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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G069210
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 18518099-18519115 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1017 bp · TkA05G069210|TK1151|cDNA

ATGCTCGGAGCTGCCGAACAGAAGGGGAAACGCGCCGTCGATCTCTCCGGTGGCTCCATCGACCGCGAACAAGTCCAAGAGAATTACAACGAGTACTGGACTTTCTTCCGCCGCCCTAAAGAGATTGAGAAGGCGGAAAAAGTCCCCGCCTTCGTCGACACCTTCTACAATCTCGTCACCGACATCTACGAATGGGGTTGGGGCCAATCTTTCCATTTTTCACCTTCGATCCCTGGGAAATCGAACCTTGAATCGACTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1017 bp · TkA05G069210|TK1151|CDS

ATGCTCGGAGCTGCCGAACAGAAGGGGAAACGCGCCGTCGATCTCTCCGGTGGCTCCATCGACCGCGAACAAGTCCAAGAGAATTACAACGAGTACTGGACTTTCTTCCGCCGCCCTAAAGAGATTGAGAAGGCGGAAAAAGTCCCCGCCTTCGTCGACACCTTCTACAATCTCGTCACCGACATCTACGAATGGGGTTGGGGCCAATCTTTCCATTTTTCACCTTCGATCCCTGGGAAATCGAACCTTGAATCGACTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

338 aa · TkA05G069210|TK1151|PROTEIN

MLGAAEQKGKRAVDLSGGSIDREQVQENYNEYWTFFRRPKEIEKAEKVPAFVDTFYNLVTDIYEWGWGQSFHFSPSIPGKSNLESTRIHEEMAVDLIGVKPGQKILDAGCGVGGPMRAIAAHSGCNVVGITINEYQVSRAKAHNKKAGLDKQCDVVCGNFLEMPFDDESFDGAYSIEATCHAPKLEDVYSEIFRVLKPGSMYVSYEWVTTELYRGEDPEHVDIIQGIERGDALPGLRSYSDIAETAKKVGFEVVKEKDLA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G069210
TK1151 IDTkA05G069210
OH-1004 IDLXL04_025310
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)91.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 93.889
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G069210
位置Chr05:18518099-18519115 (+)
描述Similar to SMT2: 24-methylenesterol C-methyltransferase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g20330 将S-腺苷甲硫氨酸的甲基转移至24-亚甲基洛芬醇（24-methylene lophenol）的亚甲基，生成24-亚乙基洛芬醇（24-ethylidene lophenol）。 暂无已核实直接文献
At1g76090 将S-腺苷甲硫氨酸的甲基转移至24-亚甲基洛芬醇（24-methylene lophenol）的亚甲基，生成24-亚乙基洛芬醇（24-ethylidene lophenol）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0136200 将S-腺苷甲硫氨酸的甲基转移至24-亚甲基洛芬醇（24-methylene lophenol）的亚甲基，生成24-亚乙基洛芬醇（24-ethylidene lophenol）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025310 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程
GO:0007389 pattern specification process 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0016126 sterol biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0032876 negative regulation of DNA endoreduplication 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20330
ath:AT1G76090
ath:AT5G13710
ddi:DDB_G0288907
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.474
排名 1 · TkA05G069210 · TK1151
线粒体0.273
排名 2 · TkA05G069210 · TK1151
细胞质0.171
排名 3 · TkA05G069210 · TK1151
细胞膜0.109
排名 4 · TkA05G069210 · TK1151
细胞核0.086
排名 5 · TkA05G069210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01209Ubie_methyltran5-21 aa
PF02353CMAS54-259 aa
PF03848TehB83-150 aa
PF01209Ubie_methyltran86-208 aa
PF01135PCMT90-158 aa
PF08123DOT194-171 aa
PF01728FtsJ98-165 aa
PF07021MetW99-165 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G069210PF01209Ubie_methyltran5216.4e-1246.0
TkA05G069210PF02353CMAS542591.1e-1455.2
TkA05G069210PF03848TehB831500.1712.0
TkA05G069210PF01209Ubie_methyltran862086.4e-1246.0
TkA05G069210PF01135PCMT901580.01715.6
TkA05G069210PF08123DOT1941710.01715.4
TkA05G069210PF01728FtsJ981650.0007520.2
TkA05G069210PF07021MetW991650.02415.0
TkA05G069210PF06325PrmA991990.1412.4
TkA05G069210PF13847Methyltransf_311002108.1e-1762.1
TkA05G069210PF13489Methyltransf_231002552.8e-0834.3
TkA05G069210PF13679Methyltransf_321001560.02115.5
TkA05G069210PF05175MTS1001700.1512.4
TkA05G069210PF08003Methyltransf_91021810.008815.8
TkA05G069210PF09445Methyltransf_151031620.01116.1
TkA05G069210PF13649Methyltransf_251051995.6e-2072.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39227拟南芥sp|Q39227|SMT2_ARATH 24-methylenesterol C-methyltransferase 282.500%Swiss-Prot高置信
Q94JS4拟南芥sp|Q94JS4|SMT3B_ARATH 24-methylenesterol C-methyltransferase 382.900%Swiss-Prot高置信
O82427水稻sp|O82427|SMT2_ORYSJ 24-methylenesterol C-methyltransferase 273.200%Swiss-Prot高置信

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