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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G031200
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 7982891-7997741 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3060 bp · TkA08G031200|TK1151|cDNA

TACAAATTGCTCAAGTGAAATTTCACCAATCATTTGGTTTCAGGTCCCCAAAATAAATCCCACAAGCACATCCATAGAGTCGGTTGTGGAATCTTTAAAAGACTTGGTGAAATTTGTCAATCTCTTGATTTTAGGTCCATAAAATGAACTCCACATGTACGTCCGTTGATCAAGTTGAGAAAATCGTGGAGGAAATGAACCCCACAAGCACATCTGTAGAGTCAATTGTGGAATTTGTTGATAGTGTGAACTCTACAAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2811 bp · TkA08G031200|TK1151|CDS

ATGAACTCCACATGTACGTCCGTTGATCAAGTTGAGAAAATCGTGGAGGAAATGAACCCCACAAGCACATCTGTAGAGTCAATTGTGGAATTTGTTGATAGTGTGAACTCTACAAGCATATATGTTAGTCCAGTTGTAGAAATCGTAGTGGAAATGAACCCCACAAGCACATCCATAGATTCAGCCGTCGATTTTGTCCATAGAAAGAACTCTGCAAGTATTTCTATTGGTCCGGTTGTGAAAATCGTAGAGGAAATGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

936 aa · TkA08G031200|TK1151|PROTEIN

MNSTCTSVDQVEKIVEEMNPTSTSVESIVEFVDSVNSTSIYVSPVVEIVVEMNPTSTSIDSAVDFVHRKNSASISIGPVVKIVEEMNPTSISVDSVVESIHTMSSESMSVGRVEEIVQRMNSESTSVGPVEEIVEEMDSTSTPVAVVQIVESVHKLNSESTYVGPTDEIVEEMNPTYTSVDSVVESVHRMNSESTSGGLVEEIVEGMNPTSTSVDSVVKSVEELNPVTVDSTMELVHKINAASTFVGPIKSNTIPITNSE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G031200
TK1151 IDTkA08G031200
OH-1004 IDLXL04_018049
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 76.282 / OH-1004 99.408
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G031200
位置Chr08:7982891-7997741 (-)
描述Similar to ITN1: Ankyrin repeat-containing protein ITN1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018049 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G01680
ath:AT3G12360
dosa:Os01g0837000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.845
排名 1 · TkA08G031200 · TK1151
内质网0.085
排名 2 · TkA08G031200 · TK1151
细胞质0.080
排名 3 · TkA08G031200 · TK1151
细胞核0.041
排名 4 · TkA08G031200 · TK1151
溶酶体／液泡0.032
排名 5 · TkA08G031200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02609Exonuc_VII_S7-29 aa
PF02609Exonuc_VII_S81-98 aa
PF02609Exonuc_VII_S110-127 aa
PF02609Exonuc_VII_S130-143 aa
PF02609Exonuc_VII_S201-223 aa
PF13857Ank_5332-359 aa
PF00023Ank340-364 aa
PF13606Ank_3340-360 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G031200PF02609Exonuc_VII_S7290.9610.2
TkA08G031200PF02609Exonuc_VII_S81980.9610.2
TkA08G031200PF02609Exonuc_VII_S1101270.9610.2
TkA08G031200PF02609Exonuc_VII_S1301430.9610.2
TkA08G031200PF02609Exonuc_VII_S2012230.9610.2
TkA08G031200PF13857Ank_53323595e-0833.9
TkA08G031200PF00023Ank3403641.7e-0628.7
TkA08G031200PF13606Ank_33403604.6e-0627.2
TkA08G031200PF13637Ank_43413849.2e-0832.9
TkA08G031200PF12796Ank_23444342.3e-1351.2
TkA08G031200PF13857Ank_53733965e-0833.9
TkA08G031200PF13606Ank_33743914.6e-0627.2
TkA08G031200PF00023Ank3753881.7e-0628.7
TkA08G031200PF12796Ank_23784682.3e-1351.2
TkA08G031200PF13857Ank_54074515e-0833.9
TkA08G031200PF13637Ank_44084309.2e-0832.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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