TkA06G147380 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G147380

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 38690491-38694946 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3852 bp · TkA06G147380|TK1151|cDNA

CTCGCTTCCCTCATATCTCTCCGTCACAAAACAATGCACGAAAAGTTCGGATCTTCGCCATCAATTTTAAATCTCCGGAGCTGATTACATTTTGCTCTTTGATTTACACGAAGCAATCAAGCATTTTTCTATTTCGCTTACCTTGTTTGATGAACGTAGATTAAGAAGACGACGTTTGCTCTTATTTTCCTCGTTCATGTTTGAGGAATTCCAAGTGAGATTCACGGAGGCTTGTTCAGATGCATATTGTCACTCCCTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

3036 bp · TkA06G147380|TK1151|CDS

ATGGAGAATTATTTGAATCAGAATTTCCACGCAGTGAAGTCCAAACATTCTTCAGAAGAGGTGCTACAGAAATGGAGGGGTCTGTGTCATATCGTCAAGAACCCTAAGCGACGGTTTCGTCACACCGCCAACATAGTCAAGCGCAATGAGGCTGCTGCTATGCGGCGTACAAATCAGGAGAAGTTAAGGATCGCGGTTCTGGTGTCAAAGGCTGCATTTCAATTCATACAAGGAGCACATACCGGCGACTACAAGGTCCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1011 aa · TkA06G147380|TK1151|PROTEIN

MENYLNQNFHAVKSKHSSEEVLQKWRGLCHIVKNPKRRFRHTANIVKRNEAAAMRRTNQEKLRIAVLVSKAAFQFIQGAHTGDYKVPDDVKAAGFDICADEAGSLVEGHDQKKLKFHGGVEGLAAKLKTSTTNGLSVDGEGIARRQEVFGINKFAESPQRSFWVFVWEALHDMTLMILAMCAFVSLIVGIATEGWPKGAHDGLGIVASILLVVFVTATSDYRQSLQFRDLDKEKKKISIQVTRSGYRQKLSIYDLLAGDI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G147380`
TK1151 ID	TkA06G147380
OH-1004 ID	LXL04_007935
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	71.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 99.708 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G147380

位置 Chr06:38690491-38694946 (-)

描述 Similar to ACA1: Calcium-transporting ATPase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g37640`	这种镁依赖性酶催化ATP的水解，同时将钙从胞质转运到内质网。	暂无已核实直接文献
`At2g22950`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。	暂无已核实直接文献
`At1g27770`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os12g0586600`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。	暂无已核实直接文献
`Os03g0616400`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007935 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005262 calcium channel activity 分子功能

GO:0005388 P-type calcium transporter activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G27770

ath:AT2G22950

ath:AT4G37640

dosa:Os03g0616400

dosa:Os12g0586600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.552

排名 1 · TkA06G147380 · TK1151

内质网0.182

排名 2 · TkA06G147380 · TK1151

溶酶体／液泡0.123

排名 3 · TkA06G147380 · TK1151

细胞质0.123

排名 4 · TkA06G147380 · TK1151

高尔基体0.114

排名 5 · TkA06G147380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12515CaATP_NAI5-50 aa

PF01841Transglut_core12-30 aa

PF13377Peripla_BP_315-96 aa

PF00690Cation_ATPase_N117-185 aa

PF00689Cation_ATPase_C173-218 aa

PF00122E1-E2_ATPase237-334 aa

PF00689Cation_ATPase_C355-389 aa

PF00702Hydrolase451-764 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G147380	`PF12515`	CaATP_NAI	5	50	9.4e-17	61.0
TkA06G147380	`PF01841`	Transglut_core	12	30	0.25	12.3
TkA06G147380	`PF13377`	Peripla_BP_3	15	96	0.18	12.6
TkA06G147380	`PF00690`	Cation_ATPase_N	117	185	2.4e-15	56.7
TkA06G147380	`PF00689`	Cation_ATPase_C	173	218	6.4e-40	137.5
TkA06G147380	`PF00122`	E1-E2_ATPase	237	334	2.4e-20	72.9
TkA06G147380	`PF00689`	Cation_ATPase_C	355	389	6.4e-40	137.5
TkA06G147380	`PF00702`	Hydrolase	451	764	4e-14	54.2
TkA06G147380	`PF13246`	Cation_ATPase	497	657	1.1e-31	110.8
TkA06G147380	`PF12710`	HAD	655	761	0.07	14.2
TkA06G147380	`PF08282`	Hydrolase_3	659	693	8.9e-05	23.1
TkA06G147380	`PF01841`	Transglut_core	663	682	0.25	12.3
TkA06G147380	`PF08282`	Hydrolase_3	735	792	8.9e-05	23.1
TkA06G147380	`PF00689`	Cation_ATPase_C	835	1009	6.4e-40	137.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O81108`	拟南芥	sp\|O81108\|ACA2_ARATH Calcium-transporting ATPase 2, plasma membrane-type	79.000%	Swiss-Prot	高置信
`O64806`	拟南芥	sp\|O64806\|ACA7_ARATH Putative calcium-transporting ATPase 7, plasma membrane-type	79.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q37145`	拟南芥	sp\|Q37145\|ACA1_ARATH Calcium-transporting ATPase 1	74.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q2QMX9`	水稻	sp\|Q2QMX9\|ACA10_ORYSJ Calcium-transporting ATPase 10, plasma membrane-type	74.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q6ATV4`	水稻	sp\|Q6ATV4\|ACA3_ORYSJ Calcium-transporting ATPase 3, plasma membrane-type	68.200%	Swiss-Prot	高置信

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