TkA06G095540 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G095540

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 25402916-25409506 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3505 bp · TkA06G095540|TK1151|cDNA

TTTAACCCGACCCGCCAAAATTACCAGTCGCTCCACTATGTTTTTGTAAAACCCTAATTGGACCACTCACCCACCACATATATTCCTTTGCCATTTCCCCAAATTCTTAGAAAGAGCGGGAAACATACGCAAACATAGATACACCTTAAACACACTCACTTCAATTTCACAATCGCATTGCAAAAGTCGTTAAAAATGGAGAACATGATCGATCAAGACCAGCAGTGGCTGATCAACTCACTGAATGCTACTCTTGATAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3084 bp · TkA06G095540|TK1151|CDS

ATGGAGAACATGATCGATCAAGACCAGCAGTGGCTGATCAACTCACTGAATGCTACTCTTGATACTAATCAACAAGCTCGATCTTTTGCAGAGGCGTCCTTAAATCAGGCCTCCGTTCAACCTGGTTTTGGAAGCGCTTTATCCAAGATTGCAGCTAACAGGAATCTTCCTCTAGGATCTCGCCAACTAGCTGCGGTTCTTCTAAAACAGTTTATTAAGAAACACTGGCAGGAAGATGACGATGGTTTTGAACATCCTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1027 aa · TkA06G095540|TK1151|PROTEIN

MENMIDQDQQWLINSLNATLDTNQQARSFAEASLNQASVQPGFGSALSKIAANRNLPLGSRQLAAVLLKQFIKKHWQEDDDGFEHPVVSNEEKAIIRGLLLLSLDDPHRKICTAISMAVASVASHDWPDEWPDLLPFLIKLINDQTNTNAVNGALRCLALLSADLDDKLVPKIIPVLFPCLHAIVSSPQIYEKPLRTKAISIVYSCTSMLGVMSGVYKTETSALMLPLIKSWMVEFSSILKNPVQSEDPDDWSIRMETLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G095540`
TK1151 ID	TkA06G095540
OH-1004 ID	LXL04_024925
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	97.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.105 / OH-1004 93.190 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G095540`
位置	Chr06:25402916-25409506 (-)
描述	Similar to Ipo9: Importin-9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_024925` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006606 protein import into nucleus 生物过程 GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程 GO:0031144 proteasome localization 生物过程 GO:0042254 ribosome biogenesis 生物过程 GO:0050821 protein stabilization 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分 GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0005525 GTP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用	ddi:DDB_G0269860 dme:Dmel_CG5252 hsa:55705 spo:2541885 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.754

排名 1 · TkA06G095540 · TK1151

细胞质0.523

排名 2 · TkA06G095540 · TK1151

细胞膜0.033

排名 3 · TkA06G095540 · TK1151

溶酶体／液泡0.030

排名 4 · TkA06G095540 · TK1151

内质网0.029

排名 5 · TkA06G095540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27435TP_0813_N5-26 aa

PF03810IBN_N30-104 aa

PF02985HEAT99-124 aa

PF24987HEAT_EF3_N100-182 aa

PF23271HEAT_GCN1105-183 aa

PF25780TPR_IPO5109-147 aa

PF08389Xpo1110-167 aa

PF13513HEAT_EZ128-159 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G095540	`PF27435`	TP_0813_N	5	26	0.032	14.7
TkA06G095540	`PF03810`	IBN_N	30	104	4e-16	59.5
TkA06G095540	`PF02985`	HEAT	99	124	0.00052	20.7
TkA06G095540	`PF24987`	HEAT_EF3_N	100	182	0.0016	19.1
TkA06G095540	`PF23271`	HEAT_GCN1	105	183	0.0067	17.3
TkA06G095540	`PF25780`	TPR_IPO5	109	147	0.065	14.2
TkA06G095540	`PF08389`	Xpo1	110	167	4.1e-08	34.2
TkA06G095540	`PF13513`	HEAT_EZ	128	159	0.013	16.7
TkA06G095540	`PF11865`	mTOR_dom	130	163	0.2	12.3
TkA06G095540	`PF12460`	MMS19_C	133	264	0.2	11.3
TkA06G095540	`PF02985`	HEAT	134	145	0.00052	20.7
TkA06G095540	`PF01347`	TPR_Vitellogenin	136	200	0.18	11.9
TkA06G095540	`PF13513`	HEAT_EZ	153	181	0.013	16.7
TkA06G095540	`PF24492`	HEAT_ECM29	156	172	0.0046	17.8
TkA06G095540	`PF25758`	TPR_IPO11	218	239	1.4e-11	44.8
TkA06G095540	`PF08389`	Xpo1	237	270	4.1e-08	34.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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