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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G358790
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 89898411-89901677 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2728 bp · TkA07G358790|TK1151|cDNA

GGGTGATGTTTTATCATTATTATTATCATTATTATAAACATCGTCTTATTCATGGGTAAATCTAGACCTCCATACTCCAAATTATGTAAAGAATCAAATGTGAAGCTCACTACACCTCCAATGGCAGCCACCTTCATCTTACACCTCTTCTTCCTCATACAATCTCTCCAAATCCACTATTCTGATTCTCAATCTCTCCAATCTCTACAAACTCTATTTACCACTTTCAATGCAAGAGGTACAAGTAATTACTGCCCGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2466 bp · TkA07G358790|TK1151|CDS

ATGGGTAAATCTAGACCTCCATACTCCAAATTATGTAAAGAATCAAATGTGAAGCTCACTACACCTCCAATGGCAGCCACCTTCATCTTACACCTCTTCTTCCTCATACAATCTCTCCAAATCCACTATTCTGATTCTCAATCTCTCCAATCTCTACAAACTCTATTTACCACTTTCAATGCAAGAGGTACAAGTAATTACTGCCCGAGTAGTACTAGCAGCAGTGTCGCCATCAACCTTCCTACATTCATTCCAAACTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

821 aa · TkA07G358790|TK1151|PROTEIN

MGKSRPPYSKLCKESNVKLTTPPMAATFILHLFFLIQSLQIHYSDSQSLQSLQTLFTTFNARGTSNYCPSSTSSSVAINLPTFIPNSSLTLICYNNIITQLHITGNNKNNFDHENLSTESFFNTISTIFPGLKVLSLVSLSLNGPLPASVLANSVSSLEILNVSSNCFHGDIPFELSYLKNLHTLVLDHNNFSGPVPDWIGYKLSSLTVLSFKNNSLDGYLPFSLARLVSLRVLDLSRNQLSGDVPVDFKNLTNLQVFDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G358790
TK1151 IDTkA07G358790
OH-1004 IDLXL04_011496
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)34.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 86.236 / OH-1004 90.350
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G358790
位置Chr07:89898411-89901677 (+)
描述Similar to At1g14390: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g14390
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g03770 可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At3g03770。 暂无已核实直接文献
At1g14390 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g14390。 暂无已核实直接文献
At2g02780 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g02780。 暂无已核实直接文献
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
A receptor-like kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the inhibition of cellulose synthesis.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.018
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011496 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005496 steroid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14390
ath:AT2G02780
ath:AT3G03770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.848
排名 1 · TkA07G358790 · TK1151
内质网0.084
排名 2 · TkA07G358790 · TK1151
细胞质0.068
排名 3 · TkA07G358790 · TK1151
细胞核0.060
排名 4 · TkA07G358790 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA07G358790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30986E6-like27-97 aa
PF12799LRR_430-58 aa
PF23598LRR_1436-94 aa
PF13516LRR_695-107 aa
PF12799LRR_498-107 aa
PF00560LRR_199-112 aa
PF13855LRR_8100-109 aa
PF12799LRR_4123-142 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G358790PF30986E6-like27970.4511.5
TkA07G358790PF12799LRR_430581.4e-1454.5
TkA07G358790PF23598LRR_1436942.2e-0730.7
TkA07G358790PF13516LRR_6951070.01516.0
TkA07G358790PF12799LRR_4981071.4e-1454.5
TkA07G358790PF00560LRR_1991123.7e-1759.5
TkA07G358790PF13855LRR_81001091.6e-1557.3
TkA07G358790PF12799LRR_41231421.4e-1454.5
TkA07G358790PF23598LRR_141292632.2e-0730.7
TkA07G358790PF00560LRR_11321493.7e-1759.5
TkA07G358790PF24758LRR_At5g563701351920.1412.6
TkA07G358790PF13855LRR_81461921.6e-1557.3
TkA07G358790PF00560LRR_11571793.7e-1759.5
TkA07G358790PF12799LRR_41571971.4e-1454.5
TkA07G358790PF13516LRR_61571690.01516.0
TkA07G358790PF13516LRR_61801930.01516.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LFN2拟南芥sp|Q8LFN2|Y3037_ARATH Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g0377050.100%Swiss-Prot高置信
Q9M9S4拟南芥sp|Q9M9S4|Y1143_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1439032.700%Swiss-Prot中等置信
C0LGJ9拟南芥sp|C0LGJ9|Y2278_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g0278035.800%Swiss-Prot低置信
Q9LK35拟南芥sp|Q9LK35|THE1_ARATH Receptor-like protein kinase THESEUS 132.100%Swiss-Prot低置信
Q3E8W4拟南芥sp|Q3E8W4|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR230.900%Swiss-Prot低置信

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