TkA08G026080 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G026080

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 6684223-6687122 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2098 bp · TkA08G026080|TK1151|cDNA

TTTCTTGTAATGTGCAGTGTGTAAGAAGTAGGGCACGAAATGTTAGAGCAGTTACTGATTTTCACCAGAGGGGGATTAATCCTCTGGACATGCAAAGAGCTAGGAAACGCCCTAAGAGGATCACCAATCGACACCTTAATCCGTTCCTGCCTTTTGGAGGAGCGATCTGGCGCAGCTTCATACAACTATGATGTACCTGGAGTTTCCTACACTCTCAAATGGACATTCCACAATGAGCTAGGCCTCGTCTTTATTGCTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1050 bp · TkA08G026080|TK1151|CDS

ATGGCTGTTCCACAAGTTATTGAAGGTGAGAGTATGATGGACAAAGATGAGGTTGTTAGTAGTGATAGTGAAAGTGATGAAGATGATGAAGTGGAGACTGATAAGAAGGTGGATTCCAAGAAAAAAGGATGGTTTTCTTCCATGTTCCAAAGCATTGCTGGAAAGGCAAATTTGGAGAAGGCAGATCTTGAACCAGCTTTGAAGGCTCTAAAAGACAGGCTTATGACTAAGAACGTGGCTGAAGAGATTGCTGAGAAGCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

349 aa · TkA08G026080|TK1151|PROTEIN

MAVPQVIEGESMMDKDEVVSSDSESDEDDEVETDKKVDSKKKGWFSSMFQSIAGKANLEKADLEPALKALKDRLMTKNVAEEIAEKLCESVAISLVGKKLASFTRVSSTVQAAMEEALVRILTPRRSIDILRDVHVAKEQRKPYVVVFVGVNGVGKSTNLAKVAYWLQQHDINVMMAACDTFRSGAVEQLRTHARRLQIPIFEKGYEKDPAIVAKEAIQEATRNGSEVVLVDTAGRMQDNEPLMRALSKLIYVNSPDLVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G026080`
TK1151 ID	TkA08G026080
OH-1004 ID	LXL04_028261
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	96.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 41.966 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA08G026080`
位置	Chr08:6684223-6687122 (-)
描述	Similar to Srpra: Signal recognition particle receptor subunit alpha
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_028261` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006613 cotranslational protein targeting to membrane 生物过程 GO:0006614 SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane 生物过程 GO:0006617 SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition 生物过程 GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程 GO:0045047 protein targeting to ER 生物过程 GO:0050708 regulation of protein secretion 生物过程 GO:0005785 signal recognition particle receptor complex 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0012505 endomembrane system 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分 GO:0003723 RNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用	bta:281504 dme:Dmel_CG2522 hsa:6734 mmu:67398 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.516

排名 1 · TkA08G026080 · TK1151

质体0.158

排名 2 · TkA08G026080 · TK1151

细胞质0.131

排名 3 · TkA08G026080 · TK1151

过氧化物酶体0.087

排名 4 · TkA08G026080 · TK1151

细胞核0.079

排名 5 · TkA08G026080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00005ABC_tran8-79 aa

PF12820BRCT_assoc15-87 aa

PF02881SRP54_N45-113 aa

PF13207AAA_1748-89 aa

PF01583APS_kinase71-117 aa

PF00004AAA77-114 aa

PF02590SPOUT_MTase78-102 aa

PF13401AAA_2282-105 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G026080	`PF00005`	ABC_tran	8	79	0.18	13.1
TkA08G026080	`PF12820`	BRCT_assoc	15	87	1.1	9.8
TkA08G026080	`PF02881`	SRP54_N	45	113	2.4e-10	41.2
TkA08G026080	`PF13207`	AAA_17	48	89	0.00054	21.0
TkA08G026080	`PF01583`	APS_kinase	71	117	0.072	13.8
TkA08G026080	`PF00004`	AAA	77	114	0.17	13.0
TkA08G026080	`PF02590`	SPOUT_MTase	78	102	0.23	12.2
TkA08G026080	`PF13401`	AAA_22	82	105	1.3e-05	26.2
TkA08G026080	`PF13191`	AAA_16	82	122	0.036	15.3
TkA08G026080	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	124	180	8.8e-06	26.3
TkA08G026080	`PF06414`	Zeta_toxin	134	239	0.028	14.6
TkA08G026080	`PF18949`	DUF5693	137	176	0.0098	15.1
TkA08G026080	`PF13191`	AAA_16	137	197	0.036	15.3
TkA08G026080	`PF03193`	RsgA_GTPase	139	162	0.15	12.6
TkA08G026080	`PF13245`	AAA_19	140	264	0.012	16.5
TkA08G026080	`PF13401`	AAA_22	142	250	1.3e-05	26.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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