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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G276870
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 70109184-70113219 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1168 bp · TkA06G276870|TK1151|cDNA

ATGATCGCTATAGAAATCTGAAGGAGAAACGTATAACGATCAAGATGGCTACACTGATAATTCCAGCGGTGTTATCCTCTCCTCGTGATGATGCAATGCAATTATACAAGGCTTTCAAGGGTTGGGGATGTGACACTATAGCTATCATTGGTATTCTGGCCCATCGTGATGCATCACAGCGTGCTCTGATCGAACAAGAATATAAAGTTATGTACTCCGAAGAAATGACCAAACGTCTGTCTTCAGAGCTCAGTGGAGAT...

948 bp · TkA06G276870|TK1151|CDS

ATGGCTACACTGATAATTCCAGCGGTGTTATCCTCTCCTCGTGATGATGCAATGCAATTATACAAGGCTTTCAAGGGTTGGGGATGTGACACTATAGCTATCATTGGTATTCTGGCCCATCGTGATGCATCACAGCGTGCTCTGATCGAACAAGAATATAAAGTTATGTACTCCGAAGAAATGACCAAACGTCTGTCTTCAGAGCTCAGTGGAGATGTTAAGAAAGCAATGTTACTTTGGATGCCTGATCCAGCACGAAG...

315 aa · TkA06G276870|TK1151|PROTEIN

MATLIIPAVLSSPRDDAMQLYKAFKGWGCDTIAIIGILAHRDASQRALIEQEYKVMYSEEMTKRLSSELSGDVKKAMLLWMPDPARRDAIILREALTTNIDLKAATEVVCSRTPSQLYHLKQLYVAHFGDYLEHDIQSQASGDHEKLLIAYITMPRSEGPEVDMTVVEKDAKALFKAGEKRLGTDEKTFRTIFTERSRPHMAAVSVSYKDMFGNSLKKAIKSETSGNFEYALVTILQSAENPAKYFAKVLRKAMKGLGTD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G276870
TK1151 IDTkA06G276870
OH-1004 IDLXL04_023595
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G276870
位置Chr06:70109184-70113219 (+)
描述Similar to ANN5: Annexin D5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68090 胞外膜联蛋白 D5。 暂无已核实直接文献
At5g65020 可能介导种苗发育过程中高尔基体来源囊泡的调控性定向分泌。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_023595 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009639 response to red or far red light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0042997 negative regulation of Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程
GO:0042998 positive regulation of Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程
GO:0005615 extracellular space 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68090
ath:AT5G10220
ath:AT5G10230
hsa:312
mmu:69787
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.519
排名 1 · TkA06G276870 · TK1151
细胞膜0.305
排名 2 · TkA06G276870 · TK1151
细胞核0.191
排名 3 · TkA06G276870 · TK1151
细胞外0.138
排名 4 · TkA06G276870 · TK1151
线粒体0.049
排名 5 · TkA06G276870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10073GapR_DNA-bd15-53 aa
PF00191Annexin16-79 aa
PF24360DUF751649-65 aa
PF29000Retr_N49-82 aa
PF22338Pyruv_OxRed_insertion61-81 aa
PF00191Annexin88-150 aa
PF24360DUF7516107-134 aa
PF10073GapR_DNA-bd161-198 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G276870PF10073GapR_DNA-bd15530.04314.1
TkA06G276870PF00191Annexin16791.6e-77256.3
TkA06G276870PF24360DUF751649650.212.5
TkA06G276870PF29000Retr_N49820.2812.0
TkA06G276870PF22338Pyruv_OxRed_insertion61810.1213.3
TkA06G276870PF00191Annexin881501.6e-77256.3
TkA06G276870PF24360DUF75161071340.212.5
TkA06G276870PF10073GapR_DNA-bd1611980.04314.1
TkA06G276870PF00191Annexin1702351.6e-77256.3
TkA06G276870PF24360DUF75162042190.212.5
TkA06G276870PF22338Pyruv_OxRed_insertion2122260.1213.3
TkA06G276870PF09840DUF20672172750.1112.8
TkA06G276870PF00191Annexin2453101.6e-77256.3
TkA06G276870PF10073GapR_DNA-bd2532730.04314.1
TkA06G276870PF24360DUF75162712970.212.5
TkA06G276870PF29000Retr_N2743000.2812.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C9X3拟南芥sp|Q9C9X3|ANXD5_ARATH Annexin D556.800%Swiss-Prot高置信
Q9XEE2拟南芥sp|Q9XEE2|ANXD2_ARATH Annexin D239.400%Swiss-Prot中等置信

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