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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G029040
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 7650337-7653732 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2339 bp · TkA04G029040|TK1151|cDNA

CGGCTTTCGTTTTACTCGGTCAAAAACTGGTACTGTTAGTCAATCATTCCATTTATTAGTGGCTGCAGCTTTCGGTCTAGTCGTCGCTTGAATCTGCCATGGAAATTCTGCTATTTGACCAGATTACCAACGATTTTCTCTTATATTCATTCAAATTTTCTTCTTATTCCTCATCGGCATACGTTGCGACACCTTCCTGTTGAAGAAGATCGTCACTTCTCCACTATTCGATTCTTGAAAACCAAGGTTTTCTTGAATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1839 bp · TkA04G029040|TK1151|CDS

ATGGCACCGAGTACCATATCAATAGTTACAACATGTCTCTTCATTCTTTTATCTACCACCTTTACAAATGCCATCCAAAGTGACATCGATTGCCTCAGAGCCTTCAAATCCTCAATCGAAGATCCCGAAAACGTCTTAACTTCATGGGATTTCAACAACAACACCGAAGGATTCATCTGTAGATTTGCAGGCATCGAATGTTGGCATCCAGACGAAAGCAAAGTTCTCAATATAAAACTCCCGGATATGGGACTCAAAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

612 aa · TkA04G029040|TK1151|PROTEIN

MAPSTISIVTTCLFILLSTTFTNAIQSDIDCLRAFKSSIEDPENVLTSWDFNNNTEGFICRFAGIECWHPDESKVLNIKLPDMGLKGTLPLALQNCTSLTGLDLSSNNFFGNLPINMTKILGFVVTLDLSSNNFSGTIPETFSNCSYLNVLRLDNNRFSGQIPSDLRNLNRLKEFSVVNNRLFGQVPYFQNGTQVSYGGNPGLCGQSLSPCVVTVKKSNTGVIVGAAIGGATIAALGVGVGMVFFMRRVVRKRKDDDPDG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G029040
TK1151 IDTkA04G029040
OH-1004 IDLXL04_036691
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G029040
位置Chr04:7650337-7653732 (+)
描述Similar to At5g48380: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g48380
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48380 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶At5g48380。 暂无已核实直接文献
At1g27190 可能失活的受体激酶At1g27190。 暂无已核实直接文献
At3g28450 缺乏蛋白激酶活性且无法结合 ATP 类似物的假激酶。
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
At1g69990 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g69990。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036691 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
GO:1900425 negative regulation of defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27190
ath:AT1G69990
ath:AT3G28450
ath:AT5G48380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.882
排名 1 · TkA04G029040 · TK1151
内质网0.074
排名 2 · TkA04G029040 · TK1151
细胞质0.067
排名 3 · TkA04G029040 · TK1151
细胞核0.046
排名 4 · TkA04G029040 · TK1151
溶酶体／液泡0.021
排名 5 · TkA04G029040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_226-68 aa
PF00560LRR_184-96 aa
PF12799LRR_485-113 aa
PF13855LRR_892-108 aa
PF00560LRR_198-116 aa
PF00560LRR_1125-145 aa
PF13855LRR_8126-182 aa
PF12799LRR_4126-162 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G029040PF08263LRRNT_226688.8e-0936.2
TkA04G029040PF00560LRR_184966.2e-1037.9
TkA04G029040PF12799LRR_4851130.001219.7
TkA04G029040PF13855LRR_8921081.1e-0732.2
TkA04G029040PF00560LRR_1981166.2e-1037.9
TkA04G029040PF00560LRR_11251456.2e-1037.9
TkA04G029040PF13855LRR_81261821.1e-0732.2
TkA04G029040PF12799LRR_41261620.001219.7
TkA04G029040PF00560LRR_11481696.2e-1037.9
TkA04G029040PF12799LRR_41481810.001219.7
TkA04G029040PF00560LRR_11721876.2e-1037.9
TkA04G029040PF00069Pkinase2985707.7e-35121.3
TkA04G029040PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3005102.2e-37129.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ASS4拟南芥sp|Q9ASS4|Y5838_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g4838059.100%Swiss-Prot高置信
O04567拟南芥sp|O04567|Y1719_ARATH Probable inactive receptor kinase At1g2719048.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LSI9拟南芥sp|Q9LSI9|BIR2_ARATH Inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR248.400%Swiss-Prot中等置信
C0LGI5拟南芥sp|C0LGI5|Y1699_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6999046.200%Swiss-Prot中等置信

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