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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G400870
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 99689817-99691295 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

708 bp · TkA03G400870|TK1151|cDNA

ATGCAATTGTGGAACCATATTGCTAATTGGATTGAGGAGCCGTTACCGACTTTTGTAGATGTGCATGAGATGTTTGAATGGGTGGATTCCAATGTTGTGGCAAACTTTCGTCGTATCGAAGAACTTATTTTGAAATGCAAGGAGATTGTCGGAGAAGAAGGTGAAAAAATCGACGATGAAGACTACGTGAATGATGCAGATCCAAGCATCCTTCGGTTCTTGCTTGCTAGCAGGGAGGAGGTTTCAAGCGAACAATTGCG...

CDS

下载 CDS FASTA

708 bp · TkA03G400870|TK1151|CDS

ATGCAATTGTGGAACCATATTGCTAATTGGATTGAGGAGCCGTTACCGACTTTTGTAGATGTGCATGAGATGTTTGAATGGGTGGATTCCAATGTTGTGGCAAACTTTCGTCGTATCGAAGAACTTATTTTGAAATGCAAGGAGATTGTCGGAGAAGAAGGTGAAAAAATCGACGATGAAGACTACGTGAATGATGCAGATCCAAGCATCCTTCGGTTCTTGCTTGCTAGCAGGGAGGAGGTTTCAAGCGAACAATTGCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

235 aa · TkA03G400870|TK1151|PROTEIN

MQLWNHIANWIEEPLPTFVDVHEMFEWVDSNVVANFRRIEELILKCKEIVGEEGEKIDDEDYVNDADPSILRFLLASREEVSSEQLRDDLLSMLVAGHETTVYVLTWIAYLLSKDPSSLKKAQEEVDRVLAGRNPTYEDIKNLKFLTRCINESMHLYPHPPVLIRRAKVVDELPGNYKVWERAEEFIPERFGLDGPVPNETNTDYKFILFSGGPRKYVGDQFAMKEAIVALAIFL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G400870
TK1151 IDTkA03G400870
OH-1004 IDLXL04_032601
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)85.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 83.830 / OH-1004 37.696
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G400870
位置Chr03:99689817-99691295 (+)
描述Similar to CYP97C1: Carotene epsilon-monooxygenase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g53130 含血红素的细胞色素 P450 参与叶黄素的生物合成。
Functional analysis of beta- and epsilon-ring carotenoid hydroxylases in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.011403
Elucidation of the beta-carotene hydroxylation pathway in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.07.055
The evolution and function of carotenoid hydroxylases in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp005
Over-expression of Arabidopsis thaliana carotenoid hydroxylases individually and in combination with a beta-carotene ketolase provides insight into in vivo functions.2010 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2009.10.011
A quadruple mutant of Arabidopsis reveals a β-carotene hydroxylation activity for LUT1/CYP97C1 and a regulatory role of xanthophylls on determination of the PSI/PSII ratio.2012 · DOI: 10.1186/1471-2229-12-50
At1g31800 含血红素的细胞色素 P450 参与叶黄素的生物合成。
Defining the primary route for lutein synthesis in plants: the role of Arabidopsis carotenoid beta-ring hydroxylase CYP97A3.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0511207103
Elucidation of the beta-carotene hydroxylation pathway in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.07.055
The evolution and function of carotenoid hydroxylases in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp005
At4g15110 含血红素的细胞色素 P450 可能参与叶黄素的生物合成。
Over-expression of Arabidopsis thaliana carotenoid hydroxylases individually and in combination with a beta-carotene ketolase provides insight into in vivo functions.2010 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2009.10.011

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032601 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016117 carotenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0016123 xanthophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0010291 beta-carotene 3-hydroxylase activity 分子功能
GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能
GO:0020037 heme binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31800
ath:AT3G53130
ath:AT4G15110
gmx:606504
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.568
排名 1 · TkA03G400870 · TK1151
细胞质0.142
排名 2 · TkA03G400870 · TK1151
过氧化物酶体0.115
排名 3 · TkA03G400870 · TK1151
线粒体0.061
排名 4 · TkA03G400870 · TK1151
溶酶体／液泡0.052
排名 5 · TkA03G400870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067p4502-175 aa
PF00067p450176-235 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G400870PF00067p45021756.7e-35121.5
TkA03G400870PF00067p4501762356.7e-35121.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6TBX7拟南芥sp|Q6TBX7|LUT1_ARATH Carotene epsilon-monooxygenase, chloroplastic73.100%Swiss-Prot高置信
Q93VK5拟南芥sp|Q93VK5|LUT5_ARATH Protein LUTEIN DEFICIENT 5, chloroplastic45.400%Swiss-Prot中等置信
O23365拟南芥sp|O23365|C97B3_ARATH Cytochrome P450 97B3, chloroplastic39.300%Swiss-Prot中等置信

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