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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G430600
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 107393672-107397226 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2033 bp · TkA05G430600|TK1151|cDNA

GTTTAAACAGTCACAACTCCAGCAACAACAATCACAAACGGTGGGGGCCCACCTAACGCCTCGCTGGTTTAAACCTGGATTGAAGATTGAATAATTTCAATGATTACGACAATCAATCCCTTACCATATCCAGAAGTAAAATCGACTACAAATCTCAACTTCTTCTCCAATCTCTCATCGTCAATTACTCACAATGTCAAAGCAGTCTTACAAGGTGTGTTTCTGCTTCCGCCGGCGGTTCCGGCTGGCGGCAACGGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1740 bp · TkA05G430600|TK1151|CDS

ATGTCAAAGCAGTCTTACAAGGTGTGTTTCTGCTTCCGCCGGCGGTTCCGGCTGGCGGCAACGGAAGCTCCGCCGCAAATCAAGTCACTGTTTGATCAGTACTCAGAAAACGGCATCATGAACGCGGATCACCTACAGCGGTTCCTTGTTCAGGTTCAGAAAGAAGAGAAAGCTACCGTGGAGGAAGCTCAAGCAATTATGCACAGTGTTGGTGATATTTTCCATCGCAAGGGTTTCAATCTCGAGACGTTTTTCAAGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

579 aa · TkA05G430600|TK1151|PROTEIN

MSKQSYKVCFCFRRRFRLAATEAPPQIKSLFDQYSENGIMNADHLQRFLVQVQKEEKATVEEAQAIMHSVGDIFHRKGFNLETFFKYLFGDTNPAFDPHPTVHHDMTAPLSHYYIFTGHNSYLTGNQLNSDCSDAPIIKALERGVRVIELDIWPNSKKDDVDVLHGGTLTAPVALIKCFRSIKNHAFTASEYPVVITLEDHLTPELQAKVAKMVTDTFGDMLFKPETETLSEFPSPESLKRRVIISTKPPKEYLKAKEEK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G430600
TK1151 IDTkA05G430600
OH-1004 IDLXL04_021857
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.482 / OH-1004 45.247
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G430600
位置Chr05:107393672-107397226 (+)
描述Similar to PLC2: Phosphoinositide phospholipase C 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g08510 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。
N-terminal EF-hand-like domain is required for phosphoinositide-specific phospholipase C activity in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1016/s0014-5793(01)02453-x
At3g55940 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At2g40116 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At5g58700 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At5g58670 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。
Arabidopsis PLC1 is required for secondary responses to abscisic acid signals.2001 · DOI: 10.1105/tpc.13.5.1143
A gene encoding a phosphatidylinositol-specific phospholipase C is induced by dehydration and salt stress in Arabidopsis thaliana.1995 · DOI: 10.1073/pnas.92.9.3903

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021857 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010601 positive regulation of auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048015 phosphatidylinositol-mediated signaling 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
GO:0051209 release of sequestered calcium ion into cytosol 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004435 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate phospholipase C activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G40116
ath:AT3G08510
ath:AT3G55940
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.504
排名 1 · TkA05G430600 · TK1151
细胞质0.444
排名 2 · TkA05G430600 · TK1151
细胞核0.194
排名 3 · TkA05G430600 · TK1151
内质网0.068
排名 4 · TkA05G430600 · TK1151
高尔基体0.062
排名 5 · TkA05G430600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09279EF-hand_like26-68 aa
PF23583EF_HAND_2_PLCG36-98 aa
PF00388PI-PLC-X106-248 aa
PF00387PI-PLC-Y346-431 aa
PF10022BcGHD401-422 aa
PF10022BcGHD450-476 aa
PF00168C2452-553 aa
PF00388PI-PLC-X548-566 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G430600PF09279EF-hand_like26680.0008720.4
TkA05G430600PF23583EF_HAND_2_PLCG36980.0008820.3
TkA05G430600PF00388PI-PLC-X1062481.1e-52178.3
TkA05G430600PF00387PI-PLC-Y3464311e-28100.6
TkA05G430600PF10022BcGHD4014220.1312.0
TkA05G430600PF10022BcGHD4504760.1312.0
TkA05G430600PF00168C24525532.6e-1247.6
TkA05G430600PF00388PI-PLC-X5485661.1e-52178.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39033拟南芥sp|Q39033|PLCD2_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 268.200%Swiss-Prot高置信
Q9LY51拟南芥sp|Q9LY51|PLCD7_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 766.200%Swiss-Prot高置信
Q8GV43拟南芥sp|Q8GV43|PLCD6_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 656.500%Swiss-Prot高置信
Q944C1拟南芥sp|Q944C1|PLCD4_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 455.700%Swiss-Prot高置信
Q39032拟南芥sp|Q39032|PLCD1_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 153.200%Swiss-Prot高置信

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