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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G021830
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 5541498-5543428 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1701 bp · TkA04G021830|TK1151|cDNA

ATGTTTTCATCCTTCACTAATCTTAAACATCTAAACCTCAAAACAAATGACATTTATGGTGGCATCCCACTTGAGATCAAGCATCTTTCTAAACTCACATTCCTCGATCTCTCCGGTAATCGTTTTTCTGGAATAATCCCGCCAGAAATAGGAATATTAACGAATCTCAACACCCTCCGATTAAACCAGAACCAATTTACCGGTTCAATCCCTACGTCTTTAGGAAATCTAACCAACTTGGTTTGTTTTCGTGCCGATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1701 bp · TkA04G021830|TK1151|CDS

ATGTTTTCATCCTTCACTAATCTTAAACATCTAAACCTCAAAACAAATGACATTTATGGTGGCATCCCACTTGAGATCAAGCATCTTTCTAAACTCACATTCCTCGATCTCTCCGGTAATCGTTTTTCTGGAATAATCCCGCCAGAAATAGGAATATTAACGAATCTCAACACCCTCCGATTAAACCAGAACCAATTTACCGGTTCAATCCCTACGTCTTTAGGAAATCTAACCAACTTGGTTTGTTTTCGTGCCGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

566 aa · TkA04G021830|TK1151|PROTEIN

MFSSFTNLKHLNLKTNDIYGGIPLEIKHLSKLTFLDLSGNRFSGIIPPEIGILTNLNTLRLNQNQFTGSIPTSLGNLTNLVCFRADDNKLFGYIPQELGKLVNLVNINVSFNFQKGPIPSTLGNLTNLSTLYLHQNNLSNPIPPSLGNLASLMVLSIYMNELSGRIPDELVIMKSLTVLMIGHNKLTGSLPVTLSNLTKLRILDVHENLLSGLIPPQLEKLELGNMNSLVEIYMVKNRLIGQIPNSLGNLRNLEYFVLHN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G021830
TK1151 IDTkA04G021830
OH-1004 IDLXL04_036830
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)82.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 29.859 / OH-1004 22.656
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G021830
位置Chr04:5541498-5543428 (-)
描述Similar to HCR9-0: Receptor-like protein Cf-9 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g47890 受体样蛋白 7。 暂无已核实直接文献
At2g15080 受体样蛋白 19。 暂无已核实直接文献
At4g13880 在根毛发育中起作用。
Uncovering genes and ploidy involved in the high diversity in root hair density, length and response to local scarce phosphate in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1371/journal.pone.0120604
At2g33060 类受体蛋白27。 暂无已核实直接文献
At3g23010 受体样蛋白 36。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036830 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G71400
ath:AT5G25910
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.839
排名 1 · TkA04G021830 · TK1151
内质网0.084
排名 2 · TkA04G021830 · TK1151
细胞质0.064
排名 3 · TkA04G021830 · TK1151
细胞核0.042
排名 4 · TkA04G021830 · TK1151
细胞外0.028
排名 5 · TkA04G021830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855LRR_82-42 aa
PF24141LRR_ComC2-96 aa
PF23598LRR_143-108 aa
PF24048LRR_NXF1-55-41 aa
PF12799LRR_46-41 aa
PF13516LRR_66-18 aa
PF00560LRR_17-29 aa
PF23952LRR_EndoS17-44 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G021830PF13855LRR_82422.1e-43146.6
TkA04G021830PF24141LRR_ComC2963.4e-0730.9
TkA04G021830PF23598LRR_1431089.2e-38130.6
TkA04G021830PF24048LRR_NXF1-55410.001319.1
TkA04G021830PF12799LRR_46411.5e-34118.0
TkA04G021830PF13516LRR_66180.0002521.5
TkA04G021830PF00560LRR_17296.8e-57177.8
TkA04G021830PF23952LRR_EndoS17446.77.7
TkA04G021830PF24758LRR_At5g5637022629.5e-0522.9
TkA04G021830PF25013LRR_Zer-126392.8e-0628.3
TkA04G021830PF23211LRR_LRWD126670.07113.5
TkA04G021830PF13516LRR_628430.0002521.5
TkA04G021830PF00560LRR_131516.8e-57177.8
TkA04G021830PF12799LRR_431671.5e-34118.0
TkA04G021830PF13855LRR_853902.1e-43146.6
TkA04G021830PF29252LRR_NLRC453890.799.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C699拟南芥sp|Q9C699|RLP7_ARATH Receptor-like protein 735.600%Swiss-Prot低置信
Q9ZUK3拟南芥sp|Q9ZUK3|RLP19_ARATH Receptor-like protein 1936.500%Swiss-Prot低置信
F4JTU7拟南芥sp|F4JTU7|RLP48_ARATH Receptor-like protein 4834.000%Swiss-Prot低置信
F4IUU1拟南芥sp|F4IUU1|RLP27_ARATH Receptor like protein 2734.000%Swiss-Prot低置信
Q1PEN0拟南芥sp|Q1PEN0|RLP36_ARATH Receptor-like protein 3635.600%Swiss-Prot低置信

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