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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G140630
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 36384006-36384953 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

903 bp · TkA04G140630|TK1151|cDNA

ATGAAAGCTGATTTGGAATCGTTTTTAAAATCCGAACAGTACTATCACCGTCTCGGCCGTGTCTGGAAACGAAGTTATTTACTCTACGGTCCCTCCGGCACTGGAAAATCAAGCTTCATCGCCGGAATGGCGAAGTTTCTATGCTACGATATCTACGACGTTGACTTGTCCAAAATCGCCAACGATTCTGATCTGAAATTGCTTCTACTACAAACGACGAGAAGGTCAATGATCGTCGTTGAAGATTTAGACCGGTATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

903 bp · TkA04G140630|TK1151|CDS

ATGAAAGCTGATTTGGAATCGTTTTTAAAATCCGAACAGTACTATCACCGTCTCGGCCGTGTCTGGAAACGAAGTTATTTACTCTACGGTCCCTCCGGCACTGGAAAATCAAGCTTCATCGCCGGAATGGCGAAGTTTCTATGCTACGATATCTACGACGTTGACTTGTCCAAAATCGCCAACGATTCTGATCTGAAATTGCTTCTACTACAAACGACGAGAAGGTCAATGATCGTCGTTGAAGATTTAGACCGGTATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

300 aa · TkA04G140630|TK1151|PROTEIN

MKADLESFLKSEQYYHRLGRVWKRSYLLYGPSGTGKSSFIAGMAKFLCYDIYDVDLSKIANDSDLKLLLLQTTRRSMIVVEDLDRYLVEKSTALNLSGILSFMDGIISSCGEERVMIFTVSNKEQIDPTVLRPGRIDVHVQFPLCDFPAFKTLANSHLGIKEHKLFPQVEEIFQTGASLSPAEIGEIMIFNRGSPTRALKTVISALKSNNDTKVTVIASKPVSASKSEEPLRLTHSVSVGGPVGLPPRLMHSGSARTVEE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G140630
TK1151 IDTkA04G140630
OH-1004 IDLXL04_035378
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)95.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 69.231
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G140630
位置Chr04:36384006-36384953 (-)
描述Similar to At2g46620: AAA-ATPase At2g46620
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g46620 AAA-ATP酶 At2g46620。 暂无已核实直接文献
At5g17760 AAA-ATP酶 At5g17760。 暂无已核实直接文献
At5g17730 AAA-ATP酶 At5g17730。 暂无已核实直接文献
At3g50930 蛋白 HYPER-SENSITIVITY-RELATED 4。 暂无已核实直接文献
At3g50940 AAA-ATP酶 At3g50940。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035378 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G46620
ath:AT3G50940
ath:AT5G17730
ath:AT5G17740
ath:AT5G17760
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.428
排名 1 · TkA04G140630 · TK1151
细胞核0.374
排名 2 · TkA04G140630 · TK1151
细胞膜0.095
排名 3 · TkA04G140630 · TK1151
质体0.092
排名 4 · TkA04G140630 · TK1151
线粒体0.051
排名 5 · TkA04G140630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13191AAA_1615-48 aa
PF03215Rad1720-52 aa
PF00519PPV_E1_C21-51 aa
PF08298AAA_PrkA22-89 aa
PF12775AAA_723-51 aa
PF13479AAA_2424-51 aa
PF13555AAA_2924-48 aa
PF13401AAA_2224-57 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G140630PF13191AAA_1615480.002918.9
TkA04G140630PF03215Rad1720520.1912.4
TkA04G140630PF00519PPV_E1_C21510.05513.3
TkA04G140630PF08298AAA_PrkA22890.003917.0
TkA04G140630PF12775AAA_723510.1212.6
TkA04G140630PF13479AAA_2424510.001219.3
TkA04G140630PF13555AAA_2924480.005717.1
TkA04G140630PF13401AAA_2224570.06914.2
TkA04G140630PF20703nSTAND124440.1312.6
TkA04G140630PF25199nSTAND_NTPase524910.1912.3
TkA04G140630PF00004AAA261443.5e-1247.6
TkA04G140630PF05673DUF815261250.001218.7
TkA04G140630PF20720nSTAND3261220.008416.5
TkA04G140630PF00910RNA_helicase27870.02216.0
TkA04G140630PF07728AAA_527660.03215.0
TkA04G140630PF13238AAA_18271130.06614.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IJ77拟南芥sp|F4IJ77|AATP4_ARATH AAA-ATPase At2g4662059.300%Swiss-Prot高置信
Q9FN75拟南芥sp|Q9FN75|AATPI_ARATH AAA-ATPase At5g1776041.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FN78拟南芥sp|Q9FN78|AATPF_ARATH AAA-ATPase At5g1773042.100%Swiss-Prot中等置信
Q8VZG2拟南芥sp|Q8VZG2|HSR4_ARATH Protein HYPER-SENSITIVITY-RELATED 443.200%Swiss-Prot中等置信
Q147F9拟南芥sp|Q147F9|AATPC_ARATH AAA-ATPase At3g5094043.100%Swiss-Prot中等置信

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