TkA05G453700 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G453700

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 113590395-113591601 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1072 bp · TkA05G453700|TK1151|cDNA

GTAACTTTAATCGTGTCAAATACGTGTCGCCTGCTCCTATAAATACACCCCCTCACAATTCTTACACTCACACTATCTGATCATCTCTCTACTATCATCAAATCAATCCAAGAGCCTTTCATTCACATACTCAGTTTTAGTTTCTTAATTCCTTTCAATCATGTCTGACGAGGGAGTTTACAACCACCCCACCACCACCACCACCGCCGTGGAGGTGGAGCCTGAGACCGTCCAGACGTCCGATCGTGGACTGTTTGATG...

CDS

下载 CDS FASTA

648 bp · TkA05G453700|TK1151|CDS

ATGTCTGACGAGGGAGTTTACAACCACCCCACCACCACCACCACCGCCGTGGAGGTGGAGCCTGAGACCGTCCAGACGTCCGATCGTGGACTGTTTGATGTTTTTGGGAAGAAAAACGAAGAGAAGAAATGCGAAGAGGCCGCGATCTCATCGGAGTTTGAAGAGAAAGTTCAGGTCTCCGAACCGGTACCGGAGGAGAAGAAGGAAACTTTGCTCGATAAACTTCACAGATCCGGTAGCAGCAGTTCCAGTAGCTCGAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

215 aa · TkA05G453700|TK1151|PROTEIN

MSDEGVYNHPTTTTTAVEVEPETVQTSDRGLFDVFGKKNEEKKCEEAAISSEFEEKVQVSEPVPEEKKETLLDKLHRSGSSSSSSSSDEECDENGEKKKKKKPLKEKIKEKITKHEDETSVPIEKYDVAPLQHTPNPEPEEKKGFMEKIKEKLPGGHKKVEEEYVAPPPPPPTVVTHPDEGEQKKGIFEKIKEKIPGYHPKSEEEKEKEKEKECH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G453700`
TK1151 ID	TkA05G453700
OH-1004 ID	LXL04_022257
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G453700

位置 Chr05:113590395-113591601 (+)

描述 Similar to ECPP44: Phosphoprotein ECPP44

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g76180`	内在无序蛋白，起分子伴侣作用。	Chaperone activity of ERD10 and ERD14, two disordered stress-related plant proteins.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.118208

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022257 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0009269 response to desiccation 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009631 cold acclimation 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009992 intracellular water homeostasis 生物过程

GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程

GO:0010286 heat acclimation 生物过程

GO:0050821 protein stabilization 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G20440

ath:AT1G20450

ath:AT1G76180

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.477

排名 1 · TkA05G453700 · TK1151

细胞膜0.450

排名 2 · TkA05G453700 · TK1151

细胞核0.222

排名 3 · TkA05G453700 · TK1151

高尔基体0.028

排名 4 · TkA05G453700 · TK1151

线粒体0.028

排名 5 · TkA05G453700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00257Dehydrin43-157 aa

PF21953NadN_nucleosid_C48-118 aa

PF27439DnaJ_C_261-75 aa

PF22798DUF5817_CT63-85 aa

PF04119HSP9_HSP1266-70 aa

PF27439DnaJ_C_294-102 aa

PF04119HSP9_HSP12101-119 aa

PF04119HSP9_HSP12138-160 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G453700	`PF00257`	Dehydrin	43	157	1.2e-31	111.0
TkA05G453700	`PF21953`	NadN_nucleosid_C	48	118	0.17	12.6
TkA05G453700	`PF27439`	DnaJ_C_2	61	75	0.54	11.0
TkA05G453700	`PF22798`	DUF5817_CT	63	85	0.087	13.4
TkA05G453700	`PF04119`	HSP9_HSP12	66	70	1.2	10.4
TkA05G453700	`PF27439`	DnaJ_C_2	94	102	0.54	11.0
TkA05G453700	`PF04119`	HSP9_HSP12	101	119	1.2	10.4
TkA05G453700	`PF04119`	HSP9_HSP12	138	160	1.2	10.4
TkA05G453700	`PF27439`	DnaJ_C_2	140	151	0.54	11.0
TkA05G453700	`PF00257`	Dehydrin	142	199	1.2e-31	111.0
TkA05G453700	`PF00257`	Dehydrin	181	207	1.2e-31	111.0
TkA05G453700	`PF27439`	DnaJ_C_2	182	193	0.54	11.0
TkA05G453700	`PF04119`	HSP9_HSP12	183	210	1.2	10.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P42763`	拟南芥	sp\|P42763\|ERD14_ARATH Dehydrin ERD14	51.900%	Swiss-Prot	低置信

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