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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G238120
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 60459924-60468610 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2327 bp · TkA04G238120|TK1151|cDNA

AGCGCGAGTTATACATGAAATGTTCAGTCAATGGGGGATAGCGGAAACTGCAGCAACAACGAGGGGCTGGAATCTAAGCGGAGATCCATGCACCGGCACCGCCGTGGATGACTCTACCAATTTCAATGACGGTAATTTCAATCCCGGCATCAAATGCGACTGTAGTTTCCCCAATTCTACTTGCCACATCACCGCACTGAAAGTTTATGCACTGAACGCAAGAGGCACAATCCCTGAAGGACTTTGGACTTTGTCTAACC...

CDS

下载 CDS FASTA

2931 bp · TkA04G238120|TK1151|CDS

ATGTTCAGTCAATGGGGGATAGCGGAAACTGCAGCAACAACGAGGGGCTGGAATCTAAGCGGAGATCCATGCACCGGCACCGCCGTGGATGACTCTACCAATTTCAATGACGGTAATTTCAATCCCGGCATCAAATGCGACTGTAGTTTCCCCAATTCTACTTGCCACATCACCGCACTGAAAGTTTATGCACTGAACGCAAGAGGCACAATCCCTGAAGGACTTTGGACTTTGTCTAACCTTACCATTCTTAATTTGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

976 aa · TkA04G238120|TK1151|PROTEIN

MFSQWGIAETAATTRGWNLSGDPCTGTAVDDSTNFNDGNFNPGIKCDCSFPNSTCHITALKVYALNARGTIPEGLWTLSNLTILNLAQNYLTGPLSPSIGNLTRMMYITISINSLSGPVPPEIGQLTELRLLSFSGNNFSGSLPPEIGNLRRLEQIYIDSAGVSGAIPSTFANLQNLQTVWASDNEFTGRLPDFIGNWSQLQTLRFEGNSFEGSIPPSFSRLTSMLELRISGLSNGTLDFIRDMKSLSVLMLRNNRFSGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G238120
TK1151 IDTkA04G238120
OH-1004 IDLXL04_039315
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G238120
位置Chr04:60459924-60468610 (+)
描述Similar to At1g56140: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g56140 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。 暂无已核实直接文献
At1g56130 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。 暂无已核实直接文献
At1g53440 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53440。 暂无已核实直接文献
At1g53430 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53430。 暂无已核实直接文献
At1g07650 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g07650。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039315 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0031667 response to nutrient levels 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0052542 defense response by callose deposition 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0033612 receptor serine/threonine kinase binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07650
ath:AT1G53430
ath:AT1G53440
ath:AT1G56130
ath:AT1G56140
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.806
排名 1 · TkA04G238120 · TK1151
内质网0.085
排名 2 · TkA04G238120 · TK1151
细胞质0.078
排名 3 · TkA04G238120 · TK1151
细胞核0.048
排名 4 · TkA04G238120 · TK1151
溶酶体／液泡0.041
排名 5 · TkA04G238120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598LRR_1469-133 aa
PF17467E7R76-111 aa
PF12799LRR_478-91 aa
PF13855LRR_879-139 aa
PF13516LRR_679-89 aa
PF00560LRR_180-102 aa
PF23598LRR_1480-182 aa
PF24141LRR_ComC90-144 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G238120PF23598LRR_14691332.7e-1969.9
TkA04G238120PF17467E7R761110.1213.3
TkA04G238120PF12799LRR_478911.3e-1351.4
TkA04G238120PF13855LRR_8791393.6e-1143.4
TkA04G238120PF13516LRR_679890.4511.4
TkA04G238120PF00560LRR_1801026e-2479.7
TkA04G238120PF23598LRR_14801822.7e-1969.9
TkA04G238120PF24141LRR_ComC901446.8e-0523.4
TkA04G238120PF00560LRR_11071266e-2479.7
TkA04G238120PF12799LRR_41271581.3e-1351.4
TkA04G238120PF24141LRR_ComC1282196.8e-0523.4
TkA04G238120PF00560LRR_11291506e-2479.7
TkA04G238120PF13516LRR_61291400.4511.4
TkA04G238120PF13855LRR_81512103.6e-1143.4
TkA04G238120PF00560LRR_11531746e-2479.7
TkA04G238120PF12799LRR_41711851.3e-1351.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGH3拟南芥sp|C0LGH3|Y5614_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5614061.700%Swiss-Prot中等置信
C0LGH2拟南芥sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5613060.200%Swiss-Prot中等置信
C0LGG9拟南芥sp|C0LGG9|Y5344_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5344047.400%Swiss-Prot中等置信
C0LGG8拟南芥sp|C0LGG8|Y5343_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5343048.500%Swiss-Prot中等置信
C0LGE0拟南芥sp|C0LGE0|Y1765_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0765046.000%Swiss-Prot中等置信

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