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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G056140
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 14929997-14931273 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1171 bp · TkA05G056140|TK1151|cDNA

CATTCATATCTTTTTTCTCCATACATCTATCGGGAAGTATGTCATCCACAAAGCTTGGTTGTTTGCTTTTAATCTTCTTCTCCGCTACTTTGATTTCACATACTACATCTCGGTTTCTCCCTAAAAGTTCAAGCTATGAGAGCCACGAACAATGGATGGCACGTTATGGACGCGTGTACAGGGATGTTGAGGAGAAAGAACAACGCTCAAAGATTTTTCAAGAGAATGTTAAGTACATAGAGTCATCCAACAGTGTGATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1017 bp · TkA05G056140|TK1151|CDS

ATGTCATCCACAAAGCTTGGTTGTTTGCTTTTAATCTTCTTCTCCGCTACTTTGATTTCACATACTACATCTCGGTTTCTCCCTAAAAGTTCAAGCTATGAGAGCCACGAACAATGGATGGCACGTTATGGACGCGTGTACAGGGATGTTGAGGAGAAAGAACAACGCTCAAAGATTTTTCAAGAGAATGTTAAGTACATAGAGTCATCCAACAGTGTGATGAACAAAGGTTACAAACTAGCAATCAATGCGTTTGCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

338 aa · TkA05G056140|TK1151|PROTEIN

MSSTKLGCLLLIFFSATLISHTTSRFLPKSSSYESHEQWMARYGRVYRDVEEKEQRSKIFQENVKYIESSNSVMNKGYKLAINAFADLTNEEFTSTRNRFKAHECSPSTFAFRYENVTAVPSSMDWRKKGAVTPIKDQGQCGCCWAFSAVAAMEGITQLKTGKLVSLSEQELVDCDTSGQDQGCEGGLMDDAFDFILNNKGLTTESNYPYKGVDDTCNSNQESNHAAAITGHEDVPANSETALLKAVGGQPISVAIDASG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G056140
TK1151 IDTkA05G056140
OH-1004 IDLXL04_019491
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 92.098
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G056140
位置Chr05:14929997-14931273 (+)
描述Similar to OsI_14861: Senescence-specific cysteine protease SAG39
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g45890 半胱氨酸蛋白酶，可能在细胞凋亡、重金属解毒及超敏反应期间参与发育性衰老相关的细胞死亡。
Identification of a promoter region responsible for the senescence-specific expression of SAG12.1999 · DOI: 10.1023/a:1006342412688
HDA6 is required for jasmonate response, senescence and flowering in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1093/jxb/erm300
Natural developmental variations in leaf and plant senescence in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2008.00108.x
Epigenetic programming via histone methylation at WRKY53 controls leaf senescence in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03782.x
Nitric oxide is involved in cadmium-induced programmed cell death in Arabidopsis suspension cultures.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.133397
At5g50260 具有体外蛋白酶活性。
KDEL-tailed cysteine endopeptidases involved in programmed cell death, intercalation of new cells, and dismantling of extensin scaffolds.2008 · DOI: 10.3732/ajb.2007404
Endoplasmic reticulum KDEL-tailed cysteine endopeptidase 1 of Arabidopsis (AtCEP1) is involved in pathogen defense.2014 · DOI: 10.3389/fpls.2014.00058
The cysteine protease CEP1, a key executor involved in tapetal programmed cell death, regulates pollen development in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.127282

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XQE8 半胱氨酸蛋白酶，可能在细胞凋亡、重金属解毒及超敏反应期间参与发育性衰老相关的细胞死亡。 暂无已核实直接文献
Os04g0206300 半胱氨酸蛋白酶，可能在细胞凋亡、重金属解毒及超敏反应期间参与发育性衰老相关的细胞死亡。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019491 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0009750 response to fructose 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G45890
ath:AT5G50260
osa:107276017
rcu:8278243
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.617
排名 1 · TkA05G056140 · TK1151
细胞外0.212
排名 2 · TkA05G056140 · TK1151
细胞质0.194
排名 3 · TkA05G056140 · TK1151
内质网0.116
排名 4 · TkA05G056140 · TK1151
细胞膜0.099
排名 5 · TkA05G056140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08246Inhibitor_I2936-93 aa
PF26325YhjD58-105 aa
PF00112Peptidase_C1120-337 aa
PF18978DUF5714132-185 aa
PF03051Peptidase_C1_2133-154 aa
PF18978DUF5714271-284 aa
PF03051Peptidase_C1_2278-318 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G056140PF08246Inhibitor_I2936934.6e-1969.2
TkA05G056140PF26325YhjD581050.2511.8
TkA05G056140PF00112Peptidase_C11203373.5e-84283.0
TkA05G056140PF18978DUF57141321850.08313.1
TkA05G056140PF03051Peptidase_C1_21331543.2e-0523.7
TkA05G056140PF18978DUF57142712840.08313.1
TkA05G056140PF03051Peptidase_C1_22783183.2e-0523.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJ47拟南芥sp|Q9FJ47|SAG12_ARATH Senescence-specific cysteine protease SAG1258.300%Swiss-Prot高置信
Q9FGR9拟南芥sp|Q9FGR9|CEP1_ARATH KDEL-tailed cysteine endopeptidase CEP158.900%Swiss-Prot高置信
A2XQE8水稻sp|A2XQE8|SAG39_ORYSI Senescence-specific cysteine protease SAG3960.200%Swiss-Prot高置信
Q7XWK5水稻sp|Q7XWK5|SAG39_ORYSJ Senescence-specific cysteine protease SAG3959.900%Swiss-Prot高置信

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