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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G456820
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 112901713-112905819 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2477 bp · TkA06G456820|TK1151|cDNA

TCAACGACAAGCTGTTTTAACCTTGTGACGATTTACAGATTTCACACCGTGTATGTCTTCGCATGTGACTTTTGTCAGTTTCTCTGCCAAACATTTCAAATTCTCTCTCAAAAACCACACTCATTCCCTTCTTCACTTCATCTTCAAACTCCCAAAACCACAAATCCTTCCCTCAAAAACACCATGAAAACACTTCTTCTCGTCGTTCTTCTTCTTTTCGCTCACTCATTACAAACCCTAGCTAAAACTCAAGAAACCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2244 bp · TkA06G456820|TK1151|CDS

TCAACGACAAGCTGTTTTAACCTTGTGACGATTTACAGATTTCACACCGTGTATGTCTTCGCATGTGACTTTTGTCAGTTTCTCTGCCAAACATTTCAAATTCTCTCTCAAAAACCACACTCATTCCCTTCTTCACTTCATCTTCAAACTCCCAAAACCACAAATCCTTCCCTCAAAAACACCATGAAAACACTTCTTCTCGTCGTTCTTCTTCTTTTCGCTCACTCATTACAAACCCTAGCTAAAACTCAAGAAACCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

747 aa · TkA06G456820|TK1151|PROTEIN

STTSCFNLVTIYRFHTVYVFACDFCQFLCQTFQILSQKPHSFPSSLHLQTPKTTNPSLKNTMKTLLLVVLLLFAHSLQTLAKTQETPTSELPALIKIKSILDPNGETLTSWSPNTASYCDGTFEGVACDELGKVMNISLQGKGLFGQIPPEIGQLKSLSGLYLHFNGLNGEIPKEIGELTQLTDLYLNVNNLSGEIPPELEKMENLRVLQLCYNQLTGSLPTQLGSLKKLNVLAVQYNQLTGAIPATLGNLGTLERLDLS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G456820
TK1151 IDTkA06G456820
OH-1004 IDLXL04_022738
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.203
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G456820
位置Chr06:112901713-112905819 (+)
描述Similar to NIK2: Protein NSP-INTERACTING KINASE 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g16670 冷冻耐受的负调控因子，通过磷酸化14-3-3蛋白（例如GRF6）触发其从细胞质转移到细胞核以应对冷胁迫。 暂无已核实直接文献
At3g25560 受体激酶，与其他CIK（如CIK1、CIK2、CIK3、CIK5和CIK6）冗余作用，作为CLV1、CLV2/CRN和RPK2的共受体，并且需要通过磷酸化介导CLAVATA家族肽（如CLV3、CLE25、CLE26和CLE45）信号；该信号调控原韧皮部分化及维持茎尖分生组织（SAM）和根尖分生组织（RAM）的稳态，并作用于BRX和OPS下游。 暂无已核实直接文献
At1g70530 富半胱氨酸受体样蛋白激酶3。 暂无已核实直接文献
At1g60800 受体激酶，与其他CIK（如CIK1、CIK2、CIK3、CIK5和CIK6）冗余作用，作为CLV1、CLV2/CRN和RPK2的共受体，并需要通过磷酸化介导CLAVATA家族肽（如CLV3）信号；该信号调控原韧皮部分化以及维持芽顶分生组织（SAM）和根顶分生组织（RAM）稳态，并在BRX和OPS下游发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g63710 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g63710。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022738 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048638 regulation of developmental growth 生物过程
GO:1901653 cellular response to peptide 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G25560
ath:AT3G56100
ath:AT5G07280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.859
排名 1 · TkA06G456820 · TK1151
内质网0.088
排名 2 · TkA06G456820 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkA06G456820 · TK1151
细胞核0.056
排名 4 · TkA06G456820 · TK1151
溶酶体／液泡0.023
排名 5 · TkA06G456820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27852Opalin63-75 aa
PF08263LRRNT_289-129 aa
PF13855LRR_8136-192 aa
PF00560LRR_1137-155 aa
PF23598LRR_14146-260 aa
PF00560LRR_1157-179 aa
PF12799LRR_4157-196 aa
PF00560LRR_1182-203 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G456820PF27852Opalin63750.2812.0
TkA06G456820PF08263LRRNT_2891294.8e-0730.7
TkA06G456820PF13855LRR_81361925.4e-1142.8
TkA06G456820PF00560LRR_11371556.7e-1552.7
TkA06G456820PF23598LRR_141462601.5e-1247.7
TkA06G456820PF00560LRR_11571796.7e-1552.7
TkA06G456820PF12799LRR_41571961.3e-0629.1
TkA06G456820PF00560LRR_11822036.7e-1552.7
TkA06G456820PF00560LRR_12052276.7e-1552.7
TkA06G456820PF13855LRR_82052645.4e-1142.8
TkA06G456820PF12799LRR_42052411.3e-0629.1
TkA06G456820PF00560LRR_12302516.7e-1552.7
TkA06G456820PF12799LRR_42312681.3e-0629.1
TkA06G456820PF23598LRR_142432991.5e-1247.7
TkA06G456820PF00560LRR_12542706.7e-1552.7
TkA06G456820PF13855LRR_82762895.4e-1142.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93YN1拟南芥sp|Q93YN1|CRPK1_ARATH Cold-responsive protein kinase 134.500%Swiss-Prot低置信
Q8RY65拟南芥sp|Q8RY65|CIK6_ARATH Protein CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE 630.800%Swiss-Prot中等置信
Q9CAL2拟南芥sp|Q9CAL2|CRK3_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 333.200%Swiss-Prot低置信
Q93ZS4拟南芥sp|Q93ZS4|CIK1_ARATH Protein CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE 134.300%Swiss-Prot低置信
Q8W4S5拟南芥sp|Q8W4S5|Y5371_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g6371035.100%Swiss-Prot低置信

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