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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G442730
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 110330018-110332301 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2002 bp · TkA03G442730|TK1151|cDNA

CGAAAATACGACCAGAAAATGTGGAAGCCATGGTTGCTTCAAATTGATGCAATCATGGCCATAATGCCGTCGTCATAGACCTTCGAGTATTTGTTGCCTTCATTCTTTGATTCTCCCGTTCGGATGAGACAACGTGACGCGCCGATCGATCTATAATCAATAACAACAAGATCAGGCCTGCGTCACGTTCATTGATCTCTCTGAAGCATCTTTTGAATCAGCTAGCGCCATGGATCCGAATCCGAGTCCACGGAAGATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1518 bp · TkA03G442730|TK1151|CDS

ATGGATCCGAATCCGAGTCCACGGAAGATGAGAATTCTTTCTTATGTTATGACAAAAATTCCTAGTTTCAAACGCCGGCAATTGCAGGAGCTTGAAAATGAAAAACAAATCCGGGCGTCTTATTTACCGGAAACCTATTCCGAACTCTCCGAACGTGAAACCTACACCGAACTCGCCGAACGTGTGGCTCATCTAACGGACGACGACATCCTCGCAACCATCCGTTCGGTCGTCGTCGAGGTCTCTCAGATACGATCCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

505 aa · TkA03G442730|TK1151|PROTEIN

MDPNPSPRKMRILSYVMTKIPSFKRRQLQELENEKQIRASYLPETYSELSERETYTELAERVAHLTDDDILATIRSVVVEVSQIRSVLNSLGERPDPEAVDSARVKLHEMESAFAQHLDEIAMSDSDAEEVEMRRKSAKREKQMFRALISLDEMHESYAKLLIVAERRLRKLYDTAKAAGKLNVLDRKASSVLPTIAEEVKEEMADILQDALMNGVERIDLSHRRLPFVPEAFGKLRTLVSLNLSSNKLTAIPDSVAGLV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G442730
TK1151 IDTkA03G442730
OH-1004 IDLXL04_030746
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)37.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.446 / OH-1004 92.241
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G442730
位置Chr03:110330018-110332301 (-)
描述Similar to PIRL1: Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g11330 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。
PIRL1 and PIRL9, encoding members of a novel plant-specific family of leucine-rich repeat proteins, are essential for differentiation of microspores into pollen.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1242-6
Effect of sporophytic PIRL9 genotype on post-meiotic expression of the Arabidopsis pirl1;pirl9 mutant pollen phenotype.2011 · DOI: 10.1007/s00425-010-1324-5
At5g05850 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。
PIRL1 and PIRL9, encoding members of a novel plant-specific family of leucine-rich repeat proteins, are essential for differentiation of microspores into pollen.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1242-6
Effect of sporophytic PIRL9 genotype on post-meiotic expression of the Arabidopsis pirl1;pirl9 mutant pollen phenotype.2011 · DOI: 10.1007/s00425-010-1324-5
At3g26500 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
At1g12970 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030746 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0055046 microgametogenesis 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G11330
ath:AT3G26500
ath:AT5G05850
dosa:Os02g0593600
dosa:Os04g0476700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.391
排名 1 · TkA03G442730 · TK1151
细胞核0.332
排名 2 · TkA03G442730 · TK1151
细胞膜0.250
排名 3 · TkA03G442730 · TK1151
高尔基体0.070
排名 4 · TkA03G442730 · TK1151
内质网0.065
排名 5 · TkA03G442730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598LRR_1417-87 aa
PF02514CobN-Mg_chel56-208 aa
PF20438SpoIVA_middle64-160 aa
PF09061Stirrup150-178 aa
PF24048LRR_NXF1-5168-185 aa
PF24758LRR_At5g56370206-268 aa
PF23286LRR_13213-268 aa
PF13855LRR_8217-272 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G442730PF23598LRR_1417871.1e-2694.2
TkA03G442730PF02514CobN-Mg_chel562083.95.8
TkA03G442730PF20438SpoIVA_middle641600.4811.3
TkA03G442730PF09061Stirrup1501780.01516.2
TkA03G442730PF24048LRR_NXF1-51681850.005417.1
TkA03G442730PF24758LRR_At5g563702062685.3e-0523.7
TkA03G442730PF23286LRR_132132685.9e-0626.9
TkA03G442730PF13855LRR_82172728e-2690.3
TkA03G442730PF12799LRR_42172533.1e-2175.6
TkA03G442730PF00560LRR_12172367.6e-1861.5
TkA03G442730PF14580LRR_92182970.4210.9
TkA03G442730PF23211LRR_LRWD12292721.4e-0732.1
TkA03G442730PF23598LRR_142323351.1e-2694.2
TkA03G442730PF13516LRR_62362500.0004720.7
TkA03G442730PF24048LRR_NXF1-52372730.005417.1
TkA03G442730PF12799LRR_42382763.1e-2175.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VYG9拟南芥sp|Q8VYG9|PIRL9_ARATH Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 952.300%Swiss-Prot高置信
Q9FFJ3拟南芥sp|Q9FFJ3|PIRL1_ARATH Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 151.100%Swiss-Prot高置信
Q9LRV8拟南芥sp|Q9LRV8|PIRL2_ARATH Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 234.300%Swiss-Prot低置信
Q8W4Q3拟南芥sp|Q8W4Q3|PIRL3_ARATH Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 350.500%Swiss-Prot高置信

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