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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G002890
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 780027-783839 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2302 bp · TkA07G002890|TK1151|cDNA

AGAGATATCTAAATATAGAAAGAATGAAGATGATCAAAGGGTTTGCAATGGCGGTGTTTGTAGGGTACCTTTTCCTATGGGTGATAACTCCAACCTACGTCTTCAAGCAAAAGTGGCTCGTTAGGGTTCGAGCCCACACTGCTTCTACTTACTTTGGAACTCAAGGTCCATCGATGTTACTCTATACATTTCCTATTCTCTTGATGGCTGTTGCCGGGAGTATATATCTCCATTTGAAGAAAAAGTCGAACCAAAACCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2097 bp · TkA07G002890|TK1151|CDS

ATGAAGATGATCAAAGGGTTTGCAATGGCGGTGTTTGTAGGGTACCTTTTCCTATGGGTGATAACTCCAACCTACGTCTTCAAGCAAAAGTGGCTCGTTAGGGTTCGAGCCCACACTGCTTCTACTTACTTTGGAACTCAAGGTCCATCGATGTTACTCTATACATTTCCTATTCTCTTGATGGCTGTTGCCGGGAGTATATATCTCCATTTGAAGAAAAAGTCGAACCAAAACCGGGATCAAGGGCAAAAAGAAGCCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

698 aa · TkA07G002890|TK1151|PROTEIN

MKMIKGFAMAVFVGYLFLWVITPTYVFKQKWLVRVRAHTASTYFGTQGPSMLLYTFPILLMAVAGSIYLHLKKKSNQNRDQGQKEATNDNLTIWRRPMIVKTLGIVTKIELAFFIMFIALLTWSFTEYLHLSLAKVTPQSAALYGEKIWEAKLATVGLQFGLIGNICLAFMFYPVTRGSSLLPLFGLTSEASVKYHIWLGHIVMTLFTSHGVCYIICWIATKQTSEMLNWAKTDISVVAGEVTLVAGLVMWATTFPKIRR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G002890
TK1151 IDTkA07G002890
OH-1004 IDLXL04_026707
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.713 / OH-1004 89.345
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G002890
位置Chr07:780027-783839 (+)
描述Similar to FRO2: Ferric reduction oxidase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g01580 黄素细胞色素，可跨质膜转移电子，还原三价铁螯合物，在根际形成可溶性二价铁。
A ferric-chelate reductase for iron uptake from soils.1999 · DOI: 10.1038/17800
Overexpression of the FRO2 ferric chelate reductase confers tolerance to growth on low iron and uncovers posttranscriptional control.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.025122
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
The FRO2 ferric reductase is required for glycine betaine's effect on chilling tolerance in Arabidopsis roots.2008 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2008.01141.x
At1g23020 铁螯合还原酶参与根中铁的还原。
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
At1g01590 参与根部铁还原的铁螯合物还原酶（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
At5g23980 三价铁螯合物还原酶。
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
Transcriptome sequencing identifies SPL7-regulated copper acquisition genes FRO4/FRO5 and the copper dependence of iron homeostasis in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.090431
At5g23990 铁螯合还原酶可能参与芽中铁的还原。
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
Transcriptome sequencing identifies SPL7-regulated copper acquisition genes FRO4/FRO5 and the copper dependence of iron homeostasis in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.090431

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026707 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0033212 iron import into cell 生物过程
GO:0033214 siderophore-iron import into cell 生物过程
GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分
GO:0000293 ferric-chelate reductase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0140618 ferric-chelate reductase (NADH) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01580
ath:AT1G01590
ath:AT1G23020
ath:AT5G23980
ath:AT5G23990
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.588
排名 1 · TkA07G002890 · TK1151
内质网0.152
排名 2 · TkA07G002890 · TK1151
溶酶体／液泡0.132
排名 3 · TkA07G002890 · TK1151
细胞质0.080
排名 4 · TkA07G002890 · TK1151
高尔基体0.068
排名 5 · TkA07G002890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17870Insulin_TMD16-30 aa
PF10066DUF230447-79 aa
PF17870Insulin_TMD56-74 aa
PF08030NAD_binding_667-95 aa
PF10066DUF2304101-132 aa
PF01794Ferric_reduct160-281 aa
PF10066DUF2304243-288 aa
PF17870Insulin_TMD274-288 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G002890PF17870Insulin_TMD16301.010.2
TkA07G002890PF10066DUF230447791.59.8
TkA07G002890PF17870Insulin_TMD56741.010.2
TkA07G002890PF08030NAD_binding_667951.1e-2384.7
TkA07G002890PF10066DUF23041011321.59.8
TkA07G002890PF01794Ferric_reduct1602813.7e-2072.9
TkA07G002890PF10066DUF23042432881.59.8
TkA07G002890PF17870Insulin_TMD2742881.010.2
TkA07G002890PF08022FAD_binding_83144108.1e-2587.7
TkA07G002890PF00970FAD_binding_63303980.2312.6
TkA07G002890PF08030NAD_binding_64196821.1e-2384.7
TkA07G002890PF00175NAD_binding_14234700.0001523.1
TkA07G002890PF01794Ferric_reduct5275683.7e-2072.9
TkA07G002890PF17870Insulin_TMD5405491.010.2
TkA07G002890PF00175NAD_binding_16546760.0001523.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P92949拟南芥sp|P92949|FRO2_ARATH Ferric reduction oxidase 256.200%Swiss-Prot高置信
F4I4K7拟南芥sp|F4I4K7|FRO3_ARATH Ferric reduction oxidase 3, mitochondrial54.000%Swiss-Prot高置信
Q9LMM2拟南芥sp|Q9LMM2|FRO1_ARATH Probable ferric reduction oxidase 153.200%Swiss-Prot高置信
Q8W110拟南芥sp|Q8W110|FRO4_ARATH Ferric reduction oxidase 447.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FLW2拟南芥sp|Q9FLW2|FRO5_ARATH Ferric reduction oxidase 546.600%Swiss-Prot中等置信

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