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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G056890
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 15166882-15168817 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1852 bp · TkA04G056890|TK1151|cDNA

AAATATAATAGGGTTTACTTTTTATATAAAATATGGAAAGAGAGAATCCAAATTTAATACATATATACATAATCATATTGTCTTCTTGTTTTCGCACTTCACCATCTTACCACTTCTAACTTCAAATTCATGGCTGATTACCATGGCTACTTCACCATCTTTTCATGTGCCTGATCACCAGCATCTTATTCCGCTGGGTTTTATTCAAATCAATCGGCGCTAAATATCATCTTCCACCAAGTCCAATTGCCCTTCCGATC...

CDS

下载 CDS FASTA

813 bp · TkA04G056890|TK1151|CDS

ATGAAGAAGATAGTGACGTCACGGCTACTAAATGGGTCGACACTTGATTTGCTCCTTCCAATCAGGCACGATGAAATTTATCGTTTGATGAAATCAATATCTCAAAAAGCGGAAATTGGGAAGGCGGTGGATCTTGAAGGGGAGGTGGTGAAGCTCACAAACAATGTGATATCAAGAATGCTTATGGGAGAAAGATGTTCGGAAAAAGACGATGAAGCAGGAGAAATGAGGAAATTGGTTGCGGAAATGGCGGAGATTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

270 aa · TkA04G056890|TK1151|PROTEIN

MKKIVTSRLLNGSTLDLLLPIRHDEIYRLMKSISQKAEIGKAVDLEGEVVKLTNNVISRMLMGERCSEKDDEAGEMRKLVAEMAEIMGQFNLSNYIWFFKNLDFHGFGKKLNDIGRRFDELIERIMKEHEEARKQGIEEVKDLLNILLDISEDDTMEIKLTRENIKAFIMDIFTAGTDTSAITIQWALAELINHPNIMKKAVQEIDRVTGKERLLQESDIPNLPYLQAIIKETLRLHPAAPMVPRKSTEDCTVAGYHIPA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G056890
TK1151 IDTkA04G056890
OH-1004 IDLXL04_036311
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.148 / OH-1004 52.268
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G056890
位置Chr04:15166882-15168817 (+)
描述Similar to CYP93A1: 3,9-dihydroxypterocarpan 6A-monooxygenase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036311 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009813 flavonoid biosynthetic process 生物过程
GO:0051553 flavone biosynthetic process 生物过程
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
GO:0016712 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
GO:0016717 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with oxidation of a pair of donors resulting in the reduction of molecular oxygen to two molecules of water 分子功能
GO:0020037 heme binding 分子功能
GO:0033771 flavanone 2-hydroxylase activity 分子功能
GO:0047082 3,9-dihydroxypterocarpan 6a-monooxygenase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AAD39549
ag:BAA22423
gmx:100776878
gmx:100797067
gmx:100815706
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.924
排名 1 · TkA04G056890 · TK1151
细胞质0.046
排名 2 · TkA04G056890 · TK1151
细胞膜0.037
排名 3 · TkA04G056890 · TK1151
高尔基体0.025
排名 4 · TkA04G056890 · TK1151
线粒体0.022
排名 5 · TkA04G056890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067p4502-265 aa
PF17603DUF549918-56 aa
PF16104FPRL1_inhibitor25-42 aa
PF18312ScsC_N35-43 aa
PF28968PMD1-like41-86 aa
PF27494Y4lK71-87 aa
PF12646DUF378376-83 aa
PF00210Ferritin94-208 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G056890PF00067p45022653.2e-59201.6
TkA04G056890PF17603DUF549918560.01616.5
TkA04G056890PF16104FPRL1_inhibitor25420.1812.6
TkA04G056890PF18312ScsC_N35430.2711.7
TkA04G056890PF28968PMD1-like41860.0116.0
TkA04G056890PF27494Y4lK71870.007217.1
TkA04G056890PF12646DUF378376831.39.7
TkA04G056890PF00210Ferritin942080.006917.0
TkA04G056890PF17603DUF54991001480.01616.5
TkA04G056890PF16104FPRL1_inhibitor1071550.1812.6
TkA04G056890PF12646DUF37831141311.39.7
TkA04G056890PF28968PMD1-like1221440.0116.0
TkA04G056890PF27494Y4lK1632130.007217.1
TkA04G056890PF12646DUF37831721941.39.7
TkA04G056890PF18312ScsC_N1912040.2711.7
TkA04G056890PF16104FPRL1_inhibitor1972260.1812.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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