGGGGACTGCTAGAGGAATATCCTACTTGCATGAAGAATGTCCTCAGAGAATCGTTCACTACGATATCAAACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

299 aa · TkA08G033820|TK1151|PROTEIN

MAEVSTMGRTHHFNLVRLYGFCFESNLQALVYEYMVNGSLDNHLFKASEGPVIGFEKLHEIAQGTARGISYLHEECPQRIVHYDIKPGNILLDSKFCAKVADFGLAKLCNRENTHITMTGGRGTPGYAAPELWLPLPVSHKCDVYSFGMLLFEIIGRRRNMDVRLGDNQQWFPICVWGKYEKKELKDLMVICGIEEKDYEVGERMVKVALCCVQYRPETRPEMSIVVKMLEGALLVPESIIRFSYLFSGVNETDGSLARM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G033820
TK1151 IDTkA08G033820
OH-1004 IDLXL04_018003
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)91.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 71.190
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G033820
位置Chr08:8629803-8635767 (-)
描述Similar to At1g34300: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g34300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g34300。 暂无已核实直接文献
At4g32300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD2-5。 暂无已核实直接文献
At5g38280 在体外具备激酶活性。
The PR5K receptor protein kinase from Arabidopsis thaliana is structurally related to a family of plant defense proteins.1996 · DOI: 10.1073/pnas.93.6.2598
At5g24080 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。 暂无已核实直接文献
At2g19130 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018003 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34300
ath:AT2G19130
ath:AT4G32300
ath:AT5G24080
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.524
排名 1 · TkA08G033820 · TK1151
细胞质0.408
排名 2 · TkA08G033820 · TK1151
细胞核0.251
排名 3 · TkA08G033820 · TK1151
高尔基体0.043
排名 4 · TkA08G033820 · TK1151
内质网0.041
排名 5 · TkA08G033820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1-230 aa
PF00069Pkinase2-225 aa
PF06734UL9732-95 aa
PF03109ABC157-112 aa
PF01636APH68-106 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G033820PF07714PK_Tyr_Ser-Thr12301.8e-35123.3
TkA08G033820PF00069Pkinase22259.9e-33114.4
TkA08G033820PF06734UL9732950.04813.6
TkA08G033820PF03109ABC1571120.02114.7
TkA08G033820PF01636APH681060.02615.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XID3拟南芥sp|Q9XID3|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g3430047.300%Swiss-Prot中等置信
Q8RWZ5拟南芥sp|Q8RWZ5|SD25_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-545.100%Swiss-Prot中等置信
Q9FF29拟南芥sp|Q9FF29|PR5K_ARATH PR5-like receptor kinase44.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FLV4拟南芥sp|Q9FLV4|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g2408045.400%Swiss-Prot中等置信
O64477拟南芥sp|O64477|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1913052.900%Swiss-Prot中等置信

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