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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G407380
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 102461166-102462807 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

908 bp · TkA07G407380|TK1151|cDNA

ATTTTTAGTTGAGGTCAAAAGCGGACCTGATGGATTTGTGATTAAAATGAGAGATGGAAAGCATTTAAGATGTGCTCATAACAACCCTCAAGGTGGACATCTCCCTGATTATGCTCCACATCCTGCATTGTACTAAAGATGGAAGATGGAACTGGCCTTCTTCTTCCTATAATCGTTTTGGAGATGCCTAGTGTATTACTCATGGCAGCCATGCGCAATGTCCAAATTCCTAGGCCAACTATGTACAATGTGGTGAAGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

549 bp · TkA07G407380|TK1151|CDS

ATGGAAGATGGAACTGGCCTTCTTCTTCCTATAATCGTTTTGGAGATGCCTAGTGTATTACTCATGGCAGCCATGCGCAATGTCCAAATTCCTAGGCCAACTATGTACAATGTGGTGAAGGAGATGATTGATAAAATGGGCTATAAGGTCAAACTCGTTCGTGTAACAAAGAGAATACACGAGGCGTATTTTGCTCGATTATATCTCACAAAGGTGGATGATGAAAATGACTCTGTTAGCTTTGACCTTCGCCCCTCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

182 aa · TkA07G407380|TK1151|PROTEIN

MEDGTGLLLPIIVLEMPSVLLMAAMRNVQIPRPTMYNVVKEMIDKMGYKVKLVRVTKRIHEAYFARLYLTKVDDENDSVSFDLRPSDAINIAVRCKVPIQVNRYLAQSDGMKVVESAKLSFQGSPDGLIFKELDRPSGQPCIETKEFNLVRNMLIAAVEERYRDAAQWRDKLTQFRSKKNWA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G407380
TK1151 IDTkA07G407380
OH-1004 IDLXL04_030493
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 57.233
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G407380
位置Chr07:102461166-102462807 (-)
描述Similar to BBD2: Bifunctional nuclease 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g19660 具有 RNase 和 DNase 活性的双功能核酸酶。 暂无已核实直接文献
At1g75380 具有 RNase 和 DNase 活性的双功能核酸酶。
Novel bifunctional nucleases, OmBBD and AtBBD1, are involved in abscisic acid-mediated callose deposition in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.147645

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0357000 具有 RNase 和 DNase 活性的双功能核酸酶。 暂无已核实直接文献
Os01g0702000 具有 RNase 和 DNase 活性的双功能核酸酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030493 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0030891 VCB complex 细胞组分
GO:0004518 nuclease activity 分子功能
GO:0004530 deoxyribonuclease I activity 分子功能
GO:0004540 RNA nuclease activity 分子功能
GO:0016787 hydrolase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19660
ath:AT1G75380
dosa:Os01g0702000
dosa:Os08g0357000
osa:4326932
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.517
排名 1 · TkA07G407380 · TK1151
细胞质0.395
排名 2 · TkA07G407380 · TK1151
线粒体0.068
排名 3 · TkA07G407380 · TK1151
细胞膜0.056
排名 4 · TkA07G407380 · TK1151
内质网0.041
排名 5 · TkA07G407380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02577BFN_dom6-112 aa
PF02151UVR38-46 aa
PF02151UVR149-176 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G407380PF02577BFN_dom61125.9e-2278.4
TkA07G407380PF02151UVR38460.01116.2
TkA07G407380PF02151UVR1491760.01116.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93VH2拟南芥sp|Q93VH2|BBD2_ARATH Bifunctional nuclease 275.600%Swiss-Prot高置信
Q9FWS6拟南芥sp|Q9FWS6|BBD1_ARATH Bifunctional nuclease 172.400%Swiss-Prot高置信
Q6YZM6水稻sp|Q6YZM6|BBD2_ORYSJ Bifunctional nuclease 272.700%Swiss-Prot高置信
Q5N8J3水稻sp|Q5N8J3|BBD1_ORYSJ Bifunctional nuclease 161.500%Swiss-Prot高置信

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