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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G078620
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 21086197-21088977 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1732 bp · TkA06G078620|TK1151|cDNA

CGGCTGTTATCAAACACGTAGGCAGCGACTCTGAATAACGTGACGGTTGAAAACGTGAAGACATACATTTCGATCCACTTCATTAGATATTTCAAGTTTCTAACTGTAGCAGCGCCGACGACCCATTCCAATTTCCCCAAAACCAACAGGATTTCAACCAACAATCACTCTGATTCCCTTATCGATCTACTAATTGAATGAGCGGGAGTGAAGGAAGCTCAGGCCACTCCGGAGGTGCTCCGGCGAAGAAGAAGGACAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1284 bp · TkA06G078620|TK1151|CDS

ATGAGCGGGAGTGAAGGAAGCTCAGGCCACTCCGGAGGTGCTCCGGCGAAGAAGAAGGACAAAGCGAAAGTGAGCCGGACCTCGCTCATACTTTGGCACGCTCACCAGAACGATGCCTCCGCAGTTAAGAAGCTTCTGGACGAAGATCCTTCTTTGGTTCATGCTAGGGATTACGATAATCGAACTCCGCTTCACGTTGCTTCACTTCACGGATGGATCGATGTTGCTAAATGTTTGATCGAGCATGGCGCTGATGTCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

427 aa · TkA06G078620|TK1151|PROTEIN

MSGSEGSSGHSGGAPAKKKDKAKVSRTSLILWHAHQNDASAVKKLLDEDPSLVHARDYDNRTPLHVASLHGWIDVAKCLIEHGADVNAQDRWKNTPLADAEGAKKLNMIELLKLHDGKSLGQNGSHSEPKPVLPPLSNKCDWEIDPVELDFTSAHTVGKGSFGEIIKASWRGTPVAVKRILPSLSDDRFVVQDFRHEVNLLVKLRHPNIVQFLGAVTEKKPLMLVTEFLRGGDLHQCLKEKGALNPTTAINFALDIARGM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G078620
TK1151 IDTkA06G078620
OH-1004 IDLXL04_025144
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G078620
位置Chr06:21086197-21088977 (-)
描述Similar to ILK1: Integrin-linked protein kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g14000 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能作为BRL2的适配蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g18950 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，通过丝氨酸和苏氨酸残基磷酸化蛋白（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
At2g43850 作为植物防御途径、应激反应和钾稳态之间的连接。 暂无已核实直接文献
At4g38470 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774
At2g24360 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可磷酸化丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基上的蛋白质。
Genome-wide analysis and experimentation of plant serine/ threonine/tyrosine-specific protein kinases.2006 · DOI: 10.1007/s11103-005-4109-7

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025144 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007229 integrin-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14000
ath:AT2G17700
ath:AT2G43850
ath:AT4G18950
ath:AT4G38470
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.555
排名 1 · TkA06G078620 · TK1151
细胞膜0.422
排名 2 · TkA06G078620 · TK1151
细胞核0.286
排名 3 · TkA06G078620 · TK1151
高尔基体0.065
排名 4 · TkA06G078620 · TK1151
内质网0.039
排名 5 · TkA06G078620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13606Ank_329-47 aa
PF13637Ank_431-80 aa
PF12796Ank_232-113 aa
PF00023Ank34-57 aa
PF13857Ank_545-97 aa
PF00023Ank59-91 aa
PF13606Ank_359-88 aa
PF23745ANK_LRRK267-112 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G078620PF13606Ank_329472.4e-0731.2
TkA06G078620PF13637Ank_431807.3e-0833.2
TkA06G078620PF12796Ank_2321132.8e-1144.5
TkA06G078620PF00023Ank34572e-0937.9
TkA06G078620PF13857Ank_545974.6e-0730.8
TkA06G078620PF00023Ank59912e-0937.9
TkA06G078620PF13606Ank_359882.4e-0731.2
TkA06G078620PF23745ANK_LRRK2671120.2212.1
TkA06G078620PF13637Ank_468977.3e-0833.2
TkA06G078620PF00023Ank941152e-0937.9
TkA06G078620PF00069Pkinase1524078.7e-57193.2
TkA06G078620PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1544098.9e-61206.2
TkA06G078620PF00023Ank2042132e-0937.9
TkA06G078620PF12796Ank_22192192.8e-1144.5
TkA06G078620PF01636APH2652830.08113.4
TkA06G078620PF17667Pkinase_fungal2693460.112.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XI87拟南芥sp|Q9XI87|VIK_ARATH Serine/threonine-protein kinase VIK81.800%Swiss-Prot高置信
Q93Z30拟南芥sp|Q93Z30|BHP_ARATH Serine/threonine-protein kinase 1242.200%Swiss-Prot中等置信
F4IS56拟南芥sp|F4IS56|ILK1_ARATH Integrin-linked protein kinase 135.100%Swiss-Prot中等置信
F4JTP5拟南芥sp|F4JTP5|STY46_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY4636.800%Swiss-Prot中等置信
Q9ZQ31拟南芥sp|Q9ZQ31|STY13_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY1338.400%Swiss-Prot中等置信

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