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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G430750
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 108642215-108642688 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

474 bp · TkA04G430750|TK1151|cDNA

ATGAACACTATTAAAGATAGAAGTGGAGAAAGTTCAAACCCAGATGGTCATAAAAAAGAATGGCTGAATCTAAGCCTTGGACCATCGTTAACCTCTTCATCAAAATCAAGGCCAACGAAATCCATGAAAGGCTATAAATGCACCTTTTGTGGTAGAAAGTTCTACAGTCCACAAGCATTAGGGGGCCATCAAAACGGCCACAGAAAGGAGAGAGATGCAGTTAGAAGATACCGTGATTTCCAAATTTACCAATCGATAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

474 bp · TkA04G430750|TK1151|CDS

ATGAACACTATTAAAGATAGAAGTGGAGAAAGTTCAAACCCAGATGGTCATAAAAAAGAATGGCTGAATCTAAGCCTTGGACCATCGTTAACCTCTTCATCAAAATCAAGGCCAACGAAATCCATGAAAGGCTATAAATGCACCTTTTGTGGTAGAAAGTTCTACAGTCCACAAGCATTAGGGGGCCATCAAAACGGCCACAGAAAGGAGAGAGATGCAGTTAGAAGATACCGTGATTTCCAAATTTACCAATCGATAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

157 aa · TkA04G430750|TK1151|PROTEIN

MNTIKDRSGESSNPDGHKKEWLNLSLGPSLTSSSKSRPTKSMKGYKCTFCGRKFYSPQALGGHQNGHRKERDAVRRYRDFQIYQSIEVHSNRLVGIQERDRETNVAIMFSNNGDGFGVAYNDELSMDLNWPGSFYLNLLPASPHSDHQKSVDLDLKL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G430750
TK1151 IDTkA04G430750
OH-1004 IDLXL04_038459
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)45.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 69.787
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G430750
位置Chr04:108642215-108642688 (+)
描述Similar to ZFP7: Zinc finger protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48890 作为转录阻遏蛋白。
LATE, a C(2)H(2) zinc-finger protein that acts as floral repressor.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04717.x
At5g14010 可能作为细胞增殖的转录抑制因子，调节发育中的雌蕊基底模式元素沿基端-远端轴的相对大小及花的决定性。 暂无已核实直接文献
At1g24625 在发芽和早期幼苗发育过程中充当脱落酸 信号传导的负调节因子。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At1g66140 在种子萌发和幼苗早期发育中起脱落酸(ABA)信号的负调控作用。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At1g10480 可能的转录因子，赤霉素（GA）诱导的花序表皮毛起始形成所必需。
Zinc finger protein5 is required for the control of trichome initiation by acting upstream of zinc finger protein8 in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.180281
ZFP5 encodes a functionally equivalent GIS protein to control trichome initiation.2012 · DOI: 10.4161/psb.7.1.18404
A zinc finger protein gene ZFP5 integrates phytohormone signaling to control root hair development in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.05094.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038459 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G24625
ath:AT1G66140
ath:AT1G80730
ath:AT5G14010
ath:AT5G25160
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · TkA04G430750 · TK1151
细胞质0.087
排名 2 · TkA04G430750 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA04G430750 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA04G430750 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA04G430750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13912zf-C2H2_616-19 aa
PF18868zf-C2H2_3rep20-64 aa
PF13465zf-H2C2_243-55 aa
PF13912zf-C2H2_645-70 aa
PF13894zf-C2H2_445-67 aa
PF00096zf-C2H245-67 aa
PF12171zf-C2H2_jaz45-67 aa
PF12874zf-met45-68 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G430750PF13912zf-C2H2_616190.0001122.8
TkA04G430750PF18868zf-C2H2_3rep20640.09214.1
TkA04G430750PF13465zf-H2C2_243554.58.5
TkA04G430750PF13912zf-C2H2_645700.0001122.8
TkA04G430750PF13894zf-C2H2_445670.0008920.5
TkA04G430750PF00096zf-C2H245670.002119.1
TkA04G430750PF12171zf-C2H2_jaz45670.03714.9
TkA04G430750PF12874zf-met45680.07114.2
TkA04G430750PF13913zf-C2HC_246640.02914.8
TkA04G430750PF13465zf-H2C2_263714.58.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKA9拟南芥sp|Q9FKA9|LATE_ARATH Protein LATE FLOWERING51.000%Swiss-Prot低置信
Q9FFX4拟南芥sp|Q9FFX4|KNU_ARATH Zinc finger protein KNUCKLES46.600%Swiss-Prot低置信
Q39266拟南芥sp|Q39266|ZFP7_ARATH Zinc finger protein 744.700%Swiss-Prot低置信
Q39263拟南芥sp|Q39263|ZFP4_ARATH Zinc finger protein 453.800%Swiss-Prot低置信
Q39264拟南芥sp|Q39264|ZFP5_ARATH Zinc finger protein 533.100%Swiss-Prot中等置信

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