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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G010020
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 2749268-2754051 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3680 bp · TkA07G010020|TK1151|cDNA

TAGAACATTTTCTGTATCTTTTGGTAAATCACGTCTCTCTTAATATATAGTTCCTTTCCTTGAGTACTCAAACCACATAAACTCTATCTCAACAAATCAAAACACAGATGGCATCTTCATCCTCGACTTCTCCTTCTGCTCCGGCCTTTTCTTCTCGATCATGGAAGCAACATGTTTTTCTTAGCTTTAGAGGAGAAGATACCCGCAACAATTTTGTCGGTCATCTTTACACAGCTCTTGAAAATATGGGAATCCATACT...

CDS

下载 CDS FASTA

3225 bp · TkA07G010020|TK1151|CDS

ATGGCATCTTCATCCTCGACTTCTCCTTCTGCTCCGGCCTTTTCTTCTCGATCATGGAAGCAACATGTTTTTCTTAGCTTTAGAGGAGAAGATACCCGCAACAATTTTGTCGGTCATCTTTACACAGCTCTTGAAAATATGGGAATCCATACTTACAAGGATGACAAAAAACTTTCTTTGGGCGAAGAGATTAGTAGGTCCCTTACAGAGGCGATTGAGCAATCACAAATTGCTATTATCGTATTCTCTGAAAAGTATGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1074 aa · TkA07G010020|TK1151|PROTEIN

MASSSSTSPSAPAFSSRSWKQHVFLSFRGEDTRNNFVGHLYTALENMGIHTYKDDKKLSLGEEISRSLTEAIEQSQIAIIVFSEKYADSSWCLNELRHVMKCRKERGLIVVPLFYGVEPFEVRKQKRKYGEAFSKYELENKTNVASWREALVEASGNSGQDFKSTNMDESELIKNIVNKISKMIRPLTPRVKDNLVGIEARMDALISKLQIGSDCVLMIGIWGVGGGGKTTLATSVYGRISCEFDGCCCIENIREESRKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G010020
TK1151 IDTkA07G010020
OH-1004 IDLXL04_026838
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G010020
位置Chr07:2749268-2754051 (-)
描述Similar to N: TMV resistance protein N
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g12010 参与植物防御的 TIR-NB-LRR 受体样蛋白。
Matching NLR Immune Receptors to Autoimmunity in camta3 Mutants Using Antimorphic NLR Alleles.2017 · DOI: 10.1016/j.chom.2017.03.005

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026838 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G12010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.419
排名 1 · TkA07G010020 · TK1151
细胞质0.313
排名 2 · TkA07G010020 · TK1151
细胞核0.284
排名 3 · TkA07G010020 · TK1151
内质网0.087
排名 4 · TkA07G010020 · TK1151
质体0.050
排名 5 · TkA07G010020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01582TIR22-198 aa
PF13676TIR_223-119 aa
PF01990ATP-synt_F42-89 aa
PF08937ThsB_TIR60-111 aa
PF00931NB-ARC199-365 aa
PF08937ThsB_TIR284-304 aa
PF13855LRR_8426-443 aa
PF23282WHD_ROQ1438-504 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G010020PF01582TIR221982.7e-47161.6
TkA07G010020PF13676TIR_2231197.4e-1762.7
TkA07G010020PF01990ATP-synt_F42890.2912.2
TkA07G010020PF08937ThsB_TIR601110.01216.7
TkA07G010020PF00931NB-ARC1993655.6e-2072.3
TkA07G010020PF08937ThsB_TIR2843040.01216.7
TkA07G010020PF13855LRR_84264431.6e-0731.7
TkA07G010020PF23282WHD_ROQ14385044.8e-1969.0
TkA07G010020PF25019LRR_R13L1-DRL216056422.1e-0525.1
TkA07G010020PF23598LRR_146118090.00118.7
TkA07G010020PF12799LRR_46126519.7e-0935.9
TkA07G010020PF13855LRR_86306681.6e-0731.7
TkA07G010020PF23286LRR_136346690.01515.8
TkA07G010020PF00560LRR_16366560.1812.7
TkA07G010020PF23622LRR_At1g61320_AtMIF16377360.1712.0
TkA07G010020PF24758LRR_At5g563706436430.4310.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZ66拟南芥sp|Q9SZ66|DSC1_ARATH Disease resistance-like protein DSC134.900%Swiss-Prot中等置信

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