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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G410540
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 103392305-103394595 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1483 bp · TkA04G410540|TK1151|cDNA

CGGCAGTCACTGTCCCTATCTCCGGCGACATCTCCCCACTTCCTCTCCCCCTCTTTCTATATATATATACCCCACCTCCCCCTCTCCTCTTTATACACTAGTTTCTCTTACGCTCTCCTCCTTCACACACGACACACATTTCATTTACTTTTCATATAAACCAAATCAACGGATCTCTCATTAGAAAATATCAACATTCAGAATGAACAGAGTTTCTCCGGAGATGCTACTAAGTCACACCACCGCCGTCACCGGCGGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1044 bp · TkA04G410540|TK1151|CDS

ATGAACAGAGTTTCTCCGGAGATGCTACTAAGTCACACCACCGCCGTCACCGGCGGCACCGACGTGAGTGTGTTCGAGAGACAACAGGCAAGAATGAAGTGGCAACAACAGCGTATCGTTTACAATGAGAATCATGACCATCAGGTTCCGAATCCATTTCCGGGTTTTAATGGAGTAATTAAACCCGACCCTGGTTTGGAAGATGGCTGGCCGGATTTCAGCGACGGATGTGACAAACTATTCTCGCCATTAATGGCGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

347 aa · TkA04G410540|TK1151|PROTEIN

MNRVSPEMLLSHTTAVTGGTDVSVFERQQARMKWQQQRIVYNENHDHQVPNPFPGFNGVIKPDPGLEDGWPDFSDGCDKLFSPLMADQRILQRNSSSVSLSPKKRKTHENQKLKNFQAVSEVNGINEKKIKVCSDENSRANSSKENSKLKEAKKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERVRREKISERMKYLQDLVPGCNKITGKAGMLDEIINYVQSLQKQVEFLSMKLATVHPKLDLDIDNLIMKEMFEVSAVGYSLEMAN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G410540
TK1151 IDTkA04G410540
OH-1004 IDLXL04_038262
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G410540
位置Chr04:103392305-103394595 (-)
描述Similar to BHLH63: Transcription factor bHLH63
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34530 转录因子，可结合 DNA 中的 G 盒 5'-CACGTG-3'，在体外也能在较低程度上结合 E 盒 5'-CANNTG-3'。
Photoexcited CRY2 interacts with CIB1 to regulate transcription and floral initiation in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1163927
Multiple bHLH proteins form heterodimers to mediate CRY2-dependent regulation of flowering-time in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003861
At1g10120 参与细胞伸长的转录激活剂。
Multiple bHLH proteins form heterodimers to mediate CRY2-dependent regulation of flowering-time in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003861
At1g68920 参与细胞伸长的转录激活剂。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AH97 与BCL1共同作用，通过增加赤霉素（GA）生物合成，至少部分地作为细胞伸长的正调节因子。 暂无已核实直接文献
Os02g0705500 与BCL1共同作用，通过增加赤霉素（GA）生物合成，至少部分地作为细胞伸长的正调节因子。
Modulation of Rice Leaf Angle and Grain Size by Expressing OsBCL1 and OsBCL2 under the Control of OsBUL1 Promoter.2021 · DOI: 10.3390/ijms22157792
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038262 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010372 positive regulation of gibberellin biosynthetic process 生物过程
GO:0045824 negative regulation of innate immune response 生物过程
GO:0051510 regulation of unidimensional cell growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10120
ath:AT1G68920
ath:AT4G34530
dosa:Os02g0705500
osa:4330462
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · TkA04G410540 · TK1151
细胞质0.096
排名 2 · TkA04G410540 · TK1151
细胞膜0.024
排名 3 · TkA04G410540 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA04G410540 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA04G410540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02590SPOUT_MTase121-184 aa
PF00010HLH170-217 aa
PF23173bHLH_SAC51175-219 aa
PF23174bHLH_ILI180-231 aa
PF12495Vip3A_N203-256 aa
PF18461Atypical_Card211-252 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G410540PF02590SPOUT_MTase1211840.02415.4
TkA04G410540PF00010HLH1702172.3e-0731.2
TkA04G410540PF23173bHLH_SAC511752193.8e-0524.2
TkA04G410540PF23174bHLH_ILI1802310.004418.1
TkA04G410540PF12495Vip3A_N2032560.7110.5
TkA04G410540PF18461Atypical_Card2112520.0813.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GY61拟南芥sp|Q8GY61|BH063_ARATH Transcription factor bHLH6350.200%Swiss-Prot中等置信
Q6NKN9拟南芥sp|Q6NKN9|BH074_ARATH Transcription factor bHLH7447.200%Swiss-Prot中等置信
Q9CAA9拟南芥sp|Q9CAA9|BH049_ARATH Transcription factor bHLH4949.200%Swiss-Prot中等置信
B8AH97水稻sp|B8AH97|BCL2_ORYSI Basic helix-loop-helix protein 7944.300%Swiss-Prot中等置信
Q6Z2G7水稻sp|Q6Z2G7|BCL2_ORYSJ Basic helix-loop-helix protein 7944.300%Swiss-Prot中等置信

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