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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G026380
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 6915652-6918785 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2192 bp · TkA04G026380|TK1151|cDNA

CTTACGTCAACTTGATTTCTCTCGAAATATCCTGACCCTCCGTCACTTCCCCTTTCGAACTCTCTGGAATCCCTAACTTTCTCCCTACTTCTACTTACCATCTTCATATAAAATCCATTCGAACTTAATCCTACTTGCTGATCTTAACACGCCTATTTACCACTTCAATTTGCCCGTTTCTGAGAAAAATAACCCATCTTTAATCTTGTTCGAGAGAAAATGGATGAGGATTTCGATATTCCGGCAGCTGATGAGATGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1719 bp · TkA04G026380|TK1151|CDS

ATGGATGAGGATTTCGATATTCCGGCAGCTGATGAGATGAACGAGGAGTTCATGGATGATATTGAAGCTCCGGTGACTTTGAAGGTCGGAGAAGAGAAAGAAATCGGTAATCAAGGGTTGAAGAAGAAGCTTCTTAAGGAAGGTGAAGGTTGGGATACTCCTGAAAGTGGAGATGAGGTCGAAGTTCATTATACCGGAACGTTGCTCGACGGGACTCAATTTGATTCTAGTCGTGATAGGGGAACGCCATTTAAGTTCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

572 aa · TkA04G026380|TK1151|PROTEIN

MDEDFDIPAADEMNEEFMDDIEAPVTLKVGEEKEIGNQGLKKKLLKEGEGWDTPESGDEVEVHYTGTLLDGTQFDSSRDRGTPFKFTLGQGQVIKGWDLGIKTMKKGENALFTIPADLAYGEAGSPPTIPPNATLQFDVQLLSWVSVKDICKDGGIFKKIVKEGEKWENPKDLDEVLVNYEARLEDGTLVAKSDEVEFKVEDGHFCPALSKAVKTMKKGEKVILTVKPDYGFGEKGKPASGDEVSVSVPPNATLQITLEL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G026380
TK1151 IDTkA04G026380
OH-1004 IDLXL04_036743
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G026380
位置Chr04:6915652-6918785 (+)
描述Similar to FKBP62: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP62
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48570 PPIases 加速蛋白质折叠。
Involvement of Arabidopsis ROF2 (FKBP65) in thermotolerance.2010 · DOI: 10.1007/s11103-009-9561-3
Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase ROF2 modulates intracellular pH homeostasis in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.04921.x
Characterization of three Arabidopsis thaliana immunophilin genes involved in the plant defense response against Pseudomonas syringae.2014 · DOI: 10.1016/j.gene.2014.01.029
At3g25230 PPIases 加速蛋白质折叠。
Arabidopsis immunophilins ROF1 (AtFKBP62) and ROF2 (AtFKBP65) exhibit tissue specificity, are heat-stress induced, and bind HSP90.2007 · DOI: 10.1007/s11103-006-9085-z
Arabidopsis ROF1 (FKBP62) modulates thermotolerance by interacting with HSP90.1 and affecting the accumulation of HsfA2-regulated sHSPs.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03878.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036743 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0031111 negative regulation of microtubule polymerization or depolymerization 生物过程
GO:0070370 cellular heat acclimation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G25230
ath:AT5G48570
bta:508535
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.671
排名 1 · TkA04G026380 · TK1151
细胞核0.362
排名 2 · TkA04G026380 · TK1151
线粒体0.106
排名 3 · TkA04G026380 · TK1151
细胞膜0.102
排名 4 · TkA04G026380 · TK1151
内质网0.073
排名 5 · TkA04G026380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00254FKBP_C20-35 aa
PF23322PPIase_AIP41-117 aa
PF00254FKBP_C52-142 aa
PF17517IgGFc_binding59-94 aa
PF00254FKBP_C168-261 aa
PF23322PPIase_AIP276-352 aa
PF00254FKBP_C286-381 aa
PF17517IgGFc_binding290-386 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G026380PF00254FKBP_C20351.2e-85282.7
TkA04G026380PF23322PPIase_AIP411176.5e-0730.5
TkA04G026380PF00254FKBP_C521421.2e-85282.7
TkA04G026380PF17517IgGFc_binding59940.1112.5
TkA04G026380PF00254FKBP_C1682611.2e-85282.7
TkA04G026380PF23322PPIase_AIP2763526.5e-0730.5
TkA04G026380PF00254FKBP_C2863811.2e-85282.7
TkA04G026380PF17517IgGFc_binding2903860.1112.5
TkA04G026380PF25062ARM_TT21_N3944972.38.6
TkA04G026380PF07719TPR_24084301.1e-1144.6
TkA04G026380PF13432TPR_164084300.08214.1
TkA04G026380PF00515TPR_14094292e-1247.1
TkA04G026380PF13181TPR_84094307.8e-0832.6
TkA04G026380PF13414TPR_114094309.1e-0626.0
TkA04G026380PF13424TPR_124094299.3e-0523.3
TkA04G026380PF13174TPR_64094290.6311.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJL3拟南芥sp|Q9FJL3|FKB65_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP6574.000%Swiss-Prot高置信
Q38931拟南芥sp|Q38931|FKB62_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP6275.500%Swiss-Prot高置信

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