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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G131570
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 34429252-34432171 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1548 bp · TkA05G131570|TK1151|cDNA

AAAAAAAAACACGGATAAATCGTTGAACATTGACGACGAGCCACCCTTCTCCTCTTCTTGGAAACGACGTGTCATTTTCTGAATGGATAAACAAGATTACAGGAGATATTGATACACAACACAAAAATGCTTTCACTTGCTACGACAACCCGAACCGTTATCTGCAACAACAGAGCTCGTGTTAATGGCGCTTTCCGTACTCCCACCATCGAAATGTAGCTGCCATTATCAGTTTTACAGGACAAGGATAACTCAACAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1116 bp · TkA05G131570|TK1151|CDS

ATGGCGCTTTCCGTACTCCCACCATCGAAATGTAGCTGCCATTATCAGTTTTACAGGACAAGGATAACTCAACAAAGAACGCGAAATTCCGCCATGATTATCCGGATGACGGCGTCAAGTGGAGGAGGAACAGGGGGTCGATTGGCGTCGTACGAAGAAGGGGAACTGGAAAGACCTAACTGGACAGGTCAAACCCCTCTTTCTCGCCTTGTTGCTGCCCTAATTTCATTCAAACCTCTTTATTCTGTGCTCAAACTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

371 aa · TkA05G131570|TK1151|PROTEIN

MALSVLPPSKCSCHYQFYRTRITQQRTRNSAMIIRMTASSGGGTGGRLASYEEGELERPNWTGQTPLSRLVAALISFKPLYSVLKLGARQVLISTAEKTNVPWREMTKEILDSDVYKEMESIENPSIVYPDYYLSPFHAYDEGNLSWLAAAEAEAATMSMVRRAIPDASSLDEANEIVRGNWLNAIEKHHQLYSGNLEIRDILDIGCSVGVSTRFLAHKFPSAKLTGLDLSPYFLAVAQYKEKRRNSRSNSIEWIHANGE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G131570
TK1151 IDTkA05G131570
OH-1004 IDLXL04_020065
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G131570
位置Chr05:34429252-34432171 (+)
描述Similar to coq-5: 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020065 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0009234 menaquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0017000 antibiotic biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0042372 phylloquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0031314 extrinsic component of mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0008425 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methyltransferase activity 分子功能
GO:0008757 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity 分子功能
GO:0043770 demethylmenaquinone methyltransferase activity 分子功能
GO:0052624 2-phytyl-1,4-naphthoquinone methyltransferase activity 分子功能
GO:0102307 erythromycin 3''-o-methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
cel:CELE_ZK652.9
oih:OB1789
sen:SACE_0728
tel:tll2373
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.972
排名 1 · TkA05G131570 · TK1151
线粒体0.035
排名 2 · TkA05G131570 · TK1151
细胞核0.015
排名 3 · TkA05G131570 · TK1151
细胞质0.014
排名 4 · TkA05G131570 · TK1151
细胞膜0.012
排名 5 · TkA05G131570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01209Ubie_methyltran77-101 aa
PF05175MTS99-121 aa
PF03141Methyltransf_29182-212 aa
PF01728FtsJ187-331 aa
PF01209Ubie_methyltran192-311 aa
PF05401NodS192-305 aa
PF05891Methyltransf_PK194-313 aa
PF00891Methyltransf_2198-309 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G131570PF01209Ubie_methyltran771012.5e-1557.2
TkA05G131570PF05175MTS991212.2e-0628.1
TkA05G131570PF03141Methyltransf_291822120.003516.7
TkA05G131570PF01728FtsJ1873316.1e-0523.8
TkA05G131570PF01209Ubie_methyltran1923112.5e-1557.2
TkA05G131570PF05401NodS1923050.002818.2
TkA05G131570PF05891Methyltransf_PK1943130.01415.6
TkA05G131570PF00891Methyltransf_21983090.0006519.8
TkA05G131570PF06325PrmA1983050.007216.6
TkA05G131570PF13489Methyltransf_232003548.6e-0936.0
TkA05G131570PF05175MTS2003102.2e-0628.1
TkA05G131570PF02353CMAS2013070.2711.2
TkA05G131570PF13649Methyltransf_252023015.1e-1969.5
TkA05G131570PF13847Methyltransf_312023091.1e-1042.2
TkA05G131570PF08241Methyltransf_112033058.4e-1968.7
TkA05G131570PF08242Methyltransf_122033031.6e-1558.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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