TkA06G466180 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G466180

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 115338551-115342410 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1958 bp · TkA06G466180|TK1151|cDNA

TAAGGAATGAATGATTGGCCTTTTTCAGGTTTACACACCTTTGACCAGAGGGAGAGAGATTTGGTTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGAGAGAAACACAGAGATTTAGAGAGAGAAAGTTGAAGAAGAAGGTGGGGGAGGGTTGCGTGTGGTGTCGCGAGTTCCTCCTCCCCGGCGGTGGTGGTGAAAGAGTGATTGAAGTTTGGGAGGTTTTAGAGAAAGTGTGATTTCTAGTTCTAGAGAGAGAAAGGGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1401 bp · TkA06G466180|TK1151|CDS

ATGAATGTGATGCGTCGTCTGAAGAGTATCGCTTCTGGTCGTTCGTCCGTTTCAGATCCTGGTGGAGATTCCAGCATTAAAAGAGTAAAAGTCGAGCAAGAAGTAGAATCACATGTTATTGATGAACCACAATCAGTAGAAAAGACTACCACGAGTGTAGAACAGCAGCCCATGGATGCTACTGCCGAAATGTCTGCAAGTACATCCAACACATCTTCTATTCCAAAACCTGAAAAATCCGACTATGACGAGCTTCCAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

466 aa · TkA06G466180|TK1151|PROTEIN

MNVMRRLKSIASGRSSVSDPGGDSSIKRVKVEQEVESHVIDEPQSVEKTTTSVEQQPMDATAEMSASTSNTSSIPKPEKSDYDELPKEMHEMKIKEDKSEDKEIEATVVNGNGPEKGQVIVTTVGGRNGQPKQTLSYMAERVVGTGSFGVVFEAKCLETGESVAIKKVLQDKRYKNRELQIMRLLDHPNVVPLKNCFYSTTEKNEVYLNVVLEYVPETVYRVSRHYSRMTHQIPLIYVQLYTYQICRALNYIHSVIGVCH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G466180`
TK1151 ID	TkA06G466180
OH-1004 ID	LXL04_022681
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G466180

位置 Chr06:115338551-115342410 (+)

描述 Similar to ASK8: Shaggy-related protein kinase theta

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g00720`	可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。	暂无已核实直接文献
`At5g14640`	可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。	暂无已核实直接文献
`At5g26751`	可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。	暂无已核实直接文献
`At3g05840`	可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022681 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程

GO:0009933 meristem structural organization 生物过程

GO:0016310 phosphorylation 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G05840

ath:AT4G00720

ath:AT5G14640

ath:AT5G26751

bna:106388722

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.752

排名 1 · TkA06G466180 · TK1151

细胞质0.375

排名 2 · TkA06G466180 · TK1151

细胞膜0.039

排名 3 · TkA06G466180 · TK1151

线粒体0.035

排名 4 · TkA06G466180 · TK1151

内质网0.019

排名 5 · TkA06G466180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01633Choline_kinase37-94 aa

PF14531Kinase-like128-180 aa

PF03109ABC1130-167 aa

PF00069Pkinase138-421 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr140-335 aa

PF01636APH176-222 aa

PF05445Pox_ser-thr_kin215-279 aa

PF14531Kinase-like240-327 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G466180	`PF01633`	Choline_kinase	37	94	0.0067	16.5
TkA06G466180	`PF14531`	Kinase-like	128	180	0.016	15.2
TkA06G466180	`PF03109`	ABC1	130	167	1.8e-05	24.8
TkA06G466180	`PF00069`	Pkinase	138	421	1.3e-61	209.0
TkA06G466180	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	140	335	1.1e-23	84.6
TkA06G466180	`PF01636`	APH	176	222	0.1	13.1
TkA06G466180	`PF05445`	Pox_ser-thr_kin	215	279	0.041	13.6
TkA06G466180	`PF14531`	Kinase-like	240	327	0.016	15.2
TkA06G466180	`PF01633`	Choline_kinase	242	283	0.0067	16.5
TkA06G466180	`PF03109`	ABC1	244	288	1.8e-05	24.8
TkA06G466180	`PF01636`	APH	256	283	0.1	13.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q96287`	拟南芥	sp\|Q96287\|KSG8_ARATH Shaggy-related protein kinase theta	74.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q8VZD5`	拟南芥	sp\|Q8VZD5\|KSG5_ARATH Shaggy-related protein kinase epsilon	79.700%	Swiss-Prot	高置信
`P43288`	拟南芥	sp\|P43288\|KSG1_ARATH Shaggy-related protein kinase alpha	79.400%	Swiss-Prot	高置信
`P43289`	拟南芥	sp\|P43289\|KSG3_ARATH Shaggy-related protein kinase gamma	78.200%	Swiss-Prot	高置信

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